Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00598
• Subject: NM_002034.2
• Aligned Length: 1124
• Identities: 1022
• Gaps: 43

Alignment

Query    1  ATGGATCCCCTGGGTGCAGCCAAGCCACAATGGCCATGGCGCCGCTGTCTGGCCGCACTGCTATTTCAGCTGCT  74
            ||||||||||||||..|||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||..|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGATCCCCTGGGCCCAGCCAAGCCACAGTGGCTGTGGCGCCGCTGTCTGGCCGGGCTGCTGTTTCAGCTGCT  74

Query   75  GGTGGCTGTGTGTTTCTTCTCCTACCTGCGTGTGTCCCGAGACGATGCCACTGGATCCCCTA------------  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct   75  GGTGGCTGTGTGTTTCTTCTCCTACCTGCGTGTGTCCCGAGACGATGCCACTGGATCCCCTAGGCCAGGGCTTA  148

Query  137  ---------------------GGGCTCCCAGTGGGTCCTCCCGACAGGACA------CCACTCCCACCCGCCCC  183
                                 |||||||||.|||||||..|.|.|||||||      |.||.||..|||.||||
Sbjct  149  TGGCAGTGGAACCTGTCACCGGGGCTCCCAATGGGTCCCGCTGCCAGGACAGCATGGCGACCCCTGCCCACCCC  222

Query  184  ACCCTCCTGATCCTGCTATGGACATGGCCTTTCCACATCCCTGTGGCTCTGTCCCGCTGTTCAGAGATGGTGCC  257
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||..||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  ACCCTACTGATCCTGCTGTGGACGTGGCCTTTTAACACACCCGTGGCTCTGCCCCGCTGCTCAGAGATGGTGCC  296

Query  258  CGGCACAGCCGACTGCCACATCACTGCCGACCGCAAGGTGTACCCACAGGCAGACACGGTCATCGTGCACCACT  331
            ||||.|.|||||||||.||||||||||||||..||..||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGCGCGGCCGACTGCAACATCACTGCCGACTCCAGTGTGTACCCACAGGCAGACGCGGTCATCGTGCACCACT  370

Query  332  GGGATATCATGTCCAACCCTAAGT--CACGCCTCCCACCTTCCCCGAGGCCGCAGