Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00580
• Subject: XM_011535014.1
• Aligned Length: 2169
• Identities: 2032
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGGTCAGCTACTGGGACACCGGGGTCCTGCTGTGCGCGCTGCTCAGCTGTCTGCTTCTCACAGGATCTAGTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCAGCTACTGGGACACCGGGGTCCTGCTGTGCGCGCTGCTCAGCTGTCTGCTTCTCACAGGATCTAGTTC  74

Query   75  AGGTTCAAAATTAAAAGATCCTGAACTGAGTTTAAAAGGCACCCAGCACATCATGCAAGCAGGCCAGACACTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGTTCAAAATTAAAAGATCCTGAACTGAGTTTAAAAGGCACCCAGCACATCATGCAAGCAGGCCAGACACTGC  148

Query  149  ATCTCCAATGCAGGGGGGAAGCAGCCCATAAATGGTCTTTGCCTGAAATGGTGAGTAAGGAAAGCGAAAGGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCTCCAATGCAGGGGGGAAGCAGCCCATAAATGGTCTTTGCCTGAAATGGTGAGTAAGGAAAGCGAAAGGCTG  222

Query  223  AGCATAACTAAATCTGCCTGTGGAAGAAATGGCAAACAATTCTGCAGTACTTTAACCTTGAACACAGCTCAAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCATAACTAAATCTGCCTGTGGAAGAAATGGCAAACAATTCTGCAGTACTTTAACCTTGAACACAGCTCAAGC  296

Query  297  AAACCACACTGGCTTCTACAGCTGCAAATATCTAGCTGTACCTACTTCAAAGAAGAAGGAAACAGAATCTGCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAACCACACTGGCTTCTACAGCTGCAAATATCTAGCTGTACCTACTTCAAAGAAGAAGGAAACAGAATCTGCAA  370

Query  371  TCTATATATTTATTAGTGATACAGGTAGACCTTTCGTAGAGATGTACAGTGAAATCCCCGAAATTATACACATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTATATATTTATTAGTGATACAGGTAGACCTTTCGTAGAGATGTACAGTGAAATCCCCGAAATTATACACATG  444

Query  445  ACTGAAGGAAGGGAGCTCGTCATTCCCTGCCGGGTTACGTCACCTAACATCACTGTTACTTTAAAAAAGTTTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGAAGGAAGGGAGCTCGTCATTCCCTGCCGGGTTACGTCACCTAACATCACTGTTACTTTAAAAAAGTTTCC  518

Query  519  ACTTGACACTTTGATCCCTGATGGAAAACGCATAATCTGGGACAGTAGAAAGGGCTTCATCATATCAAATGCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTTGACACTTTGATCCCTGATGGAAAACGCATAATCTGGGACAGTAGAAAGGGCTTCATCATATCAAATGCAA  592

Query  593  CGTACAAAGAAATAGGGCTTCTGACCTGTGAAGCAACAGTCAATGGGCATTTGTATAAGACAAACTATCTCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGTACAAAGAAATAGGGCTTCTGACCTGTGAAGCAACAGTCAATGGGCATTTGTATAAGACAAACTATCTCACA  666

Query  667  CATCGACAAACCAATACAATCATAGATGTCCAAATAAGCACACCACGCCCAGTCAAATTACTTAGAGGCCATAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCGACAAACCAATACAATCATAGATGTCCAAATAAGCACACCACGCCCAGTCAAATTACTTAGAGGCCATAC  740

Query  741  TCTTGTCCTCAATTGTACTGCTACCACTCCCTTGAACACGAGAGTTCAAATGACCTGGAGTTACCCTGATGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTTGTCCTCAATTGTACTGCTACCACTCCCTTGAACACGAGAGTTCAAATGACCTGGAGTTACCCTGATGAAA  814

Query  815  AAAATAAGAGAGCTTCCGTAAGGCGACGAATTGACCAAAGCAATTCCCATGCCAACATATTCTACAGTGTTCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAATAAGAGAGCTTCCGTAAGGCGACGAATTGACCAAAGCAATTCCCATGCCAACATATTCTACAGTGTTCTT  888

Query  889  ACTATTGACAAAATGCAGAACAAAGACAAAGGACTTTATACTTGTCGTGTAAGGAGTGGACCATCATTCAAATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTATTGACAAAATGCAGAACAAAGACAAAGGACTTTATACTTGTCGTGTAAGGAGTGGACCATCATTCAAATC  962

Query  963  TGTTAACACCTCAGTGCATATATATGATAAAGCATTCATCACTGTGAAACATCGAAAACAGCAGGTGCTTGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTTAACACCTCAGTGCATATATATGATAAAGCATTCATCACTGTGAAACATCGAAAACAGCAGGTGCTTGAAA  1036

Query 1037  CCGTAGCTGGCAAGCGGTCTTACCGGCTCTCTATGAAAGTGAAGGCATTTCCCTCGCCGGAAGTTGTATGGTTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGTAGCTGGCAAGCGGTCTTACCGGCTCTCTATGAAAGTGAAGGCATTTCCCTCGCCGGAAGTTGTATGGTTA  1110

