Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00064
• Subject: NM_001025390.2
• Aligned Length: 2333
• Identities: 2316
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATG--GCC---CTGTCGTCCGAACCCGCTGAGATGCCGCGGCAGTTTCCCAAGCTGAACATCTCTGAAGTGGAT  69
            |||  |||   ||           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCCAGGCT-----------CAGCTGAGATGCCGCGGCAGTTTCCCAAGCTGAACATCTCTGAAGTGGAT  63

Query   70  GAGCAAGTCCGGCTCCTGGCGGAGAAGGTGTTTGCTAAAGTGCTCCGAGAAGAGGACAGCAAAGATGCCCTGTC  143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  GAGCAAGTCCGGCTCCTGGCGGAGAAGGTGTTTGCTAAAGTGCTCCGAGAAGAGGACAGCAAAGATGCCCTGTC  137

Query  144  CCTGTTCACTGTCCCAGAGGACTGCCCCATCGGGCAAAAGGAAGCCAAGGAGAGGGAGCTGCAGAAGGAGCTGG  217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  CCTGTTCACTGTCCCAGAGGACTGCCCCATCGGGCAAAAGGAAGCCAAGGAGAGGGAGCTGCAGAAGGAGCTGG  211

Query  218  CAGAGCAGAAGTCTGTGGAGACCGCAAAAAGAAAGAAAAGTTTCAAGATGATTCGGTCCCAGTCCCTGTCTCTG  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  CAGAGCAGAAGTCTGTGGAGACCGCAAAAAGAAAGAAAAGTTTCAAGATGATTCGGTCCCAGTCCCTGTCTCTG  285

Query  292  CAAATGCCGCCACAGCAAGATTGGAAGGGCCCCCCGGCAGCCAGTCCGGCCATGTCTCCCACAACCCCTGTGGT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  CAAATGCCGCCACAGCAAGATTGGAAGGGCCCCCCGGCAGCCAGTCCGGCCATGTCTCCCACAACCCCTGTGGT  359

Query  366  CACTGGAGCCACTTCCCTGCCCACGCCAGCACCCTATGCCATGCCTGAGTTCCAGCGGGTCACCATCAGCGGAG  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  CACTGGAGCCACTTCCCTGCCCACGCCAGCACCCTATGCCATGCCTGAGTTCCAGCGGGTCACCATCAGCGGAG  433

Query  440  ATTACTGTGCCGGGATCACTTTGGAGGACTATGAGCAGGCAGCCAAGAGTCTGGCCAAGGCCCTAATGATCCGG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  ATTACTGTGCCGGGATCACTTTGGAGGACTATGAGCAGGCAGCCAAGAGTCTGGCCAAGGCCCTAATGATCCGG  507

Query  514  GAGAAGTATGCGCGGCTCGCCTACCACCGCTTCCCGCGGATCACATCCCAGTACCTGGGTCATCCGCGGGCGGA  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  GAGAAGTATGCGCGGCTCGCCTACCACCGCTTCCCGCGGATCACATCCCAGTACCTGGGTCATCCGCGGGCGGA  581

Query  588  TACTGCACCTCCGGAAGAGGGCCTTCCAGACTTCCACCCTCCTCCACTGCCCCAGGAAGACCCCTACTGCCTGG  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  TACTGCACCTCCGGAAGAGGGCCTTCCAGACTTCCACCCTCCTCCACTGCCCCAGGAAGACCCCTACTGCCTGG  655

Query  662  ATGATGCACCCCCCAACCTGGATTACTTGGTCCACATGCAGGGGGGCATCCTCTTTGTGTATGATAACAAGAAG  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  ATGATGCACCCCCCAACCTGGATTACTTGGTCCACATGCAGGGGGGCATCCTCTTTGTGTATGATAACAAGAAG  729

