Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00548
• Subject: XM_005244963.1
• Aligned Length: 1257
• Identities: 1059
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCTGGCCTGGCACAGTGCCCGCTGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT  222
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT  24

Query  223  GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT  98

Query  297  GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   99  GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT  172

Query  371  ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  173  ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC  246

Query  445  CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA  320

Query  519  TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  321  TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG  394

Query  593  CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395  CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG  468

Query  667  ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  469  ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG  542

Query  741  CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  543  CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT  616

Query  815  TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG  690

Query  889  ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGATGATTACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGATGATTACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGAC  764

Query  963  CGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  765  CGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTC  838

Query 1037  CAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGAGGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839  CAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGAGGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTA  912

Query 1111  TATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGGAAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  TATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGGAAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCAT  986

Query 1185  TGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGGCTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG  1257
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  987  TGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGGCTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG  1059