Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00562
• Subject: XM_011521059.2
• Aligned Length: 1724
• Identities: 1319
• Gaps: 400

Alignment

Query    1  ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA  74

Query   75  GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG  148

Query  149  ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG  222

Query  223  GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT  296

Query  297  AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA  370

Query  371  TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG  444

Query  445  GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT  518

Query  519  GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC  592

Query  593  GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC  666

Query  667  CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA  740

Query  741  GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG  814

Query  815  GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC  888

Query  889  CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT  962

Query  963  GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG  1036

Query 1037  GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG  1110

Query 1111  ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG  1184

Query 1185  GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA  1258

Query 1259  ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGTTATACTCAG----CGTG-TGGTTGGAAATG--GAATCAAAGCCCAGTCTG-  1324
            ||||||||||||||||||||||||   ..|||    ||.| |||  |||.|||  |.||||||    ||  || 
Sbjct 1259  ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGTT---GGCAGGTTTCGAGCTGG--GGAGATGATGGATCAAA----AG--TGA  1321

Query 1325  GAAATCCTGAAGTCAAAGTCAAAGGAATTGATCCTGTGATAAATCAGATTATTGATAAACTGAAGCATGTTGTT  1398
            ||||    ||||   |||                                                        
Sbjct 1322  GAAA----GAAG---AAG--------------------------------------------------------  1332

Query 1399  CAGTTGTTACAGGGTAGATCACCCAAACCTGACAAGTGGGAACTTCTTCAGCTGGGCAGTGGTGGAGGCATGGT  1472
                                                                                      
Sbjct 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332

Query 1473  TGAACAAGTCAGTGGGGACTGTGATGATGAAGATGGTTGCGGGGGATCAGGAAGTGGAGAAGTCAAGAGGACAC  1546
                                                                                      
Sbjct 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332

Query 1547  TGAAGATCACAGACTGGATGCCAGATGATATGAACTTCAGTGATGTAAAGCAAATCCATCAAACAGACACTGGC  1620
                                                                                      
Sbjct 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332

Query 1621  AGTACTTTAGACACAACAGGAGCAGGATGTGCAGTGGCGACTGAATCTATGACATTCACTCTGATAAGTGTGGT  1694
                                                                                      
Sbjct 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332

Query 1695  GATGTTACTTCCCGGGATTTGG  1716
                                  
Sbjct 1333  ----------------------  1332