Query  736  ATGCTGGAGCACCAGGAGCCGCACAGCCTACCCTACCCCGACCTGGAGACCTACACGGTGGACATGAGCCACAT  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  ATGCTGGAGCACCAGGAGCCGCACAGCCTACCCTACCCCGACCTGGAGACCTACACGGTGGACATGAGCCACAT  803

Query  810  CCTGGCTCTCATCACCGATGGCCCCACGAAAACCTATTGTCACCGGCGACTGAACTTTCTGGAATCCAAGTTCA  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  CCTGGCTCTCATCACCGATGGCCCCACGAAAACCTATTGTCACCGGCGACTGAACTTTCTGGAATCCAAGTTCA  877

Query  884  GCCTTCATGAGATGTTAAACGAAATGTCCGAGTTCAAAGAGTTGAAGAGTAACCCCCACCGGGACTTCTATAAC  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  GCCTTCATGAGATGTTAAACGAAATGTCCGAGTTCAAAGAGTTGAAGAGTAACCCCCACCGGGACTTCTATAAC  951

Query  958  GTGAGAAAGGTGGACACACACATCCATGCGGCCGCCTGCATGAACCAAAAGCATCTGCTGCGCTTCATCAAGCA  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  952  GTGAGAAAGGTGGACACACACATCCATGCGGCCGCCTGCATGAACCAAAAGCATCTGCTGCGCTTCATCAAGCA  1025

Query 1032  CACATACCAGACGGAGCCTGACAGGACTGTGGCAGAGAAGCGGGGCCGGAAGATCACCCTGCGGCAGGTGTTTG  1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  CACATACCAGACGGAGCCTGACAGGACTGTGGCAGAGAAGCGGGGCCGGAAGATCACCCTGCGGCAGGTGTTTG  1099

Query 1106  ACGGCCTGCACATGGACCCCTACGACCTCACTGTGGACTCACTGGATGTCCACGCGGGCCGGCAGACATTCCAC  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  ACGGCCTGCACATGGACCCCTACGACCTCACTGTGGACTCACTGGATGTCCACGCGGGCCGGCAGACATTCCAC  1173

Query 1180  CGCTTTGACAAGTTCAACTCCAAATACAACCCTGTGGGGGCCAGTGAGCTGCGTGACCTGTATTTGAAAACTGA  1253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  CGCTTTGACAAGTTCAACTCCAAATACAACCCTGTGGGGGCCAGTGAGCTGCGTGACCTGTATTTGAAAACTGA  1247

Query 1254  AAACTATCTGGGAGGAGAGTACTTTGCTCGGATGGTCAAGGAGGTTGCCCGGGAGCTGGAGGAGAGCAAGTACC  1327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  AAACTATCTGGGAGGAGAGTACTTTGCTCGGATGGTCAAGGAGGTTGCCCGGGAGCTGGAGGAGAGCAAGTACC  1321

Query 1328  AGTACTCAGAGCCACGGCTCTCCATCTACGGCCGCAGTCCTGAGGAGTGGCCCAACCTGGCCTACTGGTTCATC  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  AGTACTCAGAGCCACGGCTCTCCATCTACGGCCGCAGTCCTGAGGAGTGGCCCAACCTGGCCTACTGGTTCATC  1395

Query 1402  CAGCACAAGGTCTACTCTCCCAACATGCGCTGGATCATCCAGGTGCCCCGGATTTATGACATATTTAGGTCAAA  1475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  CAGCACAAGGTCTACTCTCCCAACATGCGCTGGATCATCCAGGTGCCCCGGATTTATGACATATTTAGGTCAAA  1469

Query 1476  GAAGCTGCTGCCAAACTTTGGGAAGATGCTGGAGAACATCTTCCTGCCCCTTTTCAAGGCCACTATCAACCCCC  1549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  GAAGCTGCTGCCAAACTTTGGGAAGATGCTGGAGAACATCTTCCTGCCCCTTTTCAAGGCCACTATCAACCCCC  1543

