Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00564
- Subject:
- XM_006538544.3
- Aligned Length:
- 1589
- Identities:
- 1317
- Gaps:
- 40
Alignment
Query 1 ATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAATTGGAGCCGGTGGCCACGGCCAAGGAGGATGCTGGCCTGGAAGGGGACTT 74
|||||||||||||||||||||||.||||||||.| |..||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAGTTGGAGCCTG------CATCCAAGGAGGATGTGGGCCTGGAAGGGGACTT 68
Query 75 CAGAAGCTACGGGGCAGCAGACCACTATGGGCCTGACCCCACT-AAGGCCCGGCCTGCATCC-TCATTTGCCCA 146
|.|.|||.|...|||.|.|||.|.||||...|||||||||||| |||| ||||.||.|.||| ||.||
Sbjct 69 CCGGAGCCAAACGGCTGAAGAACGCTATTTCCCTGACCCCACTCAAGG-CCGGACTTCGTCCGTCTTT------ 135
Query 147 CATCCCCAACTACAGCAACTTCTCCTCTCAGGCCATCAACCCTGGCTTCCTTGATAGTGGCACCATCAGGGGTG 220
.|||||.|||.||.|||||..|||||..|.|.|||||.|||.||..|..
Sbjct 136 -------------------------CCTCAGCCCACCAGCCCTGCTTTCCTCAACACTGGCAACATGAGAAGCA 184
Query 221 TGTCAGGGATTGGGGTGACCCTGTTCATTGCCCTGTATGACTATGAGGCTCGAACTGAGGATGACCTCACCTTC 294
|.|||||||..||.||||||.|.|||.|.||||||||.|||||||||||..|.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 185 TCTCAGGGACCGGAGTGACCATATTCGTCGCCCTGTACGACTATGAGGCCAGGACAGGGGATGACCTCACCTTC 258
Query 295 ACCAAGGGCGAGAAGTTCCACATCCTGAACAATACTGAAGGTGACTGGTGGGAGGCTCGGTCTCTCAGCTCCGG 368
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||...||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 259 ACCAAAGGCGAGAAGTTCCACATCCTGAACAATACGGAGTATGACTGGTGGGAGGCTCGCTCCCTGAGCTCCGG 332
Query 369 AAAAACTGGCTGCATTCCCAGCAACTACGTGGCCCCTGTTGACTCAATCCAAGCTGAAGAGTGGTACTTTGGAA 442
|.|.|..||||...|||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 333 ACACAGAGGCTATGTTCCCAGCAACTATGTTGCTCCTGTGGATTCCATCCAGGCTGAAGAGTGGTACTTCGGAA 406
Query 443 AGATTGGGAGAAAGGATGCAGAGAGGCAGCTGCTTTCACCAGGCAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAA 516
||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 AGATCAGTAGAAAGGATGCAGAGAGGCAGCTTCTGTCCTCTGGTAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAA 480
Query 517 AGCGAGACCACCAAAGGTGCCTACTCCCTGTCCATCCGGGACTGGGATCAGACCAGAGGCGATCATGTGAAGCA 590
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||||..|.|||||
Sbjct 481 AGCGAGACCACCAAAGGGGCCTACTCCCTGTCCATCCGTGACTGGGACCAGAACAGAGGCGATCACATAAAGCA 554
Query 591 TTACAAGATCCGCAAACTGGACATGGGCGGCTACTACATCACCACACGGGTTCAGTTCAACTCGGTGCAGGAGC 664
|||.||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||..||||..|.|||||.|
Sbjct 555 TTATAAGATCCGAAAGCTGGACACGGGCGGCTACTACATCACCACACGGGCCCAGTTTGACTCCATACAGGACC 628
Query 665 TGGTGCAGCACTACATGGAGGTGAATGACGGGCTGTGCAACCTGCTCATCGCGCCCTGCACCATCATGAAGCCG 738
|.||||.||||||||||||.||||||||.||.||||||.||.||||.|..|||||.||.||||.||..|||||.
