Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00063
• Subject: XM_006500870.3
• Aligned Length: 2430
• Identities: 2063
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGGCCTCAGAGGCTCGGGGTGGTCTGGGGGCCCCTCCGCTGCAGTCTGCCCGATCCCTGCCGGGCCCCGCCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCCTCAAGCACTTCCCGCTCGACCTGCGCACGTCTATGGATGGCAAATGCAAGGAGATCGCCGAGGAGCTGT  148
                                                 ||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct    1  -------------------------------------ATGGATGGCAAATGCAAGGAGATCGCTGAGGAGTTGT  37

Query  149  TCACCCGCTCACTGGCTGAGAGCGAGCTCCGTAGTGCCCCGTATGAGTTCCCCGAGGAGAGCCCCATTGAACAG  222
            |||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct   38  TCAGCCGCTCACTGGCTGAGAGTGAGCTTCGTAGCGCCCCTTATGAGTTCCCAGAGGAAAGCCCCATCGAGCAG  111

Query  223  CTGGAGGAGCGGCGGCAGCGGCTGGAGCGGCAGATCAGCCAGGATGTCAAGCTGGAGCCAGACATCCTGCTTCG  296
            ||.||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  112  CTAGAAGAACGGAGGCAGCGGCTGGAGCGCCAGATCAGCCAGGATGTCAAGCTGGAGCCAGATATTCTTCTTCG  185

Query  297  GGCCAAGCAAGATTTCCTGAAGACGGACAGTGACTCGGACCTACAGCTCTACAAGGAACAGGGTGAGGGGCAGG  370
            .|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  186  AGCCAAGCAAGATTTCCTGAAGACAGACAGCGACTCAGACTTACAGCTGTACAAGGAGCAAGGAGAGGGACAGG  259

Query  371  GTGACCGGAGCCTGCGGGAGCGTGATGTG---CTGGAACGGGAGTTTCAGCGGGTCACCATCTCTGGGGAGGAG  441
            |||||.||.|.||..||||.|||||||||   .||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  260  GTGACAGGGGTCTTTGGGAACGTGATGTGGTATTGGAACGGGAATTTCAGCGGGTCATCATCTCTGGGGAGGAG  333

Query  442  AAGTGTGGGGTGCCGTTCACAGACCTGCTGGATGCAGCCAAGAGTGTGGTGCGGGCGCTCTTCATCCGGGAGAA  515
            ||||||||||||||.|||||||||||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  334  AAGTGTGGGGTGCCATTCACAGACCTCTTAGACGCAGCCAAAAGTGTGGTTCGGGCACTTTTCATCCGGGAGAA  407

Query  516  GTACATGGCCCTGTCCCTGCAGAGCTTCTGCCCCACCACCCGCCGCTACCTGCAGCAGCTGGCTGAAAAGCCTC  589
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  408  GTACATGGCCCTATCACTGCAGAGCTTCTGTCCCACCACCCGCCGTTACCTGCAGCAGCTGGCTGAGAAGCCCC  481

Query  590  TGGAGACCCGGACCTATGAACAGGGCCCCGACACCCCTGTGTCTGCTGATGCCCCGGTGCACCCCCCTGCGCTG  663
            |||||||.||.||.|||||.|||.|.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  482  TGGAGACTCGAACTTATGAGCAGAGTCCTGATACCCCTGTATCTGCTGATGCCCCAGTGCATCCCCCTGCACTG  555

Query  664  GAGCAGCACCCGTATGAGCACTGTGAGCCAAGCACCATGCCTGGGGACCTGGGCTTGGGTCTGCGCATGGTGCG  737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  GAGCAGCACCCGTATGAGCACTGTGAGCCAAGCGCCATGCCTGGGGACCTGGGCTTGGGTCTGCGCATGGTGCG  629

Query  738  GGGTGTGGTGCACGTCTACACCCGCAGGGAACCCGACGAGCATTGCTCAGAGGTGGAGCTGCCATACCCTGACC  811
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||..|.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  630  TGGTGTGGTGCACGTCTACACCCGCAGGGACCCTGATGAGCACTGTCCGGAGGTGGAGCTTCCATACCCTGACC  703

