Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00038
- Subject:
- XM_017000501.2
- Aligned Length:
- 4596
- Identities:
- 2856
- Gaps:
- 1740
Alignment
Query 1 ATGGGACACAGTAAACAGATTCGAATTTTACTTCTGAACGAAATGGAGAAACTGGAAAAGACCCTCTTCAGACT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGAACAAGGGTATGAGCTACAGTTCCGATTAGGCCCAACTTTACAGGGAAAAGCAGTTACCGTGTATACAAATT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACCCATTTCCTGGAGAAACATTTAATAGAGAAAAATTCCGTTCTCTGGATTGGGAAAATCCAACAGAAAGAGAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GATGATTCTGATAAATACTGTAAACTTAATCTGCAACAATCTGGTTCATTTCAGTATTATTTCCTTCAAGGAAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGAGAAAAGTGGTGGAGGTTACATAGTTGTGGACCCCATTTTACGTGTTGGTGCTGATAATCATGTGCTACCCT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGGACTGTGTTACTCTTCAGACATTTTTAGCTAAGTGTTTGGGACCTTTTGATGAATGGGAAAGCAGACTTAGG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTTGCAAAAGAATCAGGCTACAACATGATTCATTTTACCCCATTGCAGACTCTTGGACTATCTAGGTCATGCTA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CTCCCTTGCCAATCAGTTAGAATTAAATCCTGACTTTTCAAGACCTAATAGAAAGTATACCTGGAATGATGTTG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GACAGCTAGTGGAAAAATTAAAAAAGGAATGGAATGTTATTTGTATTACTGATGTTGTCTACAATCATACTGCT 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GCTAATAGTAAATGGATCCAGGAACATCCAGAATGTGCCTATAATCTTGTGAATTCTCCACACTTAAAACCTGC 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 CTGGGTCTTAGACAGAGCACTTTGGCGTTTCTCCTGTGATGTTGCAGAAGGGAAATACAAAGAAAAGGGAATAC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 CTGCTTTGATTGAAAATGATCACCATATGAATTCCATCCGAAAAATAATTTGGGAGGATATTTTTCCAAAGCTT 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 AAACTCTGGGAATTTTTCCAAGTAGATGTCAACAAAGCGGTTGAGCAATTTAGAAGACTTCTTACACAAGAAAA 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 TAGGCGAGTAACCAAGTCTGATCCAAACCAACACCTTACGATTATTCAAGATCCTGAATACAGACGGTTTGGCT 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 GTACTGTAGATATGAACATTGCACTAACGACTTTCATACCACATGACAAGGGGCCAGCAGCAATTGAAGAATGC 1110
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1111 TGTAATTGGTTTCATAAAAGAATGGAGGAATTAAATTCAGAGAAGCATCGACTCATTAACTATCATCAGGAACA 1184
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1185 GGCAGTTAATTGCCTTTTGGGAAATGTGTTTTATGAACGACTGGCTGGCCATGGTCCAAAACTAGGACCTGTCA 1258
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1259 CTAGAAAGCATCCTTTAGTTACCAGGTATTTTACTTTCCCATTTGAAGAGATAGACTTCTCCATGGAAGAATCT 1332
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1333 ATGATTCATCTGCCAAATAAAGCTTGTTTTCTGATGGCACACAATGGATGGGTAATGGGAGATGATCCTCTTCG 1406
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1407 AAACTTTGCTGAACCGGGTTCAGAAGTTTACCTAAGGAGAGAACTTATTTGCTGGGGAGACAGTGTTAAATTAC 1480
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1481 GCTATGGGAATAAACCAGAGGACTGTCCTTATCTCTGGGCACACATGAAAAAATACACTGAAATAACTGCAACT 1554
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1555 TATTTCCAGGGAGTACGTCTTGATAACTGCCACTCAACACCTCTTCACGTAGCTGAGTACATGTTGGATGCTGC 1628
