Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00024
- Subject:
- XM_011532489.1
- Aligned Length:
- 3558
- Identities:
- 3432
- Gaps:
- 126
Alignment
Query 1 ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC 74
Query 75 CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC 148
Query 149 CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC 222
Query 223 CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT 296
Query 297 CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC 370
Query 371 TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC 444
Query 445 GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT 518
Query 519 CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT 592
Query 593 GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCGTGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGCAGCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCGTGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGCAGCTG 666
Query 667 CTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTACATGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTACATGGC 740
Query 741 TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA 814
Query 815 GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG 888
Query 889 AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT 962
Query 963 CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG 1036
Query 1037 AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC 1110
Query 1111 TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT 1184
Query 1185 GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG 1258
Query 1259 TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG 1332
Query 1333 ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGG--------------------------------------------------- 1355
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGGCGGATCAAAGATTGAAGAAAGATTGTACTCCTGTGTCGTGGCTCCAACACT 1406
Query 1356 ---------------GCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGTGGAGC 1414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGGCTGAGATGGGAGCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGTGGAGC 1480
Query 1415 CAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCTCCAAG 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCTCCAAG 1554
Query 1489 CCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCTTCCTC 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCTTCCTC 1628
Query 1563 AAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCACGTCGG 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCACGTCGG 1702
Query 1637 AGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCC--------------------------------------------------- 1659
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGCTCTTCCCCACCACTCTGTCCCATCTGCCCCACTCACGCTGCCTCCCT 1776
Query 1660 ------CAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAGGACCTGGCTGACCGAGT 1727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGCTCACAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAGGACCTGGCTGACCGAGT 1850
Query 1728 GGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCTTGAGCGAGAGTCCGCCC 1801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCTTGAGCGAGAGTCCGCCC 1924
Query 1802 AAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGATGGAAACCCGCTACTCG 1875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGATGGAAACCCGCTACTCG 1998
Query 1876 GTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTCTGCACGGCCCTGGTCGA 1949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTCTGCACGGCCCTGGTCGA 2072
Query 1950 GATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGATTCTGCTCCTCATCCTGA 2023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGATTCTGCTCCTCATCCTGA 2146
Query 2024 CCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCTTCTCAACTTGGATTGAC 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCTTCTCAACTTGGATTGAC 2220
Query 2098 CGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATGGCAAATGTCGTGGACAT 2171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATGGCAAATGTCGTGGACAT 2294
Query 2172 GCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAACGGAGGGCAGCTGCCTGG 2245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAACGGAGGGCAGCTGCCTGG 2368
Query 2246 AGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGCTGGTGCAGGTCAGCCAC 2319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGCTGGTGCAGGTCAGCCAC 2442
Query 2320 ATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTCTATGCCTGGCGTCCCGT 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTCTATGCCTGGCGTCCCGT 2516
Query 2394 CTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTTAGAGCAGATGCAAGGAT 2467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTTAGAGCAGATGCAAGGAT 2590
Query 2468 TCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGA---CAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACTCTATGACGGTGATGGTG 2538
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGACAGCAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACTCTATGACGGTGATGGTG 2664
Query 2539 TTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGGACACTTTTCTTGTGGAA 2612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGGACACTTTTCTTGTGGAA 2738
Query 2613 GATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGCCTTGGTCACCAACATGT 2686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGCCTTGGTCACCAACATGT 2812
Query 2687 TGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGTATAGCCAGACGTATGAT 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGTATAGCCAGACGTATGAT 2886
Query 2761 GAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAGAGCATCAACAATGGTGG 2834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAGAGCATCAACAATGGTGG 2960
Query 2835 TATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGACAATCCCAAGTTCCGGG 2908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGACAATCCCAAGTTCCGGG 3034
Query 2909 TGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCCCCGATGTCAACACCAAT 2982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCCCCGATGTCAACACCAAT 3108
Query 2983 GGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTGGCTGACCTGGCCGACTT 3056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTGGCTGACCTGGCCGACTT 3182
Query 3057 CGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTTCATGCTGCGCATAGGCA 3130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTTCATGCTGCGCATAGGCA 3256
Query 3131 TGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACATCTGGGGCAATACAGTC 3204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACATCTGGGGCAATACAGTC 3330
Query 3205 AATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAAGAAACCCAAGTCATCCT 3278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 AATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAAGAAACCCAAGTCATCCT 3404
Query 3279 CCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGGGGAGCTGCTGACCTTCT 3352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGGGGAGCTGCTGACCTTCT 3478
Query 3353 TCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGCCCCACCAGGTGGTGGAC 3426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGCCCCACCAGGTGGTGGAC 3552
Query 3427 AACTCC 3432
||||||
Sbjct 3553 AACTCC 3558