Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00548
- Subject:
- NM_001135822.2
- Aligned Length:
- 1257
- Identities:
- 1059
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCTGGCCTGGCACAGTGCCCGCTGCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT 24
Query 223 GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT 98
Query 297 GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT 172
Query 371 ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC 246
Query 445 CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA 320
Query 519 TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG 394
Query 593 CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG 468
Query 667 ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG 542
Query 741 CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT 616
Query 815 TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG 690
Query 889 ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGATGATTACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGATGATTACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGAC 764
Query 963 CGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 CGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTC 838
Query 1037 CAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGAGGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 CAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGAGGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTA 912
Query 1111 TATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGGAAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 TATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGGAAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCAT 986
Query 1185 TGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGGCTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 TGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGGCTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG 1059