Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00567
- Subject:
- XM_006527801.1
- Aligned Length:
- 1088
- Identities:
- 724
- Gaps:
- 319
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------ATGGCGGAGAAGTTTGACTGCCACTA 26
|||.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGGCTTCTCAAAGACACTCAGGTCCCTCCAGCTATAAGGTGGGCACCATGTCGGAGAAGTTCGACTGTCACTA 74
Query 27 CTGCAGGGATCCCTTGCAGGGGAAGAAGTATGTGCAAAAGGATGGCCACCACTGCTGCCTGAAATGCTTTGACA 100
|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CTGCAGGGACCCCTTGCAGGGGAAGAAGTACGTGCAGAAGGATGGCCGTCACTGCTGCCTGAAGTGCTTTGACA 148
Query 101 AGTTCTGTGCCAACACCTGTGTGGAATGCCGCAAGCCCATCGGTGCGGACTCCAAGGAGGTGCACTATAAGAAC 174
|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 149 AGTTCTGCGCCAACACCTGCGTGGACTGCCGCAAGCCCATAAGCGCTGATGCCAAGGAGGTGCATTATAAGAAT 222
Query 175 CGCTTCTGGCATGACACCTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCCTTGGCCAATGAGACCTTTGTGGCCAA 248
||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 223 CGCTACTGGCACGACAACTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCCTTGGCCAGTGAGACCTTTGTGTCCAA 296
Query 249 GGACAACAAGATCCTGTGCAACAAGTGCACCACTCGGGAGGACTCCCCCAAGTGCAAGGGGTGCTTCAAGGCCA 322
|||...||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 GGATGGCAAGATCCTGTGCAACAAGTGCGCTACTCGGGAGGACTCCCCCAGGTGCAAAGGGTGCTTCAAGGCCA 370
Query 323 TTGTGGCAGGAGATCAAAACGTGGAGTACAAGGGGACCGTCTGGCACAAAGACTGCTTCACCTGTAGTAACTGC 396
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 371 TTGTGGCAGGAGACCAGAACGTGGAGTACAAGGGCACCGTCTGGCATAAAGACTGCTTCACCTGCAGCAACTGC 444
Query 397 AAGCAAGTCATCGGGACTGGAAGCTTCTTCCCTAAAGGGGAGGACTTCTACTGCGTGACTTGCCATGAGACCAA 470
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGCAAGTCATTGGGACCGGAAGCTTCTTCCCGAAAGGGGAGGACTTCTACTGTGTGACTTGCCATGAGACCAA 518
Query 471 GTTTGCCAAGCATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGGAATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGC 544
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTCGCCAAACATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGGAATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGC 592
Query 545 ATGCCGATTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGCAGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAG 618
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCCGAGTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGCAGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAG 666
Query 619 TATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCTGGATGCAAGAACCCCATCACT----- 687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCTGGATGCAAGAACCCCATCACTGGGAA 740
Query 688 -------------------------------------------------------------------------- 687
Sbjct 741 AAGGACTGTGTCAAGAGTGAGCCACCCAGTCTCTAAAGCTAGGAAGTCCCCAGTGTGCCACGGGAAACGCTTGC 814
Query 688 -------------------------------------------------------------------------- 687
Sbjct 815 CTCTCACCCTGTTTCCCAGCGCCAACCTCCGGGGCAGGCATCCGGGTGGAGAGAGGACTTGTCCCTCGTGGGTG 888
Query 688 -----------------------------------------------GGGTTTGGTAAAGGCTCCAGTGTGGTG 714
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGGTTCTTTATAGAAAAAATCGAAGCTTAGCAGCTCCTCGAGGCCCGGGTTTGGTAAAGGCTCCAGTGTGGTG 962
Query 715 GCCTATGAAGGACAATCCTGGCACGACTACTGCTTCCACTGCAAAAAATGCTCCGTGAATCTGGCCAACAAGCG 788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCTATGAAGGACAATCCTGGCACGACTACTGCTTCCACTGCAAAAAATGCTCCG------------------- 1017
Query 789 CTTTGTTTTCCACCAGGAGCAAGTGTATTGTCCCGACTGTGCCAAAAAGCTG 840
Sbjct 1018 ---------------------------------------------------- 1017