Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00598
• Subject: NM_001369504.1
• Aligned Length: 1093
• Identities: 983
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGATCCCCTGGGTGCAGCCAAGCCACAATGGCCATGGCGCCGCTGTCTGGCCGCACTGCTATTTCAGCTGCT  74
            ||||||||||||||..|.|||||||||||.|||.|.||||||.||||||||.||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGATCCCCTGGGCCCGGCCAAGCCACAGTGGTCGTGGCGCTGCTGTCTGACCACGCTGCTGTTTCAGCTGCT  74

Query   75  GGTGGCTGTGTGTTTCTTCTCCTACCTGCGTGTGTCCCGAGACGATGCCACTGGATCCCCTAGGGCTCCCAGTG  148
            |.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||.||||||..|.||||         |.||
Sbjct   75  GATGGCTGTGTGTTTCTTCTCCTATCTGCGTGTGTCTCAAGACGATCCCACTGTGTACCCT---------AATG  139

Query  149  GGTCC----TCCC-GACAGGACA-CCACTCCCACCCGCCCCACCCTCCTGATCCTGCTATGGACATGGCCTTTC  216
            |||||    |||| |||||.||| ..||.|||.|||.|.|||.||.||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  140  GGTCCCGCTTCCCAGACAGCACAGGGACCCCCGCCCACTCCATCCCCCTGATCCTGCTGTGGACGTGGCCTTTT  213

Query  217  CACATCCCTGTGGCTCTGTCCCGCTGTTCAGAGATGGTGCCCGGCACAGCCGACTGCCACATCACTGCCGACCG  290
            .|||..||..|.||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  214  AACAAACCCATAGCTCTGCCCCGCTGCTCAGAGATGGTGCCTGGCACGGCTGACTGCAACATCACTGCCGACCG  287

Query  291  CAAGGTGTACCCACAGGCAGACACGGTCATCGTGCACCACTGGGATATCATGTCCAACCCTAAGT-CACGCCTC  363
            |||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||..||||||.|||||| .||| |.|..|||
Sbjct  288  CAAGGTGTATCCACAGGCAGACGCGGTCATCGTGCACCACCGAGAGGTCATGTACAACCC-CAGTGCCCAGCTC  360

Query  364  CCACCTTCCCCGAGGCCGCAGGGGCAGCGCTGGATCTGGTTCAACTTGGAGCCACCCCCTA---ACTGCCAGCA  434
            ||||..||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||   .||||.|   |||||..|||
Sbjct  361  CCACGCTCCCCGAGGCGGCAGGGGCAGCGATGGATCTGGTTCAGCATGGAG---TCCCCAAGCCACTGCTGGCA  431

Query  435  CCTGGAAGCCCTGGACAGATACTTCAATCTCACCATGTCCTACCGCAGCGACTCCGACATCTTCACGCCCTACG  508
            .|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  GCTGAAAGCCATGGACGGATACTTCAATCTCACCATGTCCTACCGCAGCGACTCCGACATCTTCACGCCCTACG  505

Query  509  GCTGGCTGGAGCCGTGGTCCGGCCAGCCTGCCCACCCACCGCTCAACCTCTCGGCCAAGACCGAGCTGGTGGCC  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  GCTGGCTGGAGCCGTGGTCCGGCCAGCCTGCCCACCCACCGCTCAACCTCTCGGCCAAGACCGAGCTGGTGGCC  579

Query  583  TGGGCGGTGTCCAACTGGAAGCCGGACTCAGCCAGGGTGCGCTACTACCAGAGCCTGCAGGCTCATCTCAAGGT  656
            |||||.||||||||||||..|||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  580  TGGGCAGTGTCCAACTGGGGGCCAAACTCCGCCAGGGTGCGCTACTACCAGAGCCTGCAGGCCCATCTCAAGGT  653

Query  657  GGACGTGTACGGACGCTCCCACAAGCCCCTGCCCAAGGGGACCATGATGGAGACGCTGTCCCGGTACAAGTTCT  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  GGACGTGTACGGACGCTCCCACAAGCCCCTGCCCCAGGGAACCATGATGGAGACGCTGTCCCGGTACAAGTTCT  727

Query  731  ACCTGGCCTTCGAGAACTCCTTGCACCCCGACTACATCACCGAGAAGCTGTGGAGGAACGCCCTGGAGGCCTGG  804
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  ATCTGGCCTTCGAGAACTCCTTGCACCCCGACTACATCACCGAGAAGCTGTGGAGGAACGCCCTGGAGGCCTGG  801

Query  805  GCCGTGCCCGTGGTGCTGGGCCCCAGCAGAAGCAACTACGAGAGGTTCCTGCCACCCGACGCCTTCATCCACGT  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  GCCGTGCCCGTGGTGCTGGGCCCCAGCAGAAGCAACTACGAGAGGTTCCTGCCACCCGACGCCTTCATCCACGT  875

Query  879  GGACGACTTCCAGAGCCCCAAGGACCTGGCCCGGTACCTGCAGGAGCTGGACAAGGACCACGCCCGCTACCTGA  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  GGACGACTTCCAGAGCCCCAAGGACCTGGCCCGGTACCTGCAGGAGCTGGACAAGGACCACGCCCGCTACCTGA  949

Query  953  GCTACTTTCGCTGGCGGGAGACGCTGCGGCCTCGCTCCTTCAGCTGGGCACTGGATTTCTGCAAGGCCTGCTGG  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct  950  GCTACTTTCGCTGGCGGGAGACGCTGCGGCCTCGCTCCTTCAGCTGGGCACTCGCTTTCTGCAAGGCCTGCTGG  1023

Query 1027  AAACTGCAGCAGGAATCCAGGTACCAGACGGTGCGCAGCATAGCGGCTTGGTTCACC  1083
            |||||||||.|||||||||||||||||||   .|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  AAACTGCAGGAGGAATCCAGGTACCAGAC---ACGCGGCATAGCGGCTTGGTTCACC  1077