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1629 TAGGAATTTGCAACCCAATTTATATGTAGTAGCTGAACTGTTCACAGGAAGTGAAGATCTGGACAATGTCTTTG 1702
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1703 TTACTAGACTGGGCATTAGTTCCTTAATAAGAGAGGCAATGAGTGCATATAATAGTCATGAAGAGGGCAGATTA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------ATGAGTGCATATAATAGTCATGAAGAGGGCAGATTA 36
Query 1777 GTTTACCGATATGGAGGAGAACCTGTTGGATCCTTTGTTCAGCCCTGTTTGAGGCCTTTAATGCCAGCTATTGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 37 GTTTACCGATATGGAGGAGAACCTGTTGGATCCTTTGTTCAGCCCTGTTTGAGGCCTTTAATGCCAGCTATTGC 110
Query 1851 ACATGCCCTGTTTATGGATATTACGCATGATAATGAGTGTCCTATTGTGCATAGATCAGCGTATGATGCTCTTC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111 ACATGCCCTGTTTATGGATATTACGCATGATAATGAGTGTCCTATTGTGCATAGATCAGCGTATGATGCTCTTC 184
Query 1925 CAAGTACTACAATTGTTTCTATGGCATGTTGTGCTAGTGGAAGTACAAGAGGCTATGATGAATTAGTGCCTCAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 CAAGTACTACAATTGTTTCTATGGCATGTTGTGCTAGTGGAAGTACAAGAGGCTATGATGAATTAGTGCCTCAT 258
Query 1999 CAGATTTCAGTGGTTTCTGAAGAACGGTTTTACACTAAGTGGAATCCTGAAGCATTGCCTTCAAACACAGGTGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 CAGATTTCAGTGGTTTCTGAAGAACGGTTTTACACTAAGTGGAATCCTGAAGCATTGCCTTCAAACACAGGTGA 332
Query 2073 AGTTAATTTCCAAAGCGGCATTATTGCAGCCAGGTGTGCTATCAGTAAACTTCATCAGGAGCTTGGAGCCAAGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 AGTTAATTTCCAAAGCGGCATTATTGCAGCCAGGTGTGCTATCAGTAAACTTCATCAGGAGCTTGGAGCCAAGG 406
Query 2147 GTTTTATTCAGGTGTATGTGGATCAAGTTGATGAAGACATAGTGGCAGTAACAAGACACTCACCTAGCATCCAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 GTTTTATTCAGGTGTATGTGGATCAAGTTGATGAAGACATAGTGGCAGTAACAAGACACTCACCTAGCATCCAT 480
Query 2221 CAGTCTGTTGTGGCTGTATCTAGAACTGCTTTCAGGAATCCCAAGACTTCATTTTACAGCAAGGAAGTGCCTCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CAGTCTGTTGTGGCTGTATCTAGAACTGCTTTCAGGAATCCCAAGACTTCATTTTACAGCAAGGAAGTGCCTCA 554
Query 2295 AATGTGCATCCCTGGCAAAATTGAAGAAGTAGTTCTTGAAGCTAGAACTATTGAGAGAAACACGAAACCTTATA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 AATGTGCATCCCTGGCAAAATTGAAGAAGTAGTTCTTGAAGCTAGAACTATTGAGAGAAACACGAAACCTTATA 628
Query 2369 GGAAGGATGAGAATTCAATCAATGGAACACCAGATATCACAGTAGAAATTAGAGAACATATTCAGCTTAATGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 GGAAGGATGAGAATTCAATCAATGGAACACCAGATATCACAGTAGAAATTAGAGAACATATTCAGCTTAATGAA 702
Query 2443 AGTAAAATTGTTAAACAAGCTGGAGTTGCCACAAAAGGGCCCAATGAATATATTCAAGAAATAGAATTTGAAAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 AGTAAAATTGTTAAACAAGCTGGAGTTGCCACAAAAGGGCCCAATGAATATATTCAAGAAATAGAATTTGAAAA 776
Query 2517 CTTGTCTCCAGGAAGTGTTATTATATTCAGAGTTAGTCTTGATCCACATGCACAAGTCGCTGTTGGAATTCTTC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 CTTGTCTCCAGGAAGTGTTATTATATTCAGAGTTAGTCTTGATCCACATGCACAAGTCGCTGTTGGAATTCTTC 850
Query 2591 GAAATCATCTGACACAATTCAGTCCTCACTTTAAATCTGGCAGCCTAGCTGTTGACAATGCAGATCCTATATTA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 GAAATCATCTGACACAATTCAGTCCTCACTTTAAATCTGGCAGCCTAGCTGTTGACAATGCAGATCCTATATTA 924
