Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00038
• Subject: NM_001081326.1
• Aligned Length: 1532
• Identities: 1408
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  MGHSKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGYELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSLDWENPTERE  74
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Sbjct    1  MEHSKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGFELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPLPGEAFNREKFRSLDWENPTERE  74

Query   75  DDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTLQTFLAKCLGPFDEWESRLR  148
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DDSDKYCKLHLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRIGVDNHVLPLDCVTLQTFLAKCLGPFDEWESRLR  148

Query  149  VAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLANQLELNPDFSRPNRKYTWNDVGQLVEKLKKEWNVICITDVVYNHTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||...|||.||||||||||.|||..|||||||||||
Sbjct  149  VAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLADQLELNPDFSRPSKRYTWSDVGQLVEKLKREWNILCITDVVYNHTA  222

Query  223  ANSKWIQEHPECAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWRFSCDVAEGKYKEKGIPALIENDHHMNSIRKIIWEDIFPKL  296
            .|||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||.|||||||.|||.|||||||||||..
Sbjct  223  TNSKWILEHPESAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWHFSCDVADGKYREKGVPALIENDQHMNCIRKIIWEDIFPRI  296

Query  297  KLWEFFQVDVNKAVEQFRRLLTQENRRVTKSDPNQHLTIIQDPEYRRFGCTVDMNIALTTFIPHDKGPAAIEEC  370
            .|||||||||.||||||||||.|||||||||.|..||.|||||||||.||.|||..||.||||||.||||||||
Sbjct  297  QLWEFFQVDVHKAVEQFRRLLSQENRRVTKSEPKEHLKIIQDPEYRRRGCAVDMDTALATFIPHDNGPAAIEEC  370

Query  371  CNWFHKRMEELNSEKHRLINYHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKHPLVTRYFTFPFEEIDFSMEES  444
            ||||.||.||||||||.|...|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|...|.||.
Sbjct  371  CNWFRKRLEELNSEKHHLTSCHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKYPLVTRYFTFPFGEMALSAEEA  444

Query  445  MIHLPNKACFLMAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSEVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITAT  518
            .||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  LIHLPDKACFLMAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSDVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITAT  518

Query  519  YFQGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARNLQPNLYVVAELFTGSEDLDNVFVTRLGISSLIREAMSAYNSHEEGRL  592
            .|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  HFQGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARKLQPNLYVVAELFTGSEELDNIFVTRLGISSLIREAMSAYNSHEEGRL  592

Query  593  VYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTIVSMACCASGSTRGYDELVPH  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  593  VYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTVVSMACCASGSTRGYDELVPH  666

Query  667  QISVVSEERFYTKWNPEALPSNTGEVNFQSGIIAARCAISKLHQELGAKGFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIH  740
            |||||.||||||||||.|.|..||.||..||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  QISVVAEERFYTKWNPGASPADTGDVNVHSGIIAARCAINRLHQELGAKGFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIH  740

Query  741  QSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEARTIERNTKPYRKDENSINGTPDITVEIREHIQLNE  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|..|||.||||||.|
Sbjct  741  QSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEARTIERNTKPYKKDENSINGMPNMTVELREHIQLHE  814

Query  815  SKIVKQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGSVIIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSPHFKSGSLAVDNADPIL  888
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  815  SKIVRQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGSVIIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSSHFKSGSLAVDNADPIL  888

Query  889  KIPFASLASRLTLAELNQILYRCESEEKEDGGGCYDIPNWSALKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCNNLRS  962
            ||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  889  KIPFASIASKLTLAELNQVLYRCESEEQEDGGGCYDIPNWSSLKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCENLRS  962

Query  963  GDWMIDYVSNRLISRSGTIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDTAWKQMSSFVQNGSTF  1036
            |||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  963  GDWMIDYVSGRLISRSGSIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDVAWKQMSSFVQNGSTF  1036

Query 1037  VKHLSLGSVQLCGVGKFPSLPILSPALMDVPYRLNEITKEKEQCCVSLAAGLPHFSSGIFRCWGRDTFIALRGI  1110
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Sbjct 1037  VKHLSLGSVQMCGVGKCPCLPLLSPSLLDVPCRLNEITKEKEQCCASLAAGLPHFSSGLFRCWGRDTFIALRGM  1110

Query 1111  LLITGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVPNGLDILKCPVSRMYP  1184
            ||.||||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 1111  LLVTGRYLEARNIILAFASTLRHGLIPNLLGEGTYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCRTVPNGLDILKCPVSRMYP  1184

Query 1185  TDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQKHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEGFNITAGVDEETGFVYGGNRFNCGT  1258
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1185  TDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQRHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEGFNITAGIDEETGFVYGGNRFNCGT  1258

Query 1259  WMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLSKSAVRWLLELSKKNIFPYHEVTVKRHGKAIKVSYDEWNRKIQ  1332
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Sbjct 1259  WMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLCKSAVRWLLELSKKNIFPYHEVRVKRHGKVVAVSYDEWNRKIQ  1332

Query 1333  DNFEKLFHVSEDPSDLNEKHPNLVHKRGIYKDSYGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTTEKAWKALEIAEK  1406
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1333  NNFEKLFHVSEDPSDPNEKHPNLVHKRGIYKDSYGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTAEKAWKALEIAEK  1406

Query 1407  KLLGPLGMKTLDPDDMVYCGIYDNALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSRLMGPETTAKTIVL  1480
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Sbjct 1407  KLLGPLGMKTLDPDDMVYCGVYDNALDNDNYNLARGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSKMMGPETAAKTVFL  1480

Query 1481  VKNVLSRHYVHLERSPWKGLPELTNENAQYCPFSCETQAWSIATILETLYDL  1532
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Sbjct 1481  VKNVLSRHYVHLERSPWKGLPELTNENGQYCPFSCETQAWSMAVVLETLYDL  1532