Query  812  TGCAGGAATTTGTGGCTGACGTCAATGTGCTGATGGCCCTGATTATCAATGGCCCCATAAAGTCATTCTGCTAC  885
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  704  TACAGGAATTTGTAGCTGACGTCAATGTGCTGATGGCCCTGATCATCAATGGTCCCATAAAGTCATTCTGCTAC  777

Query  886  CGCCGGCTGCAGTACCTGAGCTCCAAGTTCCAGATGCATGTGCTACTCAATGAGATGAAGGAGCTGGCCGCCCA  959
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  778  CGCCGGCTGCAGTACCTGAGCTCCAAATTCCAGATGCACGTTTTGCTCAATGAGATGAAGGAGCTCGCTGCTCA  851

Query  960  GAAGAAAGTGCCACACCGAGATTTCTACAACATCCGCAAGGTGGACACCCACATCCATGCCTCGTCCTGCATGA  1033
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  852  GAAGAAAGTGCCACACCGGGACTTCTACAATATCCGTAAGGTGGACACACACATCCACGCCTCGTCCTGCATGA  925

Query 1034  ACCAGAAGCATCTGCTGCGCTTCATCAAGCGGGCAATGAAGCGGCACCTGGAGGAGATCGTGCACGTGGAGCAG  1107
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  926  ACCAGAAACATCTACTGCGCTTCATCAAGCGGGCCATGAAGCGGCACCTGGAGGAGATTGTGCATGTGGAACAG  999

Query 1108  GGCCGTGAACAGACGCTGCGGGAGGTCTTTGAGAGCATGAATCTCACGGCCTACGACCTGAGTGTGGACACGCT  1181
            |||||.||.|||||||||.|.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1000  GGCCGCGAGCAGACGCTGAGAGAAGTCTTCGAGAGCATGAACCTCACTGCCTACGACTTAAGTGTGGACACGCT  1073

Query 1182  GGATGTGCATGCGGACAGGAACACTTTCCATCGCTTTGACAAGTTTAATGCCAAATACAACCCTATTGGGGAGT  1255
            |||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  GGATGTGCATGCGGACAGGAATACCTTTCATCGATTTGACAAATTCAATGCCAAATACAACCCTATTGGGGAGT  1147

Query 1256  CCGTCCTCCGAGAGATCTTCATCAAGACGGACAACAGGGTATCTGGGAAGTACTTTGCTCACATCATCAAGGAG  1329
            |.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  CTGTTCTCCGAGAGATCTTCATTAAAACCGACAACAAGATTTCTGGGAAGTACTTTGCTCACATCATCAAGGAG  1221

Query 1330  GTGATGTCAGACCTGGAGGAGAGCAAATACCAGAATGCAGAGCTGCGGCTCTCCATTTACGGGCGCTCGAGGGA  1403
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1222  GTGATGGCAGACTTGGAGGAGAGCAAATACCAGAATGCAGAGCTCCGGCTGTCCATCTACGGGCGTTCGAGGGA  1295

Query 1404  TGAGTGGGACAAGCTGGCGCGCTGGGCCGTCATGCACCGCGTGCACTCCCCCAACGTGCGCTGGCTGGTGCAGG  1477
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.|..|||...||||||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1296  TGAGTGGGACAAGCTGGCACGCTGGGCAGTGAACCACAAAGTGCACTCTCCCAATGTCCGCTGGCTGGTGCAGG  1369

Query 1478  TGCCCCGCCTCTTTGATGTGTACCGTACCAAGGGCCAGCTGGCCAACTTCCAGGAGATGCTGGAGAACATCTTC  1551
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1370  TGCCCCGCCTCTTCGATGTGTACCGCACCAAGGGCCAGCTGGCCAACTTCCAAGAGATGCTGGAGAACATCTTT  1443

Query 1552  CTGCCACTGTTCGAGGCCACTGTGCACCCTGCCAGCCACCCGGAACTGCATCTCTTCTTAGAGCACGTGGATGG  1625
            |||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1444  CTGCCCCTGTTTGAGGCTACTGTGCACCCTGCCAGCCACCCGGAGCTGCACCTCTTTCTGGAGCACGTGGATGG  1517

