Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00440
• Subject: NM_001127454.2
• Aligned Length: 1488
• Identities: 996
• Gaps: 492

Alignment

Query    1  ATGTTTGCCAAAGCAACCAGGAATTTTCTTAGAGAAGTTGATGCTGATGGTGACCTGATTGCAGTATCAAATCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAATGACTCTGATAAGTTACAGCTTCTAAGTCTGGTGACAAAAAAGAAGAGATTCTGGTGCTGGCAGAGACCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGTACCAGTTTTTATCCCTCACCCTTGGCGATGTACTCATAGAAGACCAATTTCCGAGTCCAGTGGTCGTGGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCGGACTTTGTGAAATACGAGGGCAAGTTTGCAAACCACGTGAGTGGAACCCTGGAGACTGCACTGGGGAAGGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAAGCTGAACCTGGGGGGCAGCAGCCGCGTAGAGAGCCAGTCTTCATTTGGAACCCTGAGGAAGCAGGAGGTGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ATTTGCAGCAGCTCATCAGAGACTCTGCCGAGAGAACAATAAATCTGAGAAACCCTGTGCTCCAGCAGGTGCTG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GAAGGAAGGAATGAGGTCCTGTGCGTTTTGACACAGAAGATCACGACGATGCAGAAGTGTGTGATCTCTGAGCA  518
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------ATGCAGAAGTGTGTGATCTCTGAGCA  26

Query  519  CATGCAGGTCGAGGAGAAGTGTGGTGGCATCGTGGGCATCCAGACCAAGACGGTGCAGGTGTCAGCGACGGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   27  CATGCAGGTCGAGGAGAAGTGTGGTGGCATCGTGGGCATCCAGACCAAGACGGTGCAGGTGTCAGCGACGGAGG  100

Query  593  ATGGGAATGTCACCAAGGACTCCAACGTGGTGCTGGAGATCCCAGCTGCCACCACCATTGCCTACGGTGTCATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  ATGGGAATGTCACCAAGGACTCCAACGTGGTGCTGGAGATCCCAGCTGCCACCACCATTGCCTACGGTGTCATT  174

Query  667  GAGTTATACGTGAAACTGGACGGCCAGTTCGAGTTCTGCCTTCTCCGAGGGAAGCAAGGTGGCTTCGAGAACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  GAGTTATACGTGAAACTGGACGGCCAGTTCGAGTTCTGCCTTCTCCGAGGGAAGCAAGGTGGCTTCGAGAACAA  248

Query  741  GAAGAGAATTGACTCTGTCTACCTGGACCCCCTGGTCTTTCGAGAGTTTGCATTCATAGACATGCCAGATGCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  GAAGAGAATTGACTCTGTCTACCTGGACCCCCTGGTCTTTCGAGAGTTTGCATTCATAGACATGCCAGATGCTG  322

Query  815  CGCATGGGATATCTTCCCAGGATGGACCATTAAGTGTTTTAAAGCAAGCGACCCTGCTCCTGGAGAGGAATTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  CGCATGGGATATCTTCCCAGGATGGACCATTAAGTGTTTTAAAGCAAGCGACCCTGCTCCTGGAGAGGAATTTC  396

Query  889  CATCCATTTGCGGAGCTGCCTGAGCCACAACAGACAGCTTTGAGTGACATCTTCCAGGCGGTCCTATTTGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  CATCCATTTGCGGAGCTGCCTGAGCCACAACAGACAGCTTTGAGTGACATCTTCCAGGCGGTCCTATTTGATGA  470

Query  963  TGAACTACTCATGGTCCTGGAACCAGTGTGCGATGACCTGGTCAGCGGCCTCTCGCCCACAGTGGCGGTGCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  TGAACTACTCATGGTCCTGGAACCAGTGTGCGATGACCTGGTCAGCGGCCTCTCGCCCACAGTGGCGGTGCTGG  544

Query 1037  GGGAGCTGAAGCCCCGGCAGCAGCAGGACCTTGTGGCCTTCCTGCAGCTGGTGGGGTGCAGCTTACAGGGTGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  GGGAGCTGAAGCCCCGGCAGCAGCAGGACCTTGTGGCCTTCCTGCAGCTGGTGGGGTGCAGCTTACAGGGTGGG  618

Query 1111  TGTCCGGGCCCCGAGGATGCAGGCAGCAAGCAGCTGTTTATGACAGCCTACTTCTTGGTCAGTGCCCTCGCAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  TGTCCGGGCCCCGAGGATGCAGGCAGCAAGCAGCTGTTTATGACAGCCTACTTCTTGGTCAGTGCCCTCGCAGA  692

Query 1185  AATGCCAGATAGCGCAGCAGCTCTGCTGGGCACTTGCTGCAAACTCCAGATCATTCCCACACTGTGCCACTTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  AATGCCAGATAGCGCAGCAGCTCTGCTGGGCACTTGCTGCAAACTCCAGATCATTCCCACACTGTGCCACTTGC  766

Query 1259  TTCGTGCTCTGTCTGATGATGGAGTATCTGATCTTGAAGACCCAACCTTGACTCCCCTGAAAGATACAGAAAGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  TTCGTGCTCTGTCTGATGATGGAGTATCTGATCTTGAAGACCCAACCTTGACTCCCCTGAAAGATACAGAAAGG  840

Query 1333  TTTGGGATTGTGCAGCGCTTGTTTGCCTCAGCTGACATTAGTCTGGAGAGACTGAAGTCATCTGTGAAAGCTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TTTGGGATTGTGCAGCGCTTGTTTGCCTCAGCTGACATTAGTCTGGAGAGACTGAAGTCATCTGTGAAAGCTGT  914

Query 1407  CATTCTGAAGGACTCTAAAGTCTTCCCACTGCTTCTTTGTATAACCCTGAATGGACTCTGTGCTTTAGGCAGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  CATTCTGAAGGACTCTAAAGTCTTCCCACTGCTTCTTTGTATAACCCTGAATGGACTCTGTGCTTTAGGCAGAG  988

Query 1481  AACATTCA  1488
            ||||||||
Sbjct  989  AACATTCA  996