Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00454
• Subject: NM_153759.3
• Aligned Length: 2742
• Identities: 2149
• Gaps: 579

Alignment

Query    1  ATGCCCGCCATGCCCTCCAGCGGCCCCGGGGACACCAGCAGCTCTGCTGCGGAGCGGGAGGAGGACCGAAAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGAGAGGAGCAGGAGGAGCCGCGTGGCAAGGAGGAGCGCCAAGAGCCCAGCACCACGGCACGGAAGGTGGGGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCTGGGAGGAAGCGCAAGCACCCCCCGGTGGAAAGCGGTGACACGCCAAAGGACCCTGCGGTGATCTCCAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCCCCATCCATGGCCCAGGACTCAGGCGCCTCAGAGCTATTACCCAATGGGGACTTGGAGAAGCGGAGTGAGCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCAGCCAGAGGAGGGGAGCCCTGCTGGGGGGCAGAAGGGCGGGGCCCCAGCAGAGGGAGAGGGTGCAGCTGAGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCTGCCTGAAGCCTCAAGAGCAGTGGAAAATGGCTGCTGCACCCCCAAGGAGGGCCGAGGAGCCCCTGCAGAA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GCGGGCAAAGAACAGAAGGAGACCAACATCGAATCCATGAAAATGGAGGGCTCCCGGGGCCGGCTGCGGGGTGG  518
                                                      |||  |||.|||.||.||.||.||.|.|..||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATG--GGGATCCTGGAGCGGGTTGTGAGAAGG  30

Query  519  CTTGGGCTGGGAGTCCAGCCTCCGTCAGCGGCCCATGCCGAGGCTCACCTTCCAGGCGGGGGACCCCTACTACA  592
            ..|||||                                                |||.||            |
Sbjct   31  AATGGGC------------------------------------------------GCGTGG------------A  44

Query  593  TC--AGC----AAGCGCAAGCGGGACGAGTGGCTGGCACGCTGGAAAAGGGAGGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTC  660
            ||  |||    ||          ||||||||  ||..||             ||||||||||||||||||||||
Sbjct   45  TCGTAGCCTGAAA----------GACGAGTG--TGATAC-------------GGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTC  93

Query  661  ATTGCAGGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCC  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   94  ATTGCAGGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCC  167

Query  735  TGCTGTGCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTG  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  TGCTGTGCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTG  241

Query  809  GGGACAAGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAG  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  GGGACAAGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAG  315

Query  883  CTGGTGTGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAG  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  CTGGTGTGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAG  389

Query  957  CCGAGCAGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  CCGAGCAGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGC  463

Query 1031  TGATGCCGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  TGATGCCGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCC  537

Query 1105  ATCTACGAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAG  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  ATCTACGAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAG  611

Query 1179  TGACACTGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTG  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  TGACACTGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTG  685

Query 1253  GCCCTAAGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAGTGTACACGGACATGTGGGTGGAA  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  GCCCTAAGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAGTGTACACGGACATGTGGGTGGAA  759

Query 1327  CCTGAGGCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGT  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  CCTGAGGCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGT  833

Query 1401  CAAGGAGATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  CAAGGAGATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGG  907

Query 1475  ACATCTGCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAAC  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  ACATCTGCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAAC  981

Query 1549  TGCAAGAACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTG  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  TGCAAGAACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTG  1055

Query 1623  TGGGGGCCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCT  1696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  TGGGGGCCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCT  1129

Query 1697  TGGTGGGGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGT  1770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  TGGTGGGGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGT  1203

Query 1771  ACCTACGGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATGTTCTTCGCTAATAACCACGACCA  1844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  ACCTACGGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATGTTCTTCGCTAATAACCACGACCA  1277

Query 1845  GGAATTTGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCT  1918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  GGAATTTGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCT  1351

Query 1919  TTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAG  1992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  TTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAG  1425

Query 1993  GTGTGTGAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAG  2066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  GTGTGTGAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAG  1499

Query 2067  CGTCACACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCT  2140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  CGTCACACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCT  1573

Query 2141  CCATCGTCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTG  2214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  CCATCGTCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTG  1647

Query 2215  CATGATGCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGT  2288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  CATGATGCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGT  1721

Query 2289  TAGTGACAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTG  2362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722  TAGTGACAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTG  1795

Query 2363  CACACAGGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGTTGGCATCCACTGTGAATGATAAG  2436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796  CACACAGGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGTTGGCATCCACTGTGAATGATAAG  1869

Query 2437  CTGGAGCTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAAGTGAGGACCATTACTACGAGGTC  2510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870  CTGGAGCTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAAGTGAGGACCATTACTACGAGGTC  1943

Query 2511  AAACTCCATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCA  2584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944  AAACTCCATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCA  2017

Query 2585  CTGAAATGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAG  2658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2018  CTGAAATGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAG  2091

Query 2659  AGACTGCTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTG  2732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2092  AGACTGCTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTG  2165

Query 2733  TGTG  2736
            ||||
Sbjct 2166  TGTG  2169