Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00303
• Subject: NM_001113246.2
• Aligned Length: 1378
• Identities: 1271
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACA  74
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct    1  ATGGCTCTGACCCTGTTCGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATACCAGCTGCAGCA  74

Query   75  GGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGT  148
            ||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAAGCCCCTCACCCTCGAAGGGTCACCTGCACTTGTGAGGTAGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGT  148

Query  149  TTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAG-CCGACCAGCTCTTGATTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGA  221
            .|||||||||||||||.||||||| || |.|||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  149  ATCATGGCATGATCTCTAGAGAAG-AGACTGACCAGCTCCTGAGTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGTGA  221

Query  222  GAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGAAGTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACT  295
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  222  GAGCCAGCGGCAGCCAGGAACGTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGAAGTCAGACCAGAAACTTCAGGCTGTACT  295

Query  296  ACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACT  369
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  ACGATGGAAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACT  369

Query  370  CTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGATAAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  370  CTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGATAAACCCAATTTATGAGCACATAGGATA  443

Query  444  CACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCCAGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATT  517
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||.|||..
Sbjct  444  CACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAACAGCACATGGCAGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAAAGAGG  517

Query  518  CTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAG  591
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  518  CTACAGGCCAGGATGGGGTATCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAATGAA  591

Query  592  CAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACATTCAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTG  665
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CAAATTCCAAAATATGAAAAGGTTCACAATTTCAAGGTGCATACGTTCCGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTG  665

Query  666  TGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAGATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGT  739
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  666  TGCCAACTTCATGTGGGGCCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAGATTGTGGGTTGAATGTTCACAAGCAGT  739

Query  740  GTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGTCAAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACG  813
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  740  GTTCCAAGATGGTCCCCAATGACTGTAAGCCAGATCTGAAGCACGTGAAGAAGGTGTACAGCTGTGACCTGACA  813

Query  814  ACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACATGTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGG  887
            ||||||||||||||.||.|.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  814  ACGCTCGTGAAAGCTCACATCACCAAGCGGCCAATGGTGGTAGACATGTGCATCAGGGAGATCGAGTCCAGAGG  887

Query  888  TCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTAATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACA  961
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  888  TCTTAATTCTGAAGGACTCTACCGAGTGTCAGGATTTAGTGACCTGATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTTGATA  961

Query  962  GAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTG  1035
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GAGATGGTGAGAAGGCGGATATTTCTGTGAACATGTATGAGGACATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTG  1035

Query 1036  TACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACCCTAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTAT  1109
            ||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1036  TACTTCAGGGATCTGCCAATTCCTCTCATCACATACGATGCCTACCCCAAGTTCATTGAGTCTGCCAAAATTAT  1109

Query 1110  GGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTACTGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCC  1183
            |||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|...|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1110  GGACCCTGACGAGCAATTGGAGACCCTTCACGAAGCACTGAGATCGCTGCCGCCTGCCCACTGCGAGACGCTCC  1183

Query 1184  GGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGAGAATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGA  1257
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.
Sbjct 1184  GGTACCTCATGGCGCATCTCAAGAGAGTGACCCTTCATGAGAAGGAGAATCTGATGAGTGCAGAGAACCTTGGG  1257

Query 1258  ATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCATGGCTGCATTGAATGATATACGGTATCA  1331
            |||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|||||||.||..||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1258  ATCGTGTTTGGACCAACCCTCATGAGATCCCCAGAGCTCGACCCCATGGCCGCCCTGAACGACATACGCTATCA  1331

Query 1332  GAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  GAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT  1377