Query 2665 AAAATTCCTTTTGCTTCTCTTGCCTCCAGATTAACTTTGGCTGAGCTAAATCAGATCCTTTACCGATGTGAATC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 AAAATTCCTTTTGCTTCTCTTGCCTCCAGATTAACTTTGGCTGAGCTAAATCAGATCCTTTACCGATGTGAATC 998
Query 2739 AGAAGAAAAGGAAGATGGTGGAGGGTGCTATGACATACCAAACTGGTCAGCCCTTAAATATGCAGGTCTTCAAG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 AGAAGAAAAGGAAGATGGTGGAGGGTGCTATGACATACCAAACTGGTCAGCCCTTAAATATGCAGGTCTTCAAG 1072
Query 2813 GTTTAATGTCTGTATTGGCAGAAATAAGACCAAAGAATGACTTGGGGCATCCTTTTTGTAATAATTTGAGATCT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 GTTTAATGTCTGTATTGGCAGAAATAAGACCAAAGAATGACTTGGGGCATCCTTTTTGTAATAATTTGAGATCT 1146
Query 2887 GGAGATTGGATGATTGACTATGTCAGTAACCGGCTTATTTCACGATCAGGAACTATTGCTGAAGTTGGTAAATG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 GGAGATTGGATGATTGACTATGTCAGTAACCGGCTTATTTCACGATCAGGAACTATTGCTGAAGTTGGTAAATG 1220
Query 2961 GTTGCAGGCTATGTTCTTCTACCTGAAGCAGATCCCACGTTACCTTATCCCATGTTACTTTGATGCTATATTAA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221 GTTGCAGGCTATGTTCTTCTACCTGAAGCAGATCCCACGTTACCTTATCCCATGTTACTTTGATGCTATATTAA 1294
Query 3035 TTGGTGCATATACCACTCTTCTGGATACAGCATGGAAGCAGATGTCAAGCTTTGTTCAGAATGGTTCAACCTTT 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 TTGGTGCATATACCACTCTTCTGGATACAGCATGGAAGCAGATGTCAAGCTTTGTTCAGAATGGTTCAACCTTT 1368
Query 3109 GTGAAACACCTTTCATTGGGTTCAGTTCAACTGTGTGGAGTAGGAAAATTCCCTTCCCTGCCAATTCTTTCACC 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 GTGAAACACCTTTCATTGGGTTCAGTTCAACTGTGTGGAGTAGGAAAATTCCCTTCCCTGCCAATTCTTTCACC 1442
Query 3183 TGCCCTAATGGATGTACCTTATAGGTTAAATGAGATCACAAAAGAAAAGGAGCAATGTTGTGTTTCTCTAGCTG 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 TGCCCTAATGGATGTACCTTATAGGTTAAATGAGATCACAAAAGAAAAGGAGCAATGTTGTGTTTCTCTAGCTG 1516
Query 3257 CAGGCTTACCTCATTTTTCTTCTGGTATTTTCCGCTGCTGGGGAAGGGATACTTTTATTGCACTTAGAGGTATA 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517 CAGGCTTACCTCATTTTTCTTCTGGTATTTTCCGCTGCTGGGGAAGGGATACTTTTATTGCACTTAGAGGTATA 1590
Query 3331 CTGCTGATTACTGGACGCTATGTAGAAGCCAGGAATATTATTTTAGCATTTGCGGGTACCCTGAGGCATGGTCT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 CTGCTGATTACTGGACGCTATGTAGAAGCCAGGAATATTATTTTAGCATTTGCGGGTACCCTGAGGCATGGTCT 1664
Query 3405 CATTCCTAATCTACTGGGTGAAGGAATTTATGCCAGATACAATTGTCGGGATGCTGTGTGGTGGTGGCTGCAGT 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665 CATTCCTAATCTACTGGGTGAAGGAATTTATGCCAGATACAATTGTCGGGATGCTGTGTGGTGGTGGCTGCAGT 1738
Query 3479 GTATCCAGGATTACTGTAAAATGGTTCCAAATGGTCTAGACATTCTCAAGTGCCCAGTTTCCAGAATGTATCCT 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 GTATCCAGGATTACTGTAAAATGGTTCCAAATGGTCTAGACATTCTCAAGTGCCCAGTTTCCAGAATGTATCCT 1812
Query 3553 ACAGATGATTCTGCTCCTTTGCCTGCTGGCACACTGGATCAGCCATTGTTTGAAGTCATACAGGAAGCAATGCA 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 ACAGATGATTCTGCTCCTTTGCCTGCTGGCACACTGGATCAGCCATTGTTTGAAGTCATACAGGAAGCAATGCA 1886
