Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00361
- Subject:
- NM_001256093.2
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 1121
- Gaps:
- 393
Alignment
Query 1 ATGAAATTCAAGTTACATGTGAATTCTGCCAGGCAATACAAGGACCTGTGGAATATGAGTGATGACAAACCCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCTATGTACTGCGCCTGGATGTGGCCAGCGTTTTACCAACGAGGATCATTTGGCTGTCCATAAACATAAACATG 148
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---ATGTACTGCGCCTGGATGTGGCCA----------------------------------------------- 24
Query 149 AGATGACACTGAAATTTGGTCCAGCACGTAATGACAGTGTCATTGTGGCTGATCAGACCCCAACACCAACAAGA 222
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 --------------------------------------------------GATCAGACCCCAACACCAACAAGA 48
Query 223 TTCTTGAAAAACTGTGAAGAAGTGGGTTTGTTTAATGAGTTGGCGAGTCCATTTGAGAATGAATTCAAGAAAGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 TTCTTGAAAAACTGTGAAGAAGTGGGTTTGTTTAATGAGTTGGCGAGTCCATTTGAGAATGAATTCAAGAAAGC 122
Query 297 TTCAGAAGATGACATTAAAAAAATGCCTCTAGATTTATCCCCTCTTGCAACACCTATCATAAGAAGCAAAATTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 TTCAGAAGATGACATTAAAAAAATGCCTCTAGATTTATCCCCTCTTGCAACACCTATCATAAGAAGCAAAATTG 196
Query 371 AGGAGCCTTCTGTTGTAGAAACAACTCACCAGGATAGTCCTTTACCTCACCCAGAGTCTACTACCAGTGATGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 AGGAGCCTTCTGTTGTAGAAACAACTCACCAGGATAGTCCTTTACCTCACCCAGAGTCTACTACCAGTGATGAG 270
Query 445 AAGGAAGTACCATTGGCACAAACTGCACAGCCCACATCAGCTATTGTTCGTCCAGCATCATTACAGGTTCCCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 AAGGAAGTACCATTGGCACAAACTGCACAGCCCACATCAGCTATTGTTCGTCCAGCATCATTACAGGTTCCCAA 344
Query 519 TGTGCTGCTTACAAGTTCTGACTCAAGTGTAATTATTCAGCAGGCAGTACCTTCACCAACCTCAAGTACTGTAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 TGTGCTGCTTACAAGTTCTGACTCAAGTGTAATTATTCAGCAGGCAGTACCTTCACCAACCTCAAGTACTGTAA 418
Query 593 TCACCCAGGCACCATCCTCTAACAGGCCAATTGTCCCTGTACCAGGCCCATTTCCTCTTCTGTTACATCTTCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 TCACCCAGGCACCATCCTCTAACAGGCCAATTGTCCCTGTACCAGGCCCATTTCCTCTTCTGTTACATCTTCCT 492
Query 667 AATGGACAAACCATGCCTGTTGCTATTCCTGCATCAATTACAAGTTCTAATGTGCATGTTCCAGCTGCAGTCCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 AATGGACAAACCATGCCTGTTGCTATTCCTGCATCAATTACAAGTTCTAATGTGCATGTTCCAGCTGCAGTCCC 566
Query 741 ACTCGTTCGACCAGTCACCATGGTGCCTAGTGTTCCAGGAATCCCAGGTCCTTCCTCTCCCCAACCAGTACAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 ACTCGTTCGACCAGTCACCATGGTGCCTAGTGTTCCAGGAATCCCAGGTCCTTCCTCTCCCCAACCAGTACAGT 640
Query 815 CAGAAGCAAAAATGAGATTAAAAGCTGCTTTGACCCAGCAACATCCTCCAGTTACCAATGGTGATACTGTCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CAGAAGCAAAAATGAGATTAAAAGCTGCTTTGACCCAGCAACATCCTCCAGTTACCAATGGTGATACTGTCAAA 714
Query 889 GGTCATGGTAGCGGATTGGTTAGGACTCAGTCAGAGGAATCTCGACCGCAGTCATTACAACAGCCAGCCACATC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GGTCATGGTAGCGGATTGGTTAGGACTCAGTCAGAGGAATCTCGACCGCAGTCATTACAACAGCCAGCCACATC 788
Query 963 CACTACAGAAACTCCGGCTTCTCCAGCTCACACAACTCCACAGACCCAAAGTACAAGTGGTCGTCGGAGAAGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CACTACAGAAACTCCGGCTTCTCCAGCTCACACAACTCCACAGACCCAAAGTACAAGTGGTCGTCGGAGAAGAG 862
Query 1037 CAGCTAACGAAGATCCTGATGAAAAAAGGAGAAAGTTTTTAGAGCGAAATAGAGCAGCAGCTTCAAGATGCCGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 CAGCTAACGAAGATCCTGATGAAAAAAGGAGAAAGTTTTTAGAGCGAAATAGAGCAGCAGCTTCAAGATGCCGA 936
Query 1111 CAAAAAAGGAAAGTCTGGGTTCAGTCTTTAGAGAAGAAAGCTGAAGACTTGAGTTCATTAAATGGTCAGCTGCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 CAAAAAAGGAAAGTCTGGGTTCAGTCTTTAGAGAAGAAAGCTGAAGACTTGAGTTCATTAAATGGTCAGCTGCA 1010
Query 1185 GAGTGAAGTCACCCTGCTGAGAAATGAAGTGGCACAGCTGAAACAGCTTCTTCTGGCTCATAAAGATTGCCCTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 GAGTGAAGTCACCCTGCTGAGAAATGAAGTGGCACAGCTGAAACAGCTTCTTCTGGCTCATAAAGATTGCCCTG 1084
Query 1259 TAACCGCCATGCAGAAGAAATCTGGCTATCATACTGCTGATAAAGATGATAGTTCAGAAGACATTTCAGTGCCG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.||
Sbjct 1085 TAACCGCCATGCAGAAGAAATCTGGCTATCATA-----GAAAA------------------------------- 1122
Query 1333 AGTAGTCCACATACAGAAGCTATACAGCATAGTTCGGTCAGCACATCCAATGGAGTCAGTTCAACCTCCAAGGC 1406
Sbjct 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Query 1407 AGAAGCTGTAGCCACTTCAGTCCTCACCCAGATGGCGGACCAGAGTACAGAGCCTGCTCTTTCACAGATCGTTA 1480
Sbjct 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Query 1481 TGGCTCCTTCCTCCCAGTCACAGCCCTCAGGAAGT 1515
Sbjct 1123 ----------------------------------- 1122