Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00431
• Subject: XM_017017251.1
• Aligned Length: 1449
• Identities: 1320
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGAGCACGGCCAGAACAGAGAACCCTGTTATAATGGGTCTGTCCAGTCAAAATGGTCAGCTGAGAGGCCCTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCACGGCCAGAACAGAGAACCCTGTTATAATGGGTCTGTCCAGTCAAAATGGTCAGCTGAGAGGCCCTGT  74

Query   75  GAAACCCACTGGTGGCCCTGGAGGAGGGGGCACACAGACACAGCAACAGATGAACCAGCTGAAAAACACCAACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAACCCACTGGTGGCCCTGGAGGAGGGGGCACACAGACACAGCAACAGATGAACCAGCTGAAAAACACCAACA  148

Query  149  CAATCAATAATGGCACTCAGCAGCAAGCACAGAGTATGACCACCACTATTAAACCTGGTGATGACTGGAAAAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAATCAATAATGGCACTCAGCAGCAAGCACAGAGTATGACCACCACTATTAAACCTGGTGATGACTGGAAAAAG  222

Query  223  ACTTTAAAACTCCCTCCAAAGGATCTAAGAATCAAAACTTCGGATGTGACCTCCACAAAAGGAAATGAGTTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTTTAAAACTCCCTCCAAAGGATCTAAGAATCAAAACTTCGGATGTGACCTCCACAAAAGGAAATGAGTTTGA  296

Query  297  AGATTACTGTTTGAAACGGGAGTTACTGATGGGAATTTTTGAAATGGGCTGGGAAAAGCCATCTCCTATTCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATTACTGTTTGAAACGGGAGTTACTGATGGGAATTTTTGAAATGGGCTGGGAAAAGCCATCTCCTATTCAGG  370

Query  371  AGGAGAGCATTCCCATTGCTTTATCTGGTAGGGATATCTTAGCTAGAGCAAAAAATGGAACAGGCAAGAGCGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGAGCATTCCCATTGCTTTATCTGGTAGGGATATCTTAGCTAGAGCAAAAAATGGAACAGGCAAGAGCGGT  444

Query  445  GCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGGCTAGACCTGAAGAAGGACAATATACAAGCAATGGTGATTGTTCCCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGGCTAGACCTGAAGAAGGACAATATACAAGCAATGGTGATTGTTCCCAC  518

Query  519  TAGAGAACTTGCTCTACAGGTCAGTCAAATTTGCATCCAGGTCAGCAAACACATGGGAGGGGCCAAAGTGATGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAGAGAACTTGCTCTACAGGTCAGTCAAATTTGCATCCAGGTCAGCAAACACATGGGAGGGGCCAAAGTGATGG  592

Query  593  CAACCACAGGAGGAACCAATTTACGAGATGACATAATGAGGCTTGATGATACAGTGCACGTGGTGATTGCTACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAACCACAGGAGGAACCAATTTACGAGATGACATAATGAGGCTTGATGATACAGTGCACGTGGTGATTGCTACC  666

Query  667  CCTGGGAGAATCCTGGATCTTATTAAGAAAGGAGTAGCAAAGGTTGATCATGTCCAGATGATAGTATTGGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTGGGAGAATCCTGGATCTTATTAAGAAAGGAGTAGCAAAGGTTGATCATGTCCAGATGATAGTATTGGATGA  740

Query  741  GGCAGATAAGTTGCTGTCACAGGATTTTGTGCAGATAATGGAGGATATTATTCTCACGCTACCTAAAAACAGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCAGATAAGTTGCTGTCACAGGATTTTGTGCAGATAATGGAGGATATTATTCTCACGCTACCTAAAAACAGGC  814

Query  815  AGATTTTACTATATTCCGCTACTTTCCCTCTTAGTGTACAGAAGTTCATGAATTCCCATTTGCAGAAACCCTAT  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  815  AGATTTTACTATATTCCGCTACTTTCCCTCTTAGTGTACAGAAGTTCAT-------------------------  863

Query  889  GAGATTAACCTGATGGAGGAACTAACTCTGAAGGGAGTAACCCAGTACTACGCATATGTAACTGAGCGCCAAAA  962
                                                                                      
Sbjct  864  --------------------------------------------------------------------------  863

Query  963  AGTACACTGCCTCAACACACTTTTCTCCAGGCTTCAGATAAACCAGTCGATCATTTTCTGTAACTCCTCTCAGC  1036
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  ------------------------------GCTTCAGATAAACCAGTCGATCATTTTCTGTAACTCCTCTCAGC  907

Query 1037  GAGTTGAATTGCTAGCCAAGAAGATTTCTCAACTGGGTTATTCTTGCTTCTATATTCATGCTAAAATGAGGCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  GAGTTGAATTGCTAGCCAAGAAGATTTCTCAACTGGGTTATTCTTGCTTCTATATTCATGCTAAAATGAGGCAG  981

Query 1111  GAACATCGAAATCGTGTATTTCATGATTTCCGAAATGGCTTATGCCGCAATCTTGTTTGCACTGATCTGTTTAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  GAACATCGAAATCGTGTATTTCATGATTTCCGAAATGGCTTATGCCGCAATCTTGTTTGCACTGATCTGTTTAC  1055

Query 1185  CCGAGGTATTGATATACAAGCTGTGAATGTGGTAATAAACTTTGATTTCCCAAAGCTGGCAGAGACCTATCTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  CCGAGGTATTGATATACAAGCTGTGAATGTGGTAATAAACTTTGATTTCCCAAAGCTGGCAGAGACCTATCTCC  1129

Query 1259  ATCGTATTGGAAGATCAGGTCGCTTTGGTCATCTTGGCTTAGCCATCAACTTGATCACATATGATGATCGCTTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  ATCGTATTGGAAGATCAGGTCGCTTTGGTCATCTTGGCTTAGCCATCAACTTGATCACATATGATGATCGCTTC  1203

Query 1333  AACCTGAAAAGTATTGAGGAGCAGCTGGGAACAGAAATTAAACCTATTCCGAGCAACATTGATAAGAGCCTGTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  AACCTGAAAAGTATTGAGGAGCAGCTGGGAACAGAAATTAAACCTATTCCGAGCAACATTGATAAGAGCCTGTA  1277

Query 1407  TGTGGCAGAATACCACAGCGAGCCTGTAGAAGATGAGAAACCT  1449
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  TGTGGCAGAATACCACAGCGAGCCTGTAGAAGATGAGAAACCT  1320