Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00547
• Subject: XM_017014470.1
• Aligned Length: 1397
• Identities: 1317
• Gaps: 67

Alignment

Query    1  ATGAGTAGAATCAATAAGAACGTGGTTTTGGCCCTTTTAACGCTGACAAGTTCTGCATTTCTGCTGTTTCAGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTAGAATCAATAAGAACGTGGTTTTGGCCCTTTTAACGCTGACAAGTTCTGCATTTCTGCTGTTTCAGTT  74

Query   75  GTACTACTACAAGCACTATTTATCAACAAAGAATGGAGCTGGTTTGTCAAAATCCAAAGGAAGCCGAATTGGAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTACTACTACAAGCACTATTTATCAACAAAGAATGGAGCTGGTTTGTCAAAATCCAAAGGAAGCCGAATTGGAT  148

Query  149  TTGATAGCACACAGTGGCGTGCAGTTAAAAAATTTATTATGTTAACATCCAACCAAAATGTACCAGTGTTTCTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGATAGCACACAGTGGCGTGCAGTTAAAAAATTTATTATGTTAACATCCAACCAAAATGTACCAGTGTTTCTT  222

Query  223  ATTGATCCTTTGATACTGGAATTGATTAATAAGAACTTTGAACAAGTCAAAAATACTTCTCATGGCTCTACTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGATCCTTTGATACTGGAATTGATTAATAAGAACTTTGAACAAGTCAAAAATACTTCTCATGGCTCTACTTC  296

Query  297  ACAATGCAAGTTTTTCTGTGTTCCAAGAGACTTTACTGCATTTGCACTGCAGTATCACCTATGGAAGAATGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAATGCAAGTTTTTCTGTGTTCCAAGAGACTTTACTGCATTTGCACTGCAGTATCACCTATGGAAGAATGAGG  370

Query  371  AAGGCTGGTTTCGGATAGCTGAGAATATGGGATTTCAGTGCCTAAAGATTGAGAGTAAAGATCCCCGGCTAGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGCTGGTTTCGGATAGCTGAGAATATGGGATTTCAGTGCCTAAAGATTGAGAGTAAAGATCCCCGGCTAGAC  444

Query  445  GGGATAGACTCACTCTCTGGAACTGAAATCCCCCTGCACTATATCTGCAAACTGGCCACTCATGCGATCCACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGATAGACTCACTCTCTGGAACTGAAATCCCCCTGCACTATATCTGCAAACTGGCCACTCATGCGATCCACTT  518

Query  519  GGTAGTCTTTCATGAGAGGAGTGGCAACTACCTCTGGCACGGCCACTTGAGACTTAAAGAACACATTGACAGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTAGTCTTTCATGAGAGGAGTGGCAACTACCTCTGGCACGGCCACTTGAGACTTAAAGAACACATTGACAGGA  592

Query  593  AATTTGTTCCCTTCCGAAAGTTACAGTTTGGTCGTTATCCAGGAGCTTTTGACAGGCCAGAGTTACAGCAAGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATTTGTTCCCTTCCGAAAGTTACAGTTTGGTCGTTATCCAGGAGCTTTTGACAGGCCAGAGTTACAGCAAGTT  666

Query  667  ACTGTTGATGGACTGGAAGTTCTCATTCCAAAGGATCCAATGCACTTTGTAGAAGAAGTACCACACTCTAGGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGTTGATGGACTGGAAGTTCTCATTCCAAAGGATCCAATGCACTTTGTAGAAGAAGTACCACACTCTAGGTT  740

Query  741  TATTGAGTGTAGGTATAAAGAAGCTCGAGCATTCTTTCAGCAGTACCTTGATGATAACACTGTGGAAGCTGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATTGAGTGTAGGTATAAAGAAGCTCGAGCATTCTTTCAGCAGTACCTTGATGATAACACTGTGGAAGCTGTGG  814

Query  815  CCTTTCGGAAGAGTGCAAAGGAATTACTGCAACTAGCAGCGAAAACATTAAACAAATTGGGAGTACCATTCTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTTTCGGAAGAGTGCAAAGGAATTACTGCAACTAGCAGCGAAAACATTAAACAAATTGGGAGTACCATTCTGG  888

Query  889  CTGAGCAGTGGAACTTGTCTAGGATGGTATCGACAATGCAACATTATTCCTTATAGCAAAGATGTTGACCTAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGAGCAGTGGAACTTGTCTAGGATGGTATCGACAATGCAACATTATTCCTTATAGCAAAGATGTTGACCTAGG  962

Query  963  AATTTTTATACAAGATTACAAATCTGATATTATTTTAGCATTTCAGGATGCAGGACTTCCGCTCAAACACAAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATTTTTATACAAGATTACAAATCTGATATTATTTTAGCATTTCAGGATGCAGGACTTCCGCTCAAACACAAAT  1036

Query 1037  TTGGGAAGGTAGAAGACAGCTTGGAACTATCCTTCCAGGGAAAAGATGATGTAAAACTTGATGTTTTTTTCTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGGGAAGGTAGAAGACAGCTTGGAACTATCCTTCCAGGGAAAAGATGATGTAAAACTTGATGTTTTTTTCTTC  1110

Query 1111  TATGAAGAAACTGATCACATGTGGAATGGAGGCACTCAGGCCAAAACAGGAAAAAAATTCAAATACCTGTTTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGAAGAAACTGATCACATGTGGAATGGAGGCACTCAGGCCAAAACAGGAAAAAAATTCAAATACCTGTTTCC  1184

Query 1185  GAAGTTTACACTGTGCTGGACTGAGTTTGTAGACATGAAGGTCCATGTACCCTGTGAAACCCTCGAATACATTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGTTTACACTGTGCTGGACTGAGTTTGTAGACATGAAGGTCCATGTACCCTGTGAAACCCTCGAATACATTG  1258

Query 1259  AAGCCAACTATGGTAAGACCTGGAAGATTCCTGT---AAAGACGTGG-GACTGGAAGCGCTCTCCT------CC  1322
            ||||||||||||  |.|||.|.||||||..|.||   |.||  .||| ||.||||||.| |.|.||      ||
Sbjct 1259  AAGCCAACTATG--ATGACTTAGAAGATGACAGTCTCATAG--TTGGAGAGTGGAAGAG-TTTGCTTTGGAGCC  1327

Query 1323  CAA--TGTGCAACC--CAATGGAATCTGGCCTATTTCTGAGTGGGATGAGGTTATCCAGTTATAT  1383
            |||  ||.||||||  |                                                
Sbjct 1328  CAAACTGGGCAACCGTC------------------------------------------------  1344