Sbjct 629 TAGTGCGGCACTACATGGAAGTGAATGATGGTCTGTGCTACTTGCTTACGGCGCCTTGTACCACCACTAAGCCC 702
Query 739 CAGACGCTGGGCCTGGCCAAGGACGCCTGGGAGATCAGCCGCAGCTCCATCACGCTGGAGCGCCGGCTGGGCAC 812
|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||..|||.|.||||||..|.|||||.|||.||||||||||
Sbjct 703 CAGACTCTAGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCGACCGGAACTCCATAGCACTGGAACGCAGGCTGGGCAC 776
Query 813 CGGCTGCTTCGGGGATGTGTGGCTGGGCACGTGGAACGGCAGCACTAAGGTGGCGGTGAAGACGCTGAAGCCGG 886
|||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 777 CGGCTGCTTTGGAGATGTGTGGCTGGGCACATGGAACTGCAGCACAAAGGTGGCAGTGAAGACGCTGAAGCCGG 850
Query 887 GCACCATGTCCCCGAAGGCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGGTCATGAAGCTGCTGCGGCACGACAAGCTGGTGCAG 960
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 851 GCACCATGTCCCCGAAGGCATTCCTGGAGGAGGCACAGATCATGAAGCTGCTGAGGCACGACAAGCTGGTGCAG 924
Query 961 CTGTACGCCGTGGTGTCGGAGGAGCCCATCTACATCGTGACCGAGTTCATGTGTCACGGCAGCTTGCTGGATTT 1034
|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||||||||
Sbjct 925 CTGTATGCGGTGGTGTCGGAGGAACCCATTTATATTGTGACAGAGTTCATGTGCTATGGTAGCTTGCTGGATTT 998
Query 1035 TCTCAAGAACCCAGAGGGCCAGGATTTGAGGCTGCCCCAATTGGTGGACATGGCAGCCCAGGTAGCTGAGGGCA 1108
.||.|||.|.|.|||.||.|||.|.||||.|||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 999 CCTAAAGGATCGAGAAGGTCAGAACTTGATGCTGCCCCATCTAGTGGACATGGCTGCCCAGGTAGCCGAGGGCA 1072
Query 1109 TGGCCTACATGGAACGCATGAACTACATTCACCGCGACCTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTTGGGGAGCGGCTG 1182
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||....||.
Sbjct 1073 TGGCCTACATGGAACGCATGAACTATATCCACCGAGACTTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTGGGGGAATACCTA 1146
Query 1183 GCGTGCAAGATCGCAGACTTTGGCTTGGCGCGTCTCATCAAGGACGATGAGTACAACCCCTGCCAAGGTTCCAA 1256
...|||||||||||.|||||.||..||||.||.|||||..|||||.|||||||.||||||...|||||..||||
Sbjct 1147 ATATGCAAGATCGCTGACTTCGGGCTGGCACGCCTCATAGAGGACAATGAGTATAACCCCCAACAAGGAACCAA 1220
Query 1257 GTTCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAAGCTGCCCTCTTTGGCAGATTCACCATCAAGTCAGACGTGTGGTCCT 1330
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||
Sbjct 1221 GTTCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAGGCCGCCCTCTTTGGCAGATTCACTGTCAAATCAGACGTGTGGTCCT 1294
Query 1331 TTGGGATCCTGCTCACTGAGCTCATCACCAAGGGCCGAATCCCCTACCCAGGCATGAATAAACGGGAAGTGTTG 1404
|||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||.|.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1295 TTGGGATTCTGCTCACTGAACTGATCACCAAGGGCAGAGTTCCCTACCCAGGTATGAACAACCGGGAAGTGTTG 1368
Query 1405 GAACAGGTGGAGCAGGGCTACCACATGCCGTGCCCTCCAGGCTGCCCAGCATCCCTGTACGAGGCCATGGAACA 1478
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||.||||||.||
Sbjct 1369 GAACAGGTGGAGCATGGCTACCACATGCCGTGCCCTCCAGGATGTCCTGCATCCCTGTATGAGGTCATGGAGCA 1442
Query 1479 GACCTGGCGTCTGGACCCGGAGGAGAGGCCTACCTTCGAGTACCTGCAGTCCTTCCTGGAGGACTACTTCACCT 1552
|.|.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1443 GGCGTGGCGCCTGGATCCAGAGGAGAGGCCCACCTTTGAGTACCTGCAGTCTTTCCTGGAAGACTATTTCACCT 1516
Query 1553 CCGCTGAACCACAGTACCAGCCCGGGGATCAGACA 1587
||.|.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1517 CCACAGAACCACAGTACCAGCCTGGAGACCAGACA 1551