Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00454
• Subject: XM_011532663.2
• Aligned Length: 2839
• Identities: 2468
• Gaps: 371

Alignment

Query    1  ATGCCCGCCATGCCCTCCAGCGGCCCCGGGGACACCAGCAGCTCTGCTGCGGAGCGGGAGGAGGACCGAAAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGAGAGGAGCAGGAGGAGCCGCGTGGCAAGGAGGAGCGCCAAGAGCCCAGCACCACGGCACGGAAGGTGGGGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCTGGGAGGAAGCGCAAGCACCCCCCGGTGGAAAGCGGTGACACGCCAAAGGACCCTGCGGTGATCTCCAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCCCCATCCATGGCCCAGGACTCAGGCGCCTCAGAGCTATTACCCAATGGGGACTTGGAGAAGCGGAGTGAGCC  296
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGGGACTTGGAGAAGCGGAGTGAGCC  28

Query  297  CCAGCCAGAGGAGGGGAGCCCTGCTGGGGGGCAGAAGGGCGGGGCCCCAGCAGAGGGAGAGGGTGCAGCTGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  CCAGCCAGAGGAGGGGAGCCCTGCTGGGGGGCAGAAGGGCGGGGCCCCAGCAGAGGGAGAGGGTGCAGCTGAGA  102

Query  371  CCCTGCCTGAAGCCTCAAGAGCAGTGGAAAATGGCTGCTGCACCCCCAAGGAGGGCCGAGGAGCCCCTGCAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  CCCTGCCTGAAGCCTCAAGAGCAGTGGAAAATGGCTGCTGCACCCCCAAGGAGGGCCGAGGAGCCCCTGCAGAA  176

Query  445  GCG-----------------------------------------------------------------------  447
            |||                                                                       
Sbjct  177  GCGGGCGGACCTTGGAAATCGCATCCAGCATCCTTATTTTCCAGATGAGGAAACTGAGTCTCGTAGAGAGGAAG  250

Query  448  --------------------------------GGCAAAGAACAGAAGGAGACCAACATCGAATCCATGAAAATG  489
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  TTGCTTCACCGGGGTCTTGTTCCAGTTGGCCCGGCAAAGAACAGAAGGAGACCAACATCGAATCCATGAAAATG  324

Query  490  GAGGGCTCCCGGGGCCGGCTGCGGGGTGGCTTGGGCTGGGAGTCCAGCCTCCGTCAGCGGCCCATGCCGAGGCT  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  GAGGGCTCCCGGGGCCGGCTGCGGGGTGGCTTGGGCTGGGAGTCCAGCCTCCGTCAGCGGCCCATGCCGAGGCT  398

Query  564  CACCTTCCAGGCGGGGGACCCCTACTACATCAGCAAGCGCAAGCGGGACGAGTGGCTGGCACGCTGGAAAAGGG  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  CACCTTCCAGGCGGGGGACCCCTACTACATCAGCAAGCGCAAGCGGGACGAGTGGCTGGCACGCTGGAAAAGGG  472

Query  638  AGGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTCATTGCAGGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAG  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  AGGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTCATTGCAGGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAG  546

Query  712  AAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGTGCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCC  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  AAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGTGCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCC  620

Query  786  TGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACAAGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACG  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  TGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACAAGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACG  694

Query  860  GCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTGTGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTG  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  GCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTGTGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTG  768

Query  934  TCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGCAGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATT  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  TCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGCAGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATT  842

Query 1008  CTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGCCGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACA  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  CTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGCCGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACA  916

Query 1082  AGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTACGAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCG  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  AGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTACGAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCG  990

Query 1156  GTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACACTGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGC  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  GTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACACTGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGC  1064

Query 1230  CCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTAAGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAG  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  CCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTAAGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAG  1138

Query 1304  TGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAGGCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAG  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  TGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAGGCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAG  1212

Query 1378  AGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGAGATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCG  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  AGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGAGATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCG  1286

Query 1452  GCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCTGCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCT  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  GCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCTGCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCT  1360

Query 1526  TCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAGAACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTAC  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  TCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAGAACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTAC  1434

Query 1600  CAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGGCCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTT  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  CAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGGCCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTT  1508

Query 1674  TTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGGGGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACT  1747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  TTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGGGGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACT  1582

Query 1748  GCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTACGGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATG  1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  GCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTACGGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATG  1656

Query 1822  TTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATTTGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAA  1895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  TTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATTTGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAA  1730

Query 1896  GCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGG  1969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731  GCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGG  1804

Query 1970  TGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGTGAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATC  2043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1805  TGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGTGAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATC  1878

Query 2044  ATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCACACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGG  2117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1879  ATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCACACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGG  1952

Query 2118  GGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCGTCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCT  2191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1953  GGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCGTCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCT  2026

Query 2192  TCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGATGCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTT  2265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027  TCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGATGCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTT  2100

Query 2266  GAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGACAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGAT  2339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101  GAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGACAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGAT  2174

Query 2340  TGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACAGGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGT  2413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175  TGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACAGGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGT  2248

Query 2414  TGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAGCTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAA  2487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2249  TGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAGCTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAA  2322

Query 2488  GTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTCCATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGA  2561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2323  GTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTCCATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGA  2396

Query 2562  GAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAATGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCA  2635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2397  GAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAATGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCA  2470

Query 2636  ACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTGCTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCT  2709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2471  ACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTGCTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCT  2544

Query 2710  CCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG  2736
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2545  CCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG  2571