Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00548
- Subject:
- XM_024454072.1
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 1059
- Gaps:
- 303
Alignment
Query 1 ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCTGGCCTGGCACAGTGCCCGCTGCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT 24
Query 223 GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT 98
Query 297 GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT 172
Query 371 ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC 246
Query 445 CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA 320
Query 519 TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG 394
Query 593 CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG 468
Query 667 ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG 542
Query 741 CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT 616
Query 815 TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG 690
Query 889 ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATT----------------------------------------- 921
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGTAAGAAGGCAGGAGGCAGTAGCAGAGAACAGGCACCA 764
Query 922 ----------------------------------------------------------------CAGGATGATT 931
||||||||||
Sbjct 765 GCTTCACTCCTCCTCTGCCCAGGAACCTCATCCTTCCTCTTTTGCTGCCCTCCCCCTCCCTGCCCAGGATGATT 838
Query 932 ACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGACCGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGG 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 ACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGACCGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGG 912
Query 1006 CTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTCCAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 CTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTCCAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGA 986
Query 1080 GGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTATATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGG 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 GGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTATATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGG 1060
Query 1154 AAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGG 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 AAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGG 1134
Query 1228 CTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG 1257
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG 1164