Query 1111  AAAGATGGGTTACCTGCGACTGAGAAATCTGCTCGCTATTTGACTCGTGGCTACTCGTTAATTATCAAGGACGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGATGGGTTACCTGCGACTGAGAAATCTGCTCGCTATTTGACTCGTGGCTACTCGTTAATTATCAAGGACGT  1184

Query 1185  AACTGAAGAGGATGCAGGGAATTATACAATCTTGCTGAGCATAAAACAGTCAAATGTGTTTAAAAACCTCACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AACTGAAGAGGATGCAGGGAATTATACAATCTTGCTGAGCATAAAACAGTCAAATGTGTTTAAAAACCTCACTG  1258

Query 1259  CCACTCTAATTGTCAATGTGAAACCCCAGATTTACGAAAAGGCCGTGTCATCGTTTCCAGACCCGGCTCTCTAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCACTCTAATTGTCAATGTGAAACCCCAGATTTACGAAAAGGCCGTGTCATCGTTTCCAGACCCGGCTCTCTAC  1332

Query 1333  CCACTGGGCAGCAGACAAATCCTGACTTGTACCGCATATGGTATCCCTCAACCTACAATCAAGTGGTTCTGGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCACTGGGCAGCAGACAAATCCTGACTTGTACCGCATATGGTATCCCTCAACCTACAATCAAGTGGTTCTGGCA  1406

Query 1407  CCCCTGTAACCATAATCATTCCGAAGCAAGGTGTGACTTTTGTTCCAATAATGAAGAGTCCTTTATCCTGGATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCCTGTAACCATAATCATTCCGAAGCAAGGTGTGACTTTTGTTCCAATAATGAAGAGTCCTTTATCCTGGATG  1480

Query 1481  CTGACAGCAACATGGGAAACAGAATTGAGAGCATCACTCAGCGCATGGCAATAATAGAAGGAAAGAATAAGATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGACAGCAACATGGGAAACAGAATTGAGAGCATCACTCAGCGCATGGCAATAATAGAAGGAAAGAATAAGATG  1554

Query 1555  GCTAGCACCTTGGTTGTGGCTGACTCTAGAATTTCTGGAATCTACATTTGCATAGCTTCCAATAAAGTTGGGAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTAGCACCTTGGTTGTGGCTGACTCTAGAATTTCTGGAATCTACATTTGCATAGCTTCCAATAAAGTTGGGAC  1628

Query 1629  TGTGGGAAGAAACATAAGCTTTTATATCACAGATGTGCCAAATGGGTTTCATGTTAACTTGGAAAAAATGCCGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTGGGAAGAAACATAAGCTTTTATATCACAGATGTGCCAAATGGGTTTCATGTTAACTTGGAAAAAATGCCGA  1702

Query 1703  CGGAAGGAGAGGACCTGAAACTGTCTTGCACAGTTAACAAGTTCTTATACAGAGACGTTACTTGGATTTTACTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGAAGGAGAGGACCTGAAACTGTCTTGCACAGTTAACAAGTTCTTATACAGAGACGTTACTTGGATTTTACTG  1776

Query 1777  CGGACAGTTAATAACAGAACAATGCACTACAGTATTAGCAAGCAAAAAATGGCCATCACTAAGGAGCACTCCAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGGACAGTTAATAACAGAACAATGCACTACAGTATTAGCAAGCAAAAAATGGCCATCACTAAGGAGCACTCCAT  1850

Query 1851  CACTCTTAATCTTACCATCATGAATGTTTCCCTGCAAGATTCAGGCACCTATGCCTGCAGAGCCAGGAATGTAT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CACTCTTAATCTTACCATCATGAATGTTTCCCTGCAAGATTCAGGCACCTATGCCTGCAGAGCCAGGAATGTAT  1924

Query 1925  ACACAGGGGAAGAAATCCTCCAGAAGAAAGAAATTACAATCAGAGGTGAGCA-------------CTGC-----  1980
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|             ||||     
Sbjct 1925  ACACAGGGGAAGAAATCCTCCAGAAGAAAGAAATTACAATCAGAGATCAGGAAGCACCATACCTCCTGCGAAAC  1998

Query 1981  -------AACAAAAAG---------GCTGTT-------------------TTCT----------------CTCG  2003
                   |.||.|.||         ||.|||                   |.||                |||.
Sbjct 1999  CTCAGTGATCACACAGTGGCCATCAGCAGTTCCACCACTTTAGACTGTCATGCTAATGGTGTCCCCGAGCCTCA  2072

Query 2004  GATCTCCAAATTTAA----AAGCACAAGGAATGATTGTACCACACAAAG--TAATGTAAA---ACAT-------  2061
            ||||.|....|||||    ||.|||||  ||      |||.||| |.||  |.|||.|.|   ||||       
Sbjct 2073  GATCACTTGGTTTAAAAACAACCACAA--AA------TACAACA-AGAGCCTGATGCAGATCCACATATACAGA  2137

Query 2062  -----------------------  2061
                                   
Sbjct 2138  AGGCTGACTGTACTTTTTTTTTT  2160