Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00523
• Subject: NM_000127.2
• Aligned Length: 2238
• Identities: 2238
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGGCCAAAAAACGCTATTTCATCCTGCTCTCAGCTGGCTCTTGTCTCGCCCTTTTGTTTTATTTCGGAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGGCCAAAAAACGCTATTTCATCCTGCTCTCAGCTGGCTCTTGTCTCGCCCTTTTGTTTTATTTCGGAGG  74

Query   75  CTTGCAGTTTAGGGCATCGAGGAGCCACAGCCGGAGAGAAGAACACAGCGGTAGGAATGGCTTGCACCACCCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTGCAGTTTAGGGCATCGAGGAGCCACAGCCGGAGAGAAGAACACAGCGGTAGGAATGGCTTGCACCACCCCA  148

Query  149  GTCCGGATCATTTCTGGCCCCGCTTCCCGGACGCTCTGCGCCCCTTCGTTCCTTGGGATCAATTGGAAAACGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTCCGGATCATTTCTGGCCCCGCTTCCCGGACGCTCTGCGCCCCTTCGTTCCTTGGGATCAATTGGAAAACGAG  222

Query  223  GATTCCAGCGTGCACATTTCCCCCCGGCAGAAGCGAGATGCCAACTCCAGCATCTACAAAGGCAAGAAGTGCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATTCCAGCGTGCACATTTCCCCCCGGCAGAAGCGAGATGCCAACTCCAGCATCTACAAAGGCAAGAAGTGCCG  296

Query  297  CATGGAGTCCTGCTTCGATTTCACCCTTTGCAAGAAAAACGGCTTCAAAGTCTACGTATACCCACAGCAAAAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATGGAGTCCTGCTTCGATTTCACCCTTTGCAAGAAAAACGGCTTCAAAGTCTACGTATACCCACAGCAAAAAG  370

Query  371  GGGAGAAAATCGCCGAAAGTTACCAAAACATTCTAGCGGCCATCGAGGGCTCCAGGTTCTACACCTCGGACCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAGAAAATCGCCGAAAGTTACCAAAACATTCTAGCGGCCATCGAGGGCTCCAGGTTCTACACCTCGGACCCC  444

Query  445  AGCCAGGCGTGCCTCTTTGTCCTGAGTCTGGATACTTTAGACAGAGACCAGTTGTCACCTCAGTATGTGCACAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCAGGCGTGCCTCTTTGTCCTGAGTCTGGATACTTTAGACAGAGACCAGTTGTCACCTCAGTATGTGCACAA  518

Query  519  TTTGAGATCCAAAGTGCAGAGTCTCCACTTGTGGAACAATGGTAGGAATCATTTAATTTTTAATTTATATTCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTGAGATCCAAAGTGCAGAGTCTCCACTTGTGGAACAATGGTAGGAATCATTTAATTTTTAATTTATATTCCG  592

Query  593  GCACTTGGCCTGACTACACCGAGGACGTGGGGTTTGACATCGGCCAGGCGATGCTGGCCAAAGCCAGCATCAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACTTGGCCTGACTACACCGAGGACGTGGGGTTTGACATCGGCCAGGCGATGCTGGCCAAAGCCAGCATCAGT  666

Query  667  ACTGAAAACTTCCGACCCAACTTTGATGTTTCTATTCCCCTCTTTTCTAAGGATCATCCCAGGACAGGAGGGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGAAAACTTCCGACCCAACTTTGATGTTTCTATTCCCCTCTTTTCTAAGGATCATCCCAGGACAGGAGGGGA  740

Query  741  GAGGGGGTTTTTGAAGTTCAACACCATCCCTCCTCTCAGGAAGTACATGCTGGTATTCAAGGGGAAGAGGTACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGGGGGTTTTTGAAGTTCAACACCATCCCTCCTCTCAGGAAGTACATGCTGGTATTCAAGGGGAAGAGGTACC  814

Query  815  TGACAGGGATAGGATCAGACACCAGGAATGCCTTATATCACGTCCATAACGGGGAGGACGTTGTGCTCCTCACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGACAGGGATAGGATCAGACACCAGGAATGCCTTATATCACGTCCATAACGGGGAGGACGTTGTGCTCCTCACC  888

Query  889  ACCTGCAAGCATGGCAAAGACTGGCAAAAGCACAAGGATTCTCGCTGTGACAGAGACAACACCGAGTATGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCTGCAAGCATGGCAAAGACTGGCAAAAGCACAAGGATTCTCGCTGTGACAGAGACAACACCGAGTATGAGAA  962

Query  963  GTATGATTATCGGGAAATGCTGCACAATGCCACTTTCTGTCTGGTTCCTCGTGGTCGCAGGCTTGGGTCCTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTATGATTATCGGGAAATGCTGCACAATGCCACTTTCTGTCTGGTTCCTCGTGGTCGCAGGCTTGGGTCCTTCA  1036

Query 1037  GATTCCTGGAGGCTTTGCAGGCTGCCTGCGTCCCTGTGATGCTCAGCAATGGATGGGAGTTGCCATTCTCTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATTCCTGGAGGCTTTGCAGGCTGCCTGCGTCCCTGTGATGCTCAGCAATGGATGGGAGTTGCCATTCTCTGAA  1110