Query 1550  AAGATCATCGAGAGCTTCACCTCTTCCTTAAATATGTGACGGGGTTTGACAGCGTGGATGATGAGTCCAAGCAC  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  AAGATCATCGAGAGCTTCACCTCTTCCTTAAATATGTGACGGGGTTTGACAGCGTGGATGATGAGTCCAAGCAC  1617

Query 1624  AGCGACCACATGTTTTCCGACAAGAGCCCAAACCCGGACGTCTGGACCAGTGAGCAGAACCCACCCTACAGCTA  1697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  AGCGACCACATGTTTTCCGACAAGAGCCCAAACCCGGACGTCTGGACCAGTGAGCAGAACCCACCCTACAGCTA  1691

Query 1698  CTACCTGTACTACATGTATGCCAACATCATGGTGCTCAACAACCTCCGCAGGGAGCGCGGCCTGAGCACGTTCC  1771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692  CTACCTGTACTACATGTATGCCAACATCATGGTGCTCAACAACCTCCGCAGGGAGCGCGGCCTGAGCACGTTCC  1765

Query 1772  TGTTCCGGCCGCACTGTGGGGAAGCCGGCTCCATCACCCACCTGGTGTCTGCCTTCCTCACTGCTGACAACATT  1845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  TGTTCCGGCCGCACTGTGGGGAAGCCGGCTCCATCACCCACCTGGTGTCTGCCTTCCTCACTGCTGACAACATT  1839

Query 1846  TCCCACGGGCTGCTCCTCAAGAAGAGTCCGGTATTGCAGTATCTCTACTACCTTGCTCAGATCCCCATTGCCAT  1919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  TCCCACGGGCTGCTCCTCAAGAAGAGTCCGGTATTGCAGTATCTCTACTACCTTGCTCAGATCCCCATTGCCAT  1913

Query 1920  GTCTCCTCTTAGCAACAACAGTTTGTTCCTCGAATATTCCAAGAACCCTCTGAGGGAATTCCTACACAAGGGAC  1993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914  GTCTCCTCTTAGCAACAACAGTTTGTTCCTCGAATATTCCAAGAACCCTCTGAGGGAATTCCTACACAAGGGAC  1987

Query 1994  TGCATGTTTCTCTTTCCACCGATGACCCCATGCAGTTCCACTACACGAAGGAAGCACTTATGGAAGAATATGCC  2067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988  TGCATGTTTCTCTTTCCACCGATGACCCCATGCAGTTCCACTACACGAAGGAAGCACTTATGGAAGAATATGCC  2061

Query 2068  ATTGCAGCTCAAGTGTGGAAGCTGAGCACCTGCGACCTGTGTGAGATCGCCAGGAACAGCGTGCTGCAGAGCGG  2141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062  ATTGCAGCTCAAGTGTGGAAGCTGAGCACCTGCGACCTGTGTGAGATCGCCAGGAACAGCGTGCTGCAGAGCGG  2135

Query 2142  CCTCTCGCATCAGGAAAAGCAAAAGTTTCTGGGACAAAATTATTATAAAGAAGGACCTGAAGGAAATGATATTC  2215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136  CCTCTCGCATCAGGAAAAGCAAAAGTTTCTGGGACAAAATTATTATAAAGAAGGACCTGAAGGAAATGATATTC  2209

Query 2216  GAAAGACAAATGTGGCTCAGATCCGGATGGCATTCCGATATGAGACCTTATGCAATGAGCTCAGCTTCCTGTCT  2289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210  GAAAGACAAATGTGGCTCAGATCCGGATGGCATTCCGATATGAGACCTTATGCAATGAGCTCAGCTTCCTGTCT  2283

Query 2290  GATGCTATGAAATCAGAAGAGATCACCGCCTTGACCAAC  2328
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2284  GATGCTATGAAATCAGAAGAGATCACCGCCTTGACCAAC  2322