Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00360
• Subject: NM_001371427.1
• Aligned Length: 1023
• Identities: 981
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74

Query   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148

Query  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222

Query  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTT--------------------------------------  258

Query  297  AACACAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  ----CAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  328

Query  371  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  402

Query  445  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  476

Query  519  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  550

Query  593  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  624

Query  667  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  698

Query  741  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  772

Query  815  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAAGCA  846

Query  889  GCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAAAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847  GCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAAAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAATCA  920

Query  963  AAACAAGACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  1023
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921  AAACAAGACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  981