Query 1111  GTGATTAATTGGAACCAAGCTGCCGTCATAGGCGATGAGAGATTGTTATTACAGATTCCTTCTACAATCAGGTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGATTAATTGGAACCAAGCTGCCGTCATAGGCGATGAGAGATTGTTATTACAGATTCCTTCTACAATCAGGTC  1184

Query 1185  TATTCATCAGGATAAAATCCTAGCACTTAGACAGCAGACACAATTCTTGTGGGAGGCTTATTTTTCTTCAGTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATTCATCAGGATAAAATCCTAGCACTTAGACAGCAGACACAATTCTTGTGGGAGGCTTATTTTTCTTCAGTTG  1258

Query 1259  AGAAGATTGTATTAACTACACTAGAGATTATTCAGGACAGAATATTCAAGCACATATCACGTAACAGTTTAATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAAGATTGTATTAACTACACTAGAGATTATTCAGGACAGAATATTCAAGCACATATCACGTAACAGTTTAATA  1332

Query 1333  TGGAACAAACATCCTGGAGGATTGTTCGTACTACCACAGTATTCATCTTATCTGGGAGATTTTCCTTACTACTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGGAACAAACATCCTGGAGGATTGTTCGTACTACCACAGTATTCATCTTATCTGGGAGATTTTCCTTACTACTA  1406

Query 1407  TGCTAATTTAGGTTTAAAGCCCCCCTCCAAATTCACTGCAGTCATCCATGCGGTGACCCCCCTGGTCTCTCAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTAATTTAGGTTTAAAGCCCCCCTCCAAATTCACTGCAGTCATCCATGCGGTGACCCCCCTGGTCTCTCAGT  1480

Query 1481  CCCAGCCAGTGTTGAAGCTTCTCGTGGCTGCAGCCAAGTCCCAGTACTGTGCCCAGATCATAGTTCTATGGAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCAGCCAGTGTTGAAGCTTCTCGTGGCTGCAGCCAAGTCCCAGTACTGTGCCCAGATCATAGTTCTATGGAAT  1554

Query 1555  TGTGACAAGCCCCTACCAGCCAAACACCGCTGGCCTGCCACTGCTGTGCCTGTCGTCGTCATTGAAGGAGAGAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGACAAGCCCCTACCAGCCAAACACCGCTGGCCTGCCACTGCTGTGCCTGTCGTCGTCATTGAAGGAGAGAG  1628

Query 1629  CAAGGTTATGAGCAGCCGTTTTCTGCCCTACGACAACATCATCACAGACGCCGTGCTCAGCCTTGACGAGGACA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAGGTTATGAGCAGCCGTTTTCTGCCCTACGACAACATCATCACAGACGCCGTGCTCAGCCTTGACGAGGACA  1702

Query 1703  CGGTGCTTTCAACAACAGAGGTGGATTTCGCCTTCACAGTGTGGCAGAGCTTCCCTGAGAGGATTGTGGGGTAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGTGCTTTCAACAACAGAGGTGGATTTCGCCTTCACAGTGTGGCAGAGCTTCCCTGAGAGGATTGTGGGGTAC  1776

Query 1777  CCCGCGCGCAGCCACTTCTGGGATAACTCTAAGGAGCGGTGGGGATACACATCAAAGTGGACGAACGACTACTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCGCGCGCAGCCACTTCTGGGATAACTCTAAGGAGCGGTGGGGATACACATCAAAGTGGACGAACGACTACTC  1850

Query 1851  CATGGTGTTGACAGGAGCTGCTATTTACCACAAATATTATCACTACCTATACTCCCATTACCTGCCAGCCAGCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CATGGTGTTGACAGGAGCTGCTATTTACCACAAATATTATCACTACCTATACTCCCATTACCTGCCAGCCAGCC  1924

Query 1925  TGAAGAACATGGTGGACCAATTGGCCAATTGTGAGGACATTCTCATGAACTTCCTGGTGTCTGCTGTGACAAAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGAAGAACATGGTGGACCAATTGGCCAATTGTGAGGACATTCTCATGAACTTCCTGGTGTCTGCTGTGACAAAA  1998

Query 1999  TTGCCTCCAATCAAAGTGACCCAGAAGAAGCAGTATAAGGAGACAATGATGGGACAGACTTCTCGGGCTTCCCG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTGCCTCCAATCAAAGTGACCCAGAAGAAGCAGTATAAGGAGACAATGATGGGACAGACTTCTCGGGCTTCCCG  2072

Query 2073  TTGGGCTGACCCTGACCACTTTGCCCAGCGACAGAGCTGCATGAATACGTTTGCCAGCTGGTTTGGCTACATGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTGGGCTGACCCTGACCACTTTGCCCAGCGACAGAGCTGCATGAATACGTTTGCCAGCTGGTTTGGCTACATGC  2146

Query 2147  CGCTGATCCACTCTCAGATGAGGCTCGACCCCGTCCTCTTTAAAGACCAGGTCTCTATTTTGAGGAAGAAATAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CGCTGATCCACTCTCAGATGAGGCTCGACCCCGTCCTCTTTAAAGACCAGGTCTCTATTTTGAGGAAGAAATAC  2220

Query 2221  CGAGACATTGAGCGACTT  2238
            ||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CGAGACATTGAGCGACTT  2238