Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00562
• Subject: XM_011521054.3
• Aligned Length: 1717
• Identities: 1428
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA  74

Query   75  GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG  148

Query  149  ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG  222

Query  223  GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT  296

Query  297  AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA  370

Query  371  TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG  444

Query  445  GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT  518

Query  519  GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC  592

Query  593  GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC  666

Query  667  CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA  740

Query  741  GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG  814

Query  815  GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC  888

Query  889  CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT  962

Query  963  GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG  1036

Query 1037  GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG  1110

Query 1111  ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG  1184

Query 1185  GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA  1258

Query 1259  ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGTTATACTCAGCGTGTGGTTGGAAATGGAATCAAAGCCCAGTCTGGAAATCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGTTATACTCAGCGTGTGGTTGGAAATGGAATCAAAGCCCAGTCTGGAAATCCT  1332

Query 1333  GAAGTCAAAGTCAAAGGAATTGATCCTGTGATAAATCAGATTATTGATAAACTGAAGCATGTTGTTCAGTTGTT  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 1333  GAAGTCAAAGTCAAAGGAATTGATCCTGTGATAAATCAGATTATTGATAAACTGAAGCATGTTGTTCAG-----  1401

Query 1407  ACAGGGTAGATCACCCAAACCTGACAAGTGGGAA-CTTCTTCAGCTGGGCAGTGGTGGAGGCATGGTTGAACAA  1479
                    ||            .||||.|.|||| ||| |||                 ||.|||..|.|.|..
Sbjct 1402  --------GA------------AACAAATTGGAAGCTT-TTC-----------------GGAATGAATCATCTT  1437

Query 1480  GTCAGTGGGGACTGTGATGATGAAGATGGTTGCGGGGGATCAGGAAGTGGAGAAGTCAAGAGGACACTGAAGAT  1553
            .||                                                                       
Sbjct 1438  ATC-----------------------------------------------------------------------  1440

Query 1554  CACAGACTGGATGCCAGATGATATGAACTTCAGTGATGTAAAGCAAATCCATCAAACAGACACTGGCAGTACTT  1627
                                                                                      
Sbjct 1441  --------------------------------------------------------------------------  1440

Query 1628  TAGACACAACAGGAGCAGGATGTGCAGTGGCGACTGAATCTATGACATTCACTCTGATAAGTGTGGTGATGTTA  1701
                                                                                      
Sbjct 1441  --------------------------------------------------------------------------  1440

Query 1702  CTTCCCGGGATTTGG  1716
                           
Sbjct 1441  ---------------  1440