Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00360
Subject:
XM_011510646.3
Aligned Length:
1109
Identities:
922
Gaps:
187

Alignment

Query    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74

Query   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148

Query  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222

Query  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296

Query  297  AACACAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACACAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  370

Query  371  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  444

Query  445  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  518

Query  519  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  592

Query  593  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  666

Query  667  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  740

Query  741  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  814

Query  815  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAAC---------  879
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  815  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGTTCTATA  888

Query  880  --------------------------------------------------------------------------  879
                                                                                      
Sbjct  889  AGATCAGAGGCCTTCATTGGATCTCACTGGGCTAAAATGAAGGTGTCAGCAGGACTGCATTCCTTCCTGGAGGT  962

Query  880  ---AGGGAAGCAGCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAAAACAGAGTGGCAGT  950
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  963  TCTAGGGAAGCAGCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATG----------------------------  1008

Query  951  GCTTGAAAATCAAAACAAGACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  1023
                                                                                     
Sbjct 1009  -------------------------------------------------------------------------  1008