Query 1626  TTTTGACAGCGTGGATGATGAGTCCAAGCCTGAAAACCATGTCTTCAACCTGGAGAGCCCCCTGCCTGAGGCGT  1699
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 1518  TTTTGATAGCGTGGATGATGAGTCCAAGCCAGAGAACCACGTCTTCAACCTGGAGAGTCCCCTCCCAGAAGCTT  1591

Query 1700  GGGTGGAGGAGGACAACCCACCCTATGCCTACTACCTGTACTACACCTTTGCCAACATGGCCATGTTGAACCAC  1773
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1592  GGGTGGAGGAGGACAACCCTCCCTATGCCTACTACCTGTACTACACCTTCGCTAACATGGCTATGTTGAACCAT  1665

Query 1774  CTGCGCAGGCAGAGGGGCTTCCACACGTTTGTGCTGAGGCCACACTGTGGGGAGGCTGGGCCCATCCACCACCT  1847
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1666  CTGCGCAGGCAGAGAGGTTTCCACACGTTCGTGCTGAGGCCGCACTGTGGGGAGGCCGGGCCCATCCACCACCT  1739

Query 1848  GGTGTCAGCCTTCATGCTGGCTGAGAACATTTCCCACGGGCTCCTTCTGCGCAAGGCCCCCGTCCTGCAGTACC  1921
            |||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740  GGTATCAGCCTTCATGCTGGCCGAGAACATCTCCCACGGGCTGCTCCTGCGCAAGGCCCCCGTCCTGCAGTACC  1813

Query 1922  TGTACTACCTGGCCCAGATCGGCATCGCCATGTCTCCGCTCAGCAACAACAGCCTCTTCCTCAGCTATCACCGG  1995
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1814  TGTATTACCTGGCTCAGATCGGCATCGCCATGTCCCCGCTCAGCAACAACAGCCTGTTCCTCAGCTACCACCGG  1887

Query 1996  AATCCGCTACCGGAGTACCTGTCCCGCGGCCTCATGGTCTCCCTGTCCACTGATGATCCCTTGCAGTTCCACTT  2069
            ||.||.||.||.||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888  AACCCTCTCCCTGAGTACTTGTCCCGTGGCCTCATGGTCTCGCTGTCCACAGATGATCCCTTGCAGTTCCACTT  1961

Query 2070  CACCA---------------------------------AGGAGCCGCTGATGGAGGAGTACAGCATCGCCACCC  2110
            |||||                                 |||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962  CACCAAGGTCAGACCCAGGCCAGCGGGCAGCCAAGGGCAGGAGCCCCTGATGGAGGAGTACAGCATCGCCACCC  2035

Query 2111  AGGTGTGGAAGCTCAGCTCCTGCGATATGTGTGAGCTGGCCCGCAACAGCGTGCTCATGAGCGGCTTCTCGCAC  2184
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2036  AGGTGTGGAAGCTCAGCTCCTGCGATATGTGCGAGCTGGCCCGTAACAGCGTGCTCATGAGTGGCTTCTCTCAC  2109

Query 2185  AAGGTAAAGAGCCACTGGCTGGGACCCAACTATACCAAGGAAGGCCCTGAGGGGAATGACATCCGCCGGACCAA  2258
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2110  AAGGTGAAAAGCCACTGGCTGGGACCCAACTATACCAAGGAGGGCCCTGAGGGCAATGATATCCGCCGTACCAA  2183

Query 2259  TGTGCCAGACATCCGCGTGGGCTACCGCTACGAGACCCTGTGCCAGGAGCTGGCGCTCATCACGCAGGCAGTCC  2332
            .||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2184  CGTGCCAGACATCCGAGTGGGCTACCGCTATGAGACGCTATGCCAGGAGCTGGCACTTATCACACAGGCCGTCC  2257

Query 2333  AGAGTGAGATGCTGGAGACCATTCCAGAGGAGGCGGGTATCACCATGAGCCCAGGGCCTCAA  2394
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||.||...||||||||||||||||   
Sbjct 2258  AAAGTGAGATGCTGGAGACCATCCCAGAGGAAGTGGGCATTGTCATGAGCCCAGGGCCT---  2316