Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00038
• Subject: NM_000646.2
• Aligned Length: 1532
• Identities: 1509
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  MGHSKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGYELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSLDWENPTERE  74
                 ...||..|           |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----MAPILSIN-----------LFIGYELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSLDWENPTERE  58

Query   75  DDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTLQTFLAKCLGPFDEWESRLR  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  DDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTLQTFLAKCLGPFDEWESRLR  132

Query  149  VAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLANQLELNPDFSRPNRKYTWNDVGQLVEKLKKEWNVICITDVVYNHTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  VAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLANQLELNPDFSRPNRKYTWNDVGQLVEKLKKEWNVICITDVVYNHTA  206

Query  223  ANSKWIQEHPECAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWRFSCDVAEGKYKEKGIPALIENDHHMNSIRKIIWEDIFPKL  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  ANSKWIQEHPECAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWRFSCDVAEGKYKEKGIPALIENDHHMNSIRKIIWEDIFPKL  280

Query  297  KLWEFFQVDVNKAVEQFRRLLTQENRRVTKSDPNQHLTIIQDPEYRRFGCTVDMNIALTTFIPHDKGPAAIEEC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  KLWEFFQVDVNKAVEQFRRLLTQENRRVTKSDPNQHLTIIQDPEYRRFGCTVDMNIALTTFIPHDKGPAAIEEC  354

Query  371  CNWFHKRMEELNSEKHRLINYHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKHPLVTRYFTFPFEEIDFSMEES  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  CNWFHKRMEELNSEKHRLINYHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKHPLVTRYFTFPFEEIDFSMEES  428

Query  445  MIHLPNKACFLMAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSEVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  MIHLPNKACFLMAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSEVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITAT  502

Query  519  YFQGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARNLQPNLYVVAELFTGSEDLDNVFVTRLGISSLIREAMSAYNSHEEGRL  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  YFQGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARNLQPNLYVVAELFTGSEDLDNVFVTRLGISSLIREAMSAYNSHEEGRL  576

Query  593  VYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTIVSMACCASGSTRGYDELVPH  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  VYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTIVSMACCASGSTRGYDELVPH  650

Query  667  QISVVSEERFYTKWNPEALPSNTGEVNFQSGIIAARCAISKLHQELGAKGFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIH  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  QISVVSEERFYTKWNPEALPSNTGEVNFQSGIIAARCAISKLHQELGAKGFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIH  724

Query  741  QSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEARTIERNTKPYRKDENSINGTPDITVEIREHIQLNE  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  QSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEARTIERNTKPYRKDENSINGTPDITVEIREHIQLNE  798

Query  815  SKIVKQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGSVIIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSPHFKSGSLAVDNADPIL  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  SKIVKQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGSVIIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSPHFKSGSLAVDNADPIL  872

Query  889  KIPFASLASRLTLAELNQILYRCESEEKEDGGGCYDIPNWSALKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCNNLRS  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  KIPFASLASRLTLAELNQILYRCESEEKEDGGGCYDIPNWSALKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCNNLRS  946

Query  963  GDWMIDYVSNRLISRSGTIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDTAWKQMSSFVQNGSTF  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  GDWMIDYVSNRLISRSGTIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDTAWKQMSSFVQNGSTF  1020

Query 1037  VKHLSLGSVQLCGVGKFPSLPILSPALMDVPYRLNEITKEKEQCCVSLAAGLPHFSSGIFRCWGRDTFIALRGI  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  VKHLSLGSVQLCGVGKFPSLPILSPALMDVPYRLNEITKEKEQCCVSLAAGLPHFSSGIFRCWGRDTFIALRGI  1094

Query 1111  LLITGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVPNGLDILKCPVSRMYP  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  LLITGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVPNGLDILKCPVSRMYP  1168

Query 1185  TDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQKHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEGFNITAGVDEETGFVYGGNRFNCGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  TDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQKHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEGFNITAGVDEETGFVYGGNRFNCGT  1242

Query 1259  WMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLSKSAVRWLLELSKKNIFPYHEVTVKRHGKAIKVSYDEWNRKIQ  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  WMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLSKSAVRWLLELSKKNIFPYHEVTVKRHGKAIKVSYDEWNRKIQ  1316

Query 1333  DNFEKLFHVSEDPSDLNEKHPNLVHKRGIYKDSYGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTTEKAWKALEIAEK  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  DNFEKLFHVSEDPSDLNEKHPNLVHKRGIYKDSYGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTTEKAWKALEIAEK  1390

Query 1407  KLLGPLGMKTLDPDDMVYCGIYDNALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSRLMGPETTAKTIVL  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  KLLGPLGMKTLDPDDMVYCGIYDNALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSRLMGPETTAKTIVL  1464

Query 1481  VKNVLSRHYVHLERSPWKGLPELTNENAQYCPFSCETQAWSIATILETLYDL  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465  VKNVLSRHYVHLERSPWKGLPELTNENAQYCPFSCETQAWSIATILETLYDL  1516