Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00560
• Subject: NM_001321948.2
• Aligned Length: 756
• Identities: 639
• Gaps: 117

Alignment

Query   1  ATGGTAAAACCGGTGCCCCTCTTCAGGAGAACTGATTTCAAATTATTATTATGCAACCACAAGGATCTCTTCTT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TCTCAGGGTGTCTAAGCTGCTGGATTGCTTTTCGCCCAAATCAATGTGGTTTCTTTGGAACATTTTCAGCAAAG  148
                                                      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------------------ATGTGGTTTCTTTGGAACATTTTCAGCAAAG  31

Query 149  GAACGCATATGCTGCAGTGTCTTTGTGGCAAGAGTCTTAAGAAAAACAAGAACCCAACTGATCCCCAGCTCAAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  32  GAACGCATATGCTGCAGTGTCTTTGTGGCAAGAGTCTTAAGAAAAACAAGAACCCAACTGATCCCCAGCTCAAG  105

Query 223  GGTATAGTGACCAGGTTATATTGCAGGCAAGGCTACTACTTGCAAATGCACCCCGATGGAGCTCTCGATGGAAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106  GGTATAGTGACCAGGTTATATTGCAGGCAAGGCTACTACTTGCAAATGCACCCCGATGGAGCTCTCGATGGAAC  179

Query 297  CAAGGATGACAGCACTAATTCTACACTCTTCAACCTCATACCAGTGGGACTACGTGTTGTTGCCATCCAGGGAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180  CAAGGATGACAGCACTAATTCTACACTCTTCAACCTCATACCAGTGGGACTACGTGTTGTTGCCATCCAGGGAG  253

Query 371  TGAAAACAGGGTTGTATATAGCCATGAATGGAGAAGGTTACCTCTACCCATCAGAACTTTTTACCCCTGAATGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254  TGAAAACAGGGTTGTATATAGCCATGAATGGAGAAGGTTACCTCTACCCATCAGAACTTTTTACCCCTGAATGC  327

Query 445  AAGTTTAAAGAATCTGTTTTTGAAAATTATTATGTAATCTACTCATCCATGTTGTACAGACAACAGGAATCTGG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328  AAGTTTAAAGAATCTGTTTTTGAAAATTATTATGTAATCTACTCATCCATGTTGTACAGACAACAGGAATCTGG  401

Query 519  TAGAGCCTGGTTTTTGGGATTAAATAAGGAAGGGCAAGCTATGAAAGGGAACAGAGTAAAGAAAACCAAACCAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402  TAGAGCCTGGTTTTTGGGATTAAATAAGGAAGGGCAAGCTATGAAAGGGAACAGAGTAAAGAAAACCAAACCAG  475

Query 593  CAGCTCATTTTCTACCCAAGCCATTGGAAGTTGCCATGTACCGAGAACCATCTTTGCATGATGTTGGGGAAACG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476  CAGCTCATTTTCTACCCAAGCCATTGGAAGTTGCCATGTACCGAGAACCATCTTTGCATGATGTTGGGGAAACG  549

Query 667  GTCCCGAAGCCTGGGGTGACGCCAAGTAAAAGCACAAGTGCGTCTGCAATAATGAATGGAGGCAAACCAGTCAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550  GTCCCGAAGCCTGGGGTGACGCCAAGTAAAAGCACAAGTGCGTCTGCAATAATGAATGGAGGCAAACCAGTCAA  623

Query 741  CAAGAGTAAGACAACA  756
           ||||||||||||||||
Sbjct 624  CAAGAGTAAGACAACA  639