Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00098
- Subject:
- NM_007482.3
- Aligned Length:
- 972
- Identities:
- 808
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGAGCGCCAAGTCCAGAA--CCATAGGGATTATTGGAGCTCCTTTCTCAAAGGGACAGCCACGAGGAGGGGTG 72
||||||.||||| ||| || ||.|||.||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1 ATGAGCTCCAAG-CCA-AAGTCCTTAGAGATTATCGGAGCGCCTTTCTCAAAAGGACAGCCTCGAGGAGGGGTA 72
Query 73 GAAGAAGGCCCTACAGTATTGAGAAAGGCTGGTCTGCTTGAGAAACTTAAAGAACAAGAGTGTGATGTGAAGGA 146
||..||||||||.|||.|.||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||..|||||.|||.||||..||
Sbjct 73 GAGAAAGGCCCTGCAGCACTGAGGAAAGCTGGTCTGCTGGAAAAACTTAAAGAAACAGAGTATGACGTGAGAGA 146
Query 147 TTATGGGGACCTGCCCTTTGCTGACATCCCTAATGACAGTCCCTTTCAAATTGTGAAGAATCCAAGGTCTGTGG 220
..|.|||||||||.||||||.|||..|||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 147 CCACGGGGACCTGGCCTTTGTTGATGTCCCTAATGACAGCTCCTTTCAAATTGTGAAGAACCCACGGTCTGTGG 220
Query 221 GAAAAGCAAGCGAGCAGCTGGCTGGCAAGGTGGCAGAAGTCAAGAAGAACGGAAGAATCAGCCTGGTGCTGGGC 294
|.|||||.|..||..||||||||||...|||||||||.|||.|||||||.||||||.||||..||||||||||.
Sbjct 221 GGAAAGCCAATGAAGAGCTGGCTGGTGTGGTGGCAGAGGTCCAGAAGAATGGAAGAGTCAGTGTGGTGCTGGGT 294
Query 295 GGAGACCACAGTTTGGCAATTGGAAGCATCTCTGGCCATGCCAGGGTCCACCCTGATCTTGGAGTCATCTGGGT 368
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||..|.|||||.|||||
Sbjct 295 GGAGACCACAGTCTGGCAGTTGGAAGCATCTCTGGCCACGCCAGGGTCCACCCTGACCTATGTGTCATTTGGGT 368
Query 369 GGATGCTCACACTGATATCAACACTCCACTGACAACCACAAGTGGAAACTTGCATGGACAACCTGTATCTTTCC 442
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||....|||.||..|||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 369 GGATGCTCACACTGACATCAACACTCCCCTGACAACCAGCTCTGGGAATCTGCATGGGCAACCTGTGTCCTTTC 442
Query 443 TCCTGAAGGAACTAAAAGGAAAGATTCCC-GATGTGCCAGGATTCTCCTGGGTGACTCCCTGTATATCTGCCAA 515
|||||||||||||.||||||||| ||||| |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 443 TCCTGAAGGAACTGAAAGGAAAG-TTCCCAGATGTACCAGGATTCTCCTGGGTGACTCCCTGCATATCTGCCAA 515
Query 516 GGATATTGTGTATATTGGCTTGAGAGACGTGGACCCTGGGGAACACTACATTTTGAAAACTCTAGGCATTAAAT 589
.||.||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||..|.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 516 AGACATCGTGTACATTGGCTTGCGAGACGTAGACCCTGGGGAACACTATATAATAAAAACTCTGGGAATTAAGT 589
Query 590 ACTTTTCAATGACTGAAGTGGACAGACTAGGAATTGGCAAGGTGATGGAAGAAACACTCAGCTATCTACTAGGA 663
|.||.||.|||||||||||.||||..||.||.||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||.|||
Sbjct 590 ATTTCTCCATGACTGAAGTAGACAAGCTGGGGATTGGCAAGGTGATGGAAGAGACCTTCAGCTACCTGCTGGGA 663
Query 664 AGAAAGAAAAGGCCAATTCATCTAAGTTTTGATGTTGACGGACTGGACCCATCTTTCACACCAGCTACTGGCAC 737
||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.||.||.|||||
Sbjct 664 AGGAAGAAAAGGCCGATTCACCTGAGCTTTGATGTCGACGGGCTGGACCCAGCATTCACCCCGGCGACCGGCAC 737
Query 738 ACCAGTCGTGGGAGGTCTGACATACAGAGAAGGTCTCTACATCACAGAAGAAATCTACAAAACAGGGCTACTCT 811
.||.||..|||||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 738 CCCGGTTCTGGGAGGCCTATCTTACAGAGAAGGTCTCTACATCACAGAAGAAATTTACAAGACAGGGCTCCTTT 811
Query 812 CAGGATTAGATATAATGGAAGTGAACCCATCCCTGGGGAAGACACCAGAAGAAGTAACTCGAACAGTGAACACA 885
|||||.|||||||.|||||||||||||||.|.||.|||||||||.||||.||.||.|...|.||.||||||||.
Sbjct 812 CAGGACTAGATATCATGGAAGTGAACCCAACTCTTGGGAAGACAGCAGAGGAGGTGAAGAGTACTGTGAACACG 885
Query 886 GCAGTTGCAATAACCTTGGCTTGTTTCGGACTTGCTCGGGAGGGTAATCACAAGCC---TATTGACTACCTTAA 956
|||||.||..|||||||||||||.||||||..|...|||||||||||.||.||||| .|.||||||||||||
Sbjct 886 GCAGTGGCTTTAACCTTGGCTTGCTTCGGAACTCAACGGGAGGGTAACCATAAGCCAGGGACTGACTACCTTAA 959
Query 957 CCCACCTAAG 966
.|||||||||
Sbjct 960 ACCACCTAAG 969