Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00069
• Subject: NM_001320702.2
• Aligned Length: 963
• Identities: 711
• Gaps: 252

Alignment

Query   1  ATGGCCATGGCAACCAAAGGAGGTACTGTCAAAGCTGCTTCAGGATTCAATGCCATGGAAGATGCCCAGACCCT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GAGGAAGGCCATGAAAGGGCTCGGCACCGATGAAGACGCCATTATTAGCGTCCTTGCCTACCGCAACACCGCCC  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  AGCGCCAGGAGATCAGGACAGCCTACAAGAGCACCATCGGCAGGGACTTGATAGACGACCTGAAGTCAGAACTG  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  AGTGGCAACTTCGAGCAGGTGATTGTGGGGATGATGACGCCCACGGTGCTGTATGACGTGCAAGAGCTGCGAAG  296
                                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------ATGATGACGCCCACGGTGCTGTATGACGTGCAAGAGCTGCGAAG  44

Query 297  GGCCATGAAGGGAGCCGGCACTGATGAGGGCTGCCTAATTGAGATCCTGGCCTCCCGGACCCCTGAGGAGATCC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  45  GGCCATGAAGGGAGCCGGCACTGATGAGGGCTGCCTAATTGAGATCCTGGCCTCCCGGACCCCTGAGGAGATCC  118

Query 371  GGCGCATAAGCCAAACCTACCAGCAGCAATATGGACGGAGCCTTGAAGATGACATTCGCTCTGACACATCGTTC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119  GGCGCATAAGCCAAACCTACCAGCAGCAATATGGACGGAGCCTTGAAGATGACATTCGCTCTGACACATCGTTC  192

Query 445  ATGTTCCAGCGAGTGCTGGTGTCTCTGTCAGCTGGTGGGAGGGATGAAGGAAATTATCTGGACGATGCTCTCGT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193  ATGTTCCAGCGAGTGCTGGTGTCTCTGTCAGCTGGTGGGAGGGATGAAGGAAATTATCTGGACGATGCTCTCGT  266

Query 519  GAGACAGGATGCCCAGGACCTGTATGAGGCTGGAGAGAAGAAATGGGGGACAGATGAGGTGAAATTTCTAACTG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267  GAGACAGGATGCCCAGGACCTGTATGAGGCTGGAGAGAAGAAATGGGGGACAGATGAGGTGAAATTTCTAACTG  340

Query 593  TTCTCTGTTCCCGGAACCGAAATCACCTGTTGCATGTGTTTGATGAATACAAAAGGATATCACAGAAGGATATT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341  TTCTCTGTTCCCGGAACCGAAATCACCTGTTGCATGTGTTTGATGAATACAAAAGGATATCACAGAAGGATATT  414

Query 667  GAACAGAGTATTAAATCTGAAACATCTGGTAGCTTTGAAGATGCTCTGCTGGCTATAGTAAAGTGCATGAGGAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415  GAACAGAGTATTAAATCTGAAACATCTGGTAGCTTTGAAGATGCTCTGCTGGCTATAGTAAAGTGCATGAGGAA  488

Query 741  CAAATCTGCATATTTTGCTGAAAAGCTCTATAAATCGATGAAGGGCTTGGGCACCGATGATAACACCCTCATCA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489  CAAATCTGCATATTTTGCTGAAAAGCTCTATAAATCGATGAAGGGCTTGGGCACCGATGATAACACCCTCATCA  562

Query 815  GAGTGATGGTTTCTCGAGCAGAAATTGACATGTTGGATATCCGGGCACACTTCAAGAGACTCTATGGAAAGTCT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563  GAGTGATGGTTTCTCGAGCAGAAATTGACATGTTGGATATCCGGGCACACTTCAAGAGACTCTATGGAAAGTCT  636

Query 889  CTGTACTCGTTCATCAAGGGTGACACATCTGGAGACTACAGGAAAGTACTGCTTGTTCTCTGTGGAGGAGATGA  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637  CTGTACTCGTTCATCAAGGGTGACACATCTGGAGACTACAGGAAAGTACTGCTTGTTCTCTGTGGAGGAGATGA  710

Query 963  T  963
           |
Sbjct 711  T  711