Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00510
- Subject:
- XM_017013199.1
- Aligned Length:
- 1665
- Identities:
- 1542
- Gaps:
- 123
Alignment
Query 1 ATGACGCTGCGCGCGGCCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACGCTGCGCGCGGCCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCG 74
Query 75 CACGGAGGAGGCCCTGGCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACGGAGGAGGCCCTGGCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCA 148
Query 149 CTACCCGGCTTATGAAAGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTACCCGGCTTATGAAAGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC 222
Query 223 TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG 296
Query 297 AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA 370
Query 371 ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC 444
Query 445 TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT 518
Query 519 GAAGGCCAGCCCCAGTGAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAA 592
|||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAGGCCAGCCCCAGTG--------------------------------------------------------- 535
Query 593 TGGTCACCATCCTGGTCCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTC 666
||||||||
Sbjct 536 ------------------------------------------------------------------AGCTTCTC 543
Query 667 AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG 617
Query 741 GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT 691
Query 815 ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT 765
Query 889 GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT 839
Query 963 GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC 913
Query 1037 TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC 987
Query 1111 CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC 1061
Query 1185 TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC 1135
Query 1259 ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG 1209
Query 1333 GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT 1283
Query 1407 GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG 1357
Query 1481 AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC 1431
Query 1555 ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432 ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA 1505
Query 1629 TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG 1665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG 1542