Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00300
• Subject: NM_133878.3
• Aligned Length: 1264
• Identities: 1128
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGTCACCCAAGCGCATAGCTAAAAGAAGGTCCCCCCCAGCAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGAAGGT  74
            |||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCCACCCAAGCGCATAGCTAAGAGAAGGTCACCCCCAGAAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGAAAGT  74

Query   75  CTCACACAGGTCCCACAGCACAGAACCCGGCTTGGTGCTGACACTAGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGC  148
            |||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCACACAGGTCCCACAACACAGAACCAGGCTTGGTGCTGACACTGGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGC  148

Query  149  TGGGTGAGAATGTGATGGAGAGGAAGAAGCCGGCCCTGGTATCCATTCCGGAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCT  222
            |||||||.|.||||.||||||||||||||||||||.||||..||.|||.|.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  TGGGTGAAAGTGTGCTGGAGAGGAAGAAGCCGGCCTTGGTGCCCCTTCTGCAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCC  222

Query  223  GGGGGCATGCACACCGTGTGTCTAAGCAAAAGTGGCCAGGTCTATTCCTTCGGCTGCAATGATGAGGGTGCCCT  296
            |||||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  GGGGGCATGCATACTGTGTGTCTGAGCCAAAGTGGCCAGGTCTACTCCTTTGGCTGCAATGACGAGGGTGCCCT  296

Query  297  GGGAAGGGACACATCAGTGGAGGGCTCGGAGATGGTCCCTGGGAAAGTGGAGCTGCAAGAGAAGGTGGTACAGG  370
            ||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  297  GGGAAGGGACACTTCAGTCGAAGGCTCAGAAATGGTCCCTGGGAAAGTGGAACTGCAAGAGAAAGTGGTGCAAG  370

Query  371  TGTCAGCAGGAGACAGTCACACAGCAGCCCTCACCGATGATGGCCGTGTCTTCCTCTGGGGCTCCTTCCGGGAC  444
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TGTCAGCGGGGGACAGTCACACAGCAGCCCTCACCGAAGACGGCCGTGTCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCGGGAC  444

Query  445  AATAACGGTGTGATTGGACTGTTGGAGCCCATGAAGAAGAGCATGGTGCCTGTGCAGGTGCAGCTGGATGTGCC  518
            |||||.||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|||
Sbjct  445  AATAATGGTGTGATCGGGTTGTTGGAGCCCATGAAGAAGAGCATGGTACCTGTTCAAGTGCAGCTGGATGCGCC  518

Query  519  TGTGGTAAAGGTGGCCTCAGGAAACGACCACTTGGTGATGCTGAC-AGCTGATGGTGACCTCTACACCTTGGGC  591
            .|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|| |.| |||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  519  CGTGGTAAAGGTGGCCTCGGGGAACGACCACTTGGTGATGCTCACGAAC-GATGGCGACCTCTACACCTTGGGT  591

Query  592  TGCGGGGAACAGGGCCAGCTAGGCCGTGTGCCTGAGTTATTTGCCAACCGTGGTGGCCGGCAAGGCCTCGAACG  665
            ||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|..||
Sbjct  592  TGTGGGGAGCAAGGTCAGCTGGGCCGTGTACCTGAATTATTTGCCAACCGAGGTGGCCGTCAGGGCCTTGGGCG  665

Query  666  ACTCCTGGTCCCCAAGTGTGTGATGCTGAAATCCAGGGGAAGCCGGGGCCACGTGAGATTCCAGGATGCCTTTT  739
            ||||||||||||||..||||||.||||||||||||||||.|.||||||||..|||.|.||||||||||||||.|
Sbjct  666  ACTCCTGGTCCCCAGATGTGTGCTGCTGAAATCCAGGGGGACCCGGGGCCGTGTGCGGTTCCAGGATGCCTTCT  739

Query  740  GTGGTGCCTATTTCACCTTTGCCATCTCCCATGAGGGCCACGTGTACGGCTTCGGCCTCTCCAACTACCATCAG  813
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  740  GTGGCGCCTATTTCACTTTTGCCATCTCCCGAGAGGGCCACGTGTATGGCTTTGGCCTCTCCAACTATCACCAG  813

Query  814  CTTGGAACTCCGGGCACAGAATCTTGCTTCATACCCCAGAACCTAACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTG  887
            ||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CTCGGGACTCCAGGCACTGGATCTTGCTTCATTCCTCAAAACTTGACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTG  887

Query  888  GGTGGGCTTCTCTGGTGGCCAGCACCATACAGTCTGCATGGATTCGGAAGGAAAAGCATACAGCCTGGGCCGGG  961
            |||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  888  GGTAGGCTTCTCCGGTGGCCAGCATCACACAGTCTGCATGGATTCGGAAGGGAAGGCGTACAGCCTGGGCCGGG  961

Query  962  CTGAGTATGGGCGGCTGGGCCTTGGAGAGGGTGCTGAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATCTCCAGGCTGCCT  1035
            |||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.
Sbjct  962  CTGAGTACGGGCGCCTGGGCCTTGGGGAGGGTGCTGAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATTTCCCGGCTGCCC  1035

Query 1036  GCTGTCTCCTCGGTGGCTTGTGGGGCCTCTGTGGGGTATGCTGTGACCAAGGATGGTCGTGTTTTCGCCTGGGG  1109
            |..||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1036  GTGGTCTCCTCAGTGGCCTGTGGGGCTTCTGTGGGTTATGCTGTGTCCAAGGATGGTCGTGTTTTTGCCTGGGG  1109

Query 1110  CATGGGCACCAACTACCAGCTGGGCACAGGGCAGGATGAGGACGCCTGGAGCCCTGTGGAGATGATGGGCAAAC  1183
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||..|||||||
Sbjct 1110  CATGGGCACCAACTACCAGCTGGGCACCGGGCAGGATGAAGATGCCTGGAGTCCTGTGGAAATGACTGGCAAAC  1183

Query 1184  AGCTGGAGAACCGTGTGGTCTTATCTGTGTCCAGCGGGGGCCAGCATACAGTCTTATTAGTCAAGGACAAAGAA  1257
            |||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||.||||||.|.|.|
Sbjct 1184  AGCTGGAGAACCGTGTGGTGTTAACTGTGTCCAGTGGGGGCCAGCACACGGTCTTACTAGTTAAGGACCAGGCA  1257

Query 1258  CAGAGC  1263
            ||||||
Sbjct 1258  CAGAGC  1263