Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00016
• Subject: XM_006540254.3
• Aligned Length: 2739
• Identities: 2470
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCC---CAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGG  71
            |||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||   ||||.|||..|||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGTGGACTACCACGCAGCGAACCAGGCGTACCAGTACGGCCCGAACAGCGGCGGCGGCAATGGCGCGGGTGG  74

Query   72  CGGGGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGG  145
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCGGAAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGATGACTGGGACCGGGACCTGCTGTTGGACCCGGCCTGGG  148

Query  146  AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAAC  219
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACAGCCTGGTGCAACTCTCATCTTCGGAAGGCTGGCACTCAGATCGAGAAT  222

Query  220  ATTGATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAA  293
            ||.||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||.||..||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  ATCGATGAGGACTTCAGGGATGGGCTCAAACTTATGCTTCTGTTGGAGGTCATTTCAGGGGAGCGTTTGCCTAA  296

Query  294  GCCGGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAG  367
            |||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  297  GCCAGAGCGGGGGAAGATGCGAGTGCACAAGATCAACAATGTAAACAAAGCCCTGGACTTCATCGCCAGCAAGG  370

Query  368  GCGTCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG  441
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGTCAAGCTGGTGTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGATGGCAATGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG  444

Query  442  ACCATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTG  515
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  445  ACCATCATCCTCAGATTTGCCATCCAGGACATCTCTGTGGAAGAGACCTCTGCTAAGGAAGGACTCCTCCTCTG  518

Query  516  GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTG  589
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  519  GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCATATAAAAACGTCAACGTCCAGAACTTCCATATCAGCTGGAAGGACGGGCTGG  592

Query  590  CCTTCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTC  663
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||
Sbjct  593  CCTTCAATGCACTCATCCACCGGCACAGGCCTGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGCGGAAGGATGATCCAGTC  666

Query  664  ACCAACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACAT  737
            ||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||
Sbjct  667  ACCAACCTAAACAATGCATTTGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGATATCCCCAAGATGTTGGATGCTGAGGATAT  740

Query  738  CGT--GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGG  809
            .||  |.||.|.|  .||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  741  TGTAGGCACTCTG--AGGCCAGATGAGAAGGCCATCATGACTTACGTGTCCTGCTTCTACCACGCCTTCTCGGG  812

Query  810  AGCGCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGA  883
            .||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct  813  GGCCCAGAAGGCTGAGACCGCTGCCAACCGGATCTGCAAGGTGCTGGCTGTGAACCAGGAAAATGAGCACCTGA  886

Query  884  TGGAGGACTACGAGAAG-CTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCG  956
            ||||.|||||.|| |.| ||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  TGGAAGACTATGA-ACGCCTGGCCAGTGATCTTCTAGAGTGGATTCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCG  959

Query  957  TGTGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGC  1030
            .|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct  960  GGTGCCTCAGAAGACCATCCAGGAAATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGAGACTATAGGCGTGTGCACAAGC  1033

Query 1031  CGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAAC  1104
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1034  CGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGTCAGCTGGAGATCAACTTCAACACACTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAAC  1107

Query 1105  CGGCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGC  1178
            |||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1108  CGGCCTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCCGACATCAACAATGGATGGCAGCACCTGGAGCAGGC  1181

Query 1179  TGAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGT  1252
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TGAGAAGGGCTATGAAGAATGGCTGCTGAATGAAATCCGTAGGCTGGAACGGCTTGACCACCTGGCAGAGAAGT  1255

Query 1253  TCCGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAG  1326
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1256  TCCGGCAGAAGGCTTCCATCCACGAGGCCTGGACTGATGGGAAGGAGGCCATGCTGAAGCAACGGGACTACGAG  1329

Query 1327  ACGGCCACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCA  1400
            ||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1330  ACAGCCACCCTGTCAGACATCAAAGCTCTGATCCGAAAACATGAGGCCTTTGAAAGTGACCTGGCTGCACACCA  1403

Query 1401  GGACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCA  1474
            ||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1404  GGACCGAGTGGAGCAGATTGCTGCAATTGCTCAGGAGCTCAACGAGCTGGACTACTATGACTCCCACAACGTCA  1477

Query 1475  ACACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTG  1548
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||...|||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1478  ACACACGGTGCCAGAAGATCTGCGACCAGTGGGATAACCTGGGCTCTCTGACACACAGTCGCAGGGAAGCCTTG  1551

Query 1549  GAGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAA  1622
            ||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1552  GAGAAAACAGAGAAACAGCTAGAGACCATCGACCAGCTACATTTGGAGTATGCCAAGCGGGCTGCACCCTTCAA  1625

Query 1623  CAACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCC  1696
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1626  CAACTGGATGGAGAGTGCCATGGAGGACCTGCAGGACATGTTCATCGTCCACACCATCGAGGAGATCGAGGGCC  1699

Query 1697  TGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATC  1770
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700  TGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCAGATGCTGACAGGGAGCGTGAGGCCATCCTGGCCATC  1773

Query 1771  CACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCAC  1844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1774  CACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAATCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAATCCCTACACCACTGTTAC  1847

Query 1845  CCCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGG  1918
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||
Sbjct 1848  CCCCCAGATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAGAGGGACCATGCACTCCTGGAGG  1921

Query 1919  AGCAGAGCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGG  1992
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||
Sbjct 1922  AGCAGAGCAAGCAGCAATCCAATGAGCACCTTCGCCGACAGTTCGCCAGCCAAGCCAATATGGTGGGGCCGTGG  1995

Query 1993  ATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCA  2066
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1996  ATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACTCTGGAAGACCAGCTGAGCCA  2069

Query 2067  CCTGAAGCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCA  2140
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  CCTGAAGCAGTACGAGCGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAGCCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCA  2143

Query 2141  TCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAG  2214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 2144  TCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTACACAATGGAGCATATCCGTGTGGGCTGGGAGCAG  2217

Query 2215  CTGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAG  2288
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2218  CTGCTCACGACCATTGCCCGCACCATCAATGAGGTGGAAAACCAGATCCTCACCCGAGATGCCAAGGGTATCAG  2291

Query 2289  CCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGCTGGGGCCCG  2362
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2292  CCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCATCCTTCAACCATTTTGACAAGGACCATGGCGGGGCACTGGGGCCTG  2365

Query 2363  AGGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGGCCGAGTTCAAC  2436
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2366  AGGAATTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTATGACGTGGAGAATGACCGGCAGGGTGATGCTGAGTTCAAC  2439

Query 2437  CGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCATGTCGCG  2510
            ||.||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct 2440  CGGATCATGAGTGTGGTTGATCCCAACCATAGTGGCCTCGTGACCTTCCAAGCCTTCATTGACTTCATGTCAAG  2513

Query 2511  GGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAGAACTTCA  2584
            |||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2514  GGAGACCACAGACACAGACACAGCTGATCAGGTCATCGCCTCCTTCAAGGTCCTGGCAGGAGACAAGAACTTCA  2587

Query 2585  TCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGCGCCATAC  2658
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2588  TCACTGCTGAGGAACTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGCACCCTAC  2661

Query 2659  CAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGAGCGACCT  2732
            |||||.|||||.||.|..||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct 2662  CAGGGGCCTGATGCTGCTCCTGGCGCCCTTGACTACAAGTCCTTCTCCACAGCCCTCTATGGGGAGAGCGACCT  2735

Query 2733  G  2733
            |
Sbjct 2736  G  2736