Query 3627 AAAACACATGCAGGGCATACAGTTCCGAGAAAGGAATGCTGGTCCCCAGATAGATCGAAACATGAAGGACGAAG 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1887 AAAACACATGCAGGGCATACAGTTCCGAGAAAGGAATGCTGGTCCCCAGATAGATCGAAACATGAAGGACGAAG 1960
Query 3701 GTTTTAATATAACTGCAGGAGTTGATGAAGAAACAGGATTTGTTTATGGAGGAAATCGTTTCAATTGTGGCACA 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1961 GTTTTAATATAACTGCAGGAGTTGATGAAGAAACAGGATTTGTTTATGGAGGAAATCGTTTCAATTGTGGCACA 2034
Query 3775 TGGATGGATAAAATGGGAGAAAGTGACAGAGCTAGAAACAGAGGAATCCCAGCCACACCAAGAGATGGGTCTGC 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 TGGATGGATAAAATGGGAGAAAGTGACAGAGCTAGAAACAGAGGAATCCCAGCCACACCAAGAGATGGGTCTGC 2108
Query 3849 TGTGGAAATTGTGGGCCTGAGTAAATCTGCTGTTCGCTGGTTGCTGGAATTATCCAAAAAAAATATTTTCCCTT 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2109 TGTGGAAATTGTGGGCCTGAGTAAATCTGCTGTTCGCTGGTTGCTGGAATTATCCAAAAAAAATATTTTCCCTT 2182
Query 3923 ATCATGAAGTCACAGTAAAAAGACATGGAAAGGCTATAAAGGTCTCATATGATGAGTGGAACAGAAAAATACAA 3996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2183 ATCATGAAGTCACAGTAAAAAGACATGGAAAGGCTATAAAGGTCTCATATGATGAGTGGAACAGAAAAATACAA 2256
Query 3997 GACAACTTTGAAAAGCTATTTCATGTTTCCGAAGACCCTTCAGATTTAAATGAAAAGCATCCAAATCTGGTTCA 4070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 GACAACTTTGAAAAGCTATTTCATGTTTCCGAAGACCCTTCAGATTTAAATGAAAAGCATCCAAATCTGGTTCA 2330
Query 4071 CAAACGTGGCATATACAAAGATAGTTATGGAGCTTCAAGTCCTTGGTGTGACTATCAGCTCAGGCCTAATTTTA 4144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331 CAAACGTGGCATATACAAAGATAGTTATGGAGCTTCAAGTCCTTGGTGTGACTATCAGCTCAGGCCTAATTTTA 2404
Query 4145 CCATAGCAATGGTTGTGGCCCCTGAGCTCTTTACTACAGAAAAAGCATGGAAAGCTTTGGAGATTGCAGAAAAA 4218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2405 CCATAGCAATGGTTGTGGCCCCTGAGCTCTTTACTACAGAAAAAGCATGGAAAGCTTTGGAGATTGCAGAAAAA 2478
Query 4219 AAATTGCTTGGTCCCCTTGGCATGAAAACTTTAGATCCAGATGATATGGTTTACTGTGGAATTTATGACAATGC 4292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2479 AAATTGCTTGGTCCCCTTGGCATGAAAACTTTAGATCCAGATGATATGGTTTACTGTGGAATTTATGACAATGC 2552
Query 4293 ATTAGACAATGACAACTACAATCTTGCTAAAGGTTTCAATTATCACCAAGGACCTGAGTGGCTGTGGCCTATTG 4366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2553 ATTAGACAATGACAACTACAATCTTGCTAAAGGTTTCAATTATCACCAAGGACCTGAGTGGCTGTGGCCTATTG 2626
Query 4367 GGTATTTTCTTCGTGCAAAATTATATTTTTCCAGATTGATGGGCCCGGAGACTACTGCAAAGACTATAGTTTTG 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 GGTATTTTCTTCGTGCAAAATTATATTTTTCCAGATTGATGGGCCCGGAGACTACTGCAAAGACTATAGTTTTG 2700
Query 4441 GTTAAAAATGTTCTTTCCCGACATTATGTTCATCTTGAGAGATCCCCTTGGAAAGGACTTCCAGAACTGACCAA 4514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 GTTAAAAATGTTCTTTCCCGACATTATGTTCATCTTGAGAGATCCCCTTGGAAAGGACTTCCAGAACTGACCAA 2774
Query 4515 TGAGAATGCCCAGTACTGTCCTTTCAGCTGTGAAACACAAGCCTGGTCAATTGCTACTATTCTTGAGACACTTT 4588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2775 TGAGAATGCCCAGTACTGTCCTTTCAGCTGTGAAACACAAGCCTGGTCAATTGCTACTATTCTTGAGACACTTT 2848
Query 4589 ATGATTTA 4596
||||||||
Sbjct 2849 ATGATTTA 2856
