Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00454
• Subject: XM_017003527.1
• Aligned Length: 2736
• Identities: 2067
• Gaps: 669

Alignment

Query    1  ATGCCCGCCATGCCCTCCAGCGGCCCCGGGGACACCAGCAGCTCTGCTGCGGAGCGGGAGGAGGACCGAAAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGAGAGGAGCAGGAGGAGCCGCGTGGCAAGGAGGAGCGCCAAGAGCCCAGCACCACGGCACGGAAGGTGGGGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCTGGGAGGAAGCGCAAGCACCCCCCGGTGGAAAGCGGTGACACGCCAAAGGACCCTGCGGTGATCTCCAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCCCCATCCATGGCCCAGGACTCAGGCGCCTCAGAGCTATTACCCAATGGGGACTTGGAGAAGCGGAGTGAGCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCAGCCAGAGGAGGGGAGCCCTGCTGGGGGGCAGAAGGGCGGGGCCCCAGCAGAGGGAGAGGGTGCAGCTGAGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCTGCCTGAAGCCTCAAGAGCAGTGGAAAATGGCTGCTGCACCCCCAAGGAGGGCCGAGGAGCCCCTGCAGAA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GCGGGCAAAGAACAGAAGGAGACCAACATCGAATCCATGAAAATGGAGGGCTCCCGGGGCCGGCTGCGGGGTGG  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CTTGGGCTGGGAGTCCAGCCTCCGTCAGCGGCCCATGCCGAGGCTCACCTTCCAGGCGGGGGACCCCTACTACA  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  TCAGCAAGCGCAAGCGGGACGAGTGGCTGGCACGCTGGAAAAGGGAGGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTCATTGCA  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  GGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGT  740
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---ATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGT  71

Query  741  GCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  GCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACA  145

Query  815  AGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  AGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTG  219

Query  889  TGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  TGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGC  293

Query  963  AGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  AGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGC  367

Query 1037  CGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  CGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTAC  441

Query 1111  GAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACAC  515

Query 1185  TGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  TGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTA  589

Query 1259  AGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAGTGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  AGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAGTGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAG  663

Query 1333  GCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGA  737

Query 1407  GATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCT  811

Query 1481  GCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  GCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAG  885

Query 1555  AACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGG  959

Query 1629  CCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGG  1033

Query 1703  GGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  GGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTAC  1107

Query 1777  GGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATGTTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATGTTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATT  1181

Query 1851  TGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATG  1255

Query 1925  GAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  GAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGT  1329

Query 1999  GAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCAC  1403

Query 2073  ACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  ACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCG  1477

Query 2147  TCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGAT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  TCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGAT  1551

Query 2221  GCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  GCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGA  1625

Query 2295  CAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  CAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACA  1699

Query 2369  GGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGTTGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  GGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGTTGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAG  1773

Query 2443  CTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAAGTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  CTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAAGTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTC  1847

Query 2517  CATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  CATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAA  1921

Query 2591  TGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  TGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTG  1995

Query 2665  CTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG  2736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG  2067