Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00106
• Subject: NM_020251.4
• Aligned Length: 1254
• Identities: 1230
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGGCGACAAAGGGACCCGAGTGTTCAAGAAGGCCAGTCCAAATGGAAAGCTCACCGTCTACCTGGGAAAGCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGACAAAGGGACCCGAGTGTTCAAGAAGGCCAGTCCAAATGGAAAGCTCACCGTCTACCTGGGAAAGCG  74

Query   75  GGACTTTGTGGACCACATCGACCTCGTGGACCCTGTGGATGGTGTGGTCCTGGTGGATCCTGAGTATCTCAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACTTTGTGGACCACATCGACCTCGTGGACCCTGTGGATGGTGTGGTCCTGGTGGATCCTGAGTATCTCAAAG  148

Query  149  AGCGGAGAGTCTATGTGACGCTGACCTGCGCCTTCCGCTATGGCCGGGAGGACCTGGATGTCCTGGGCCTGACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCGGAGAGTCTATGTGACGCTGACCTGCGCCTTCCGCTATGGCCGGGAGGACCTGGATGTCCTGGGCCTGACC  222

Query  223  TTTCGCAAGGACCTGTTTGTGGCCAACGTACAGTCGTTCCCACCGGCCCCCGAGGACAAGAAGCCCCTGACGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTCGCAAGGACCTGTTTGTGGCCAACGTACAGTCGTTCCCACCGGCCCCCGAGGACAAGAAGCCCCTGACGCG  296

Query  297  GCTGCAGGAACGCCTCATCAAGAAGCTGGGCGAGCACGCTTACCCTTTCACCTTTGAGATCCCTCCAAACCTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCAGGAACGCCTCATCAAGAAGCTGGGCGAGCACGCTTACCCTTTCACCTTTGAGATCCCTCCAAACCTTC  370

Query  371  CATGTTCTGTGACACTGCAGCCGGGGCCCGAAGACACGGGGAAGGCTTGCGGTGTGGACTATGAAGTCAAAGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CATGTTCTGTGACACTGCAGCCGGGGCCCGAAGACACGGGGAAGGCTTGCGGTGTGGACTATGAAGTCAAAGCC  444

Query  445  TTCTGCGCGGAGAATTTGGAGGAGAAGATCCACAAGCGGAATTCTGTGCGTCTGGTCATCCGGAAGGTTCAGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCTGCGCGGAGAATTTGGAGGAGAAGATCCACAAGCGGAATTCTGTGCGTCTGGTCATCCGGAAGGTTCAGTA  518

Query  519  TGCCCCAGAGAGGCCTGGCCCCCAGCCCACAGCCGAGACCACCAGGCAGTTCCTCATGTCGGACAAGCCCTTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCCCAGAGAGGCCTGGCCCCCAGCCCACAGCCGAGACCACCAGGCAGTTCCTCATGTCGGACAAGCCCTTGC  592

Query  593  ACCTAGAAGCCTCTCTGGATAAGGAGATCTATTACCATGGAGAACCCATCAGCGTCAACGTCCACGTCACCAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTAGAAGCCTCTCTGGATAAGGAGATCTATTACCATGGAGAACCCATCAGCGTCAACGTCCACGTCACCAAC  666

Query  667  AACACCAACAAGACGGTGAAGAAGATCAAGATCTCAGTGCGCCAGTATGCAGACATCTGCCTTTTCAACACAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACACCAACAAGACGGTGAAGAAGATCAAGATCTCAGTGCGCCAGTATGCAGACATCTGCCTTTTCAACACAGC  740

Query  741  TCAGTACAAGTGCCCTGTTGCCATGGAAGAGGCTGATGACACTGTGGCACCCAGCTCGACGTTCTGCAAGGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGTACAAGTGCCCTGTTGCCATGGAAGAGGCTGATGACACTGTGGCACCCAGCTCGACGTTCTGCAAGGTCT  814

Query  815  ACACACTGACCCCCTTCCTAGCCAATAACCGAGAGAAGCGGGGCCTCGCCTTGGACGGGAAGCTCAAGCACGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACACACTGACCCCCTTCCTAGCCAATAACCGAGAGAAGCGGGGCCTCGCCTTGGACGGGAAGCTCAAGCACGAA  888

Query  889  GACACGAACTTGGCCTCTAGCACCCTGTTGAGGGAAGGTGCCAACCGTGAGATCCTGGGGATCATTGTTTCCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACACGAACTTGGCCTCTAGCACCCTGTTGAGGGAAGGTGCCAACCGTGAGATCCTGGGGATCATTGTTTCCTA  962

Query  963  CAAAGTGAAAGTGAAGCTGGTGGTGTCTCGGGGCGGCCTGTTGGGAGATCTTGCATCCAGCGACGTGGCCGTGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                        |||||||||||||||
Sbjct  963  CAAAGTGAAAGTGAAGCTGGTGGTGTCTCGGGGCG------------------------GCGACGTGGCCGTGG  1012

Query 1037  AACTGCCCTTCACCCTAATGCACCCCAAGCCCAAAGAGGAACCCCCGCATCGGGAAGTTCCAGAGAACGAGACG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  AACTGCCCTTCACCCTAATGCACCCCAAGCCCAAAGAGGAACCCCCGCATCGGGAAGTTCCAGAGAACGAGACG  1086

Query 1111  CCAGTAGATACCAATCTCATAGAACTTGACACAAATGATGACGACATTGTATTTGAGGACTTTGCTCGCCAGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  CCAGTAGATACCAATCTCATAGAACTTGACACAAATGATGACGACATTGTATTTGAGGACTTTGCTCGCCAGAG  1160

Query 1185  ACTGAAAGGCATGAAGGATGACAAGGAGGAAGAGGAGGATGGTACCGGCTCTCCACAGCTCAACAACAGA  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  ACTGAAAGGCATGAAGGATGACAAGGAGGAAGAGGAGGATGGTACCGGCTCTCCACAGCTCAACAACAGA  1230