Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00427
• Subject: XM_017020401.2
• Aligned Length: 1686
• Identities: 1557
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAATCCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAATCCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTT  74

Query   75  CCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACAGCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGGTGCAGAGTCGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACAGCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGGTGCAGAGTCGGCCA  148

Query  149  ATGTCTGTGGCTCTCAGCAAGGCCGGGGGCAGTGCACAGAGGTGCGAGCCGACACAAGGCCCTGGAGTGGTCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTCTGTGGCTCTCAGCAAGGCCGGGGGCAGTGCACAGAGGTGCGAGCCGACACAAGGCCCTGGAGTGGTCCC  222

Query  223  TACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTGAGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAAGTGCACAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTGAGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAAGTGCACAGG  296

Query  297  AAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAAGAAACCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAAGAAACCAC  370

Query  371  CAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAGATCTCGCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAGATCTCGCG  444

Query  445  AAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAATGGAACCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAATGGAACCCA  518

Query  519  GCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGATACATTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGATACATTAT  592

Query  593  TAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGCACCGGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGCACCGGTAC  666

Query  667  CATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTACTGGAACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTACTGGAACTT  740

Query  741  TGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGATCCGACTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGATCCGACTC  814

Query  815  TGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACCACCTGGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACCACCTGGTC  888

Query  889  ACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAATTGCCAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAATTGCCAAC  962

Query  963  CTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTCTACCTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTCTACCTTCA  1036

Query 1037  GTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCCTTCATAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCCTTCATAAT  1110

Query 1111  TTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTTGT------  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1111  TTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTTGTGGTGAT  1184

Query 1179  --------------------------------------------------------------------------  1178
                                                                                      
Sbjct 1185  TTCTAATCGTTTGCTTTACAATGCTACAACAAACATCCTTGAACATGTAAGAAAAGAGAAAGCGACCAAGGAAC  1258

Query 1179  -------------------------------------------------GGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCC  1203
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCTTCCCTGCATGTGCTGGTAACCATGAGCCTGGGAGGCTCTACTCAGGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCC  1332

Query 1204  ATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATGCCTGGCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCA  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATGCCTGGCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCA  1406

Query 1278  CAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATGAAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAAC  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATGAAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAAC  1480

Query 1352  TTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAGTTTCAGTTGAAGAAACTCCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTA  1425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAGTTTCAGTTGAAGAAACTCCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTA  1554

Query 1426  GTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGCTTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAA  1499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGCTTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAA  1628

Query 1500  AGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCAAGAGATACACAGAAGAAGCC  1557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCAAGAGATACACAGAAGAAGCC  1686