Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00300
Subject:
NM_001048194.3
Aligned Length:
452
Identities:
421
Gaps:
31

Alignment

Query   1  MSPKRIAKRRSPPADAIPKSKKVK-------------------------------VSHRSHSTEPGLVLTLGQG  43
           ||||||||||||||||||||||||                               |||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSPKRIAKRRSPPADAIPKSKKVKDTRAAASRRVPGARSCQGACGPSPPDQKTRPVSHRSHSTEPGLVLTLGQG  74

Query  44  DVGQLGLGENVMERKKPALVSIPEDVVQAEAGGMHTVCLSKSGQVYSFGCNDEGALGRDTSVEGSEMVPGKVEL  117
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  DVGQLGLGENVMERKKPALVSIPEDVVQAEAGGMHTVCLSKSGQVYSFGCNDEGALGRDTSVEGSEMVPGKVEL  148

Query 118  QEKVVQVSAGDSHTAALTDDGRVFLWGSFRDNNGVIGLLEPMKKSMVPVQVQLDVPVVKVASGNDHLVMLTADG  191
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  QEKVVQVSAGDSHTAALTDDGRVFLWGSFRDNNGVIGLLEPMKKSMVPVQVQLDVPVVKVASGNDHLVMLTADG  222

Query 192  DLYTLGCGEQGQLGRVPELFANRGGRQGLERLLVPKCVMLKSRGSRGHVRFQDAFCGAYFTFAISHEGHVYGFG  265
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  DLYTLGCGEQGQLGRVPELFANRGGRQGLERLLVPKCVMLKSRGSRGHVRFQDAFCGAYFTFAISHEGHVYGFG  296

Query 266  LSNYHQLGTPGTESCFIPQNLTSFKNSTKSWVGFSGGQHHTVCMDSEGKAYSLGRAEYGRLGLGEGAEEKSIPT  339
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  LSNYHQLGTPGTESCFIPQNLTSFKNSTKSWVGFSGGQHHTVCMDSEGKAYSLGRAEYGRLGLGEGAEEKSIPT  370

Query 340  LISRLPAVSSVACGASVGYAVTKDGRVFAWGMGTNYQLGTGQDEDAWSPVEMMGKQLENRVVLSVSSGGQHTVL  413
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  LISRLPAVSSVACGASVGYAVTKDGRVFAWGMGTNYQLGTGQDEDAWSPVEMMGKQLENRVVLSVSSGGQHTVL  444

Query 414  LVKDKEQS  421
           ||||||||
Sbjct 445  LVKDKEQS  452