Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00510
• Subject: NM_001256483.2
• Aligned Length: 1665
• Identities: 1467
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGACGCTGCGCGCGGCCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACGGAGGAGGCCCTGGCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTACCCGGCTTATGAAAGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC  222
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC  24

Query  223  TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG  98

Query  297  AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   99  AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA  172

Query  371  ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  173  ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC  246

Query  445  TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT  320

Query  519  GAAGGCCAGCCCCAGTGAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  321  GAAGGCCAGCCCCAGTGAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAA  394

Query  593  TGGTCACCATCCTGGTCCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395  TGGTCACCATCCTGGTCCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTC  468

Query  667  AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  469  AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG  542

Query  741  GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  543  GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT  616

Query  815  ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT  690

Query  889  GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT  764

Query  963  GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  765  GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC  838

Query 1037  TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839  TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC  912

Query 1111  CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC  986

Query 1185  TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  987  TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC  1060

Query 1259  ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061  ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG  1134

Query 1333  GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135  GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT  1208

Query 1407  GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209  GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG  1282

Query 1481  AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283  AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC  1356

Query 1555  ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1357  ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA  1430

Query 1629  TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG  1665
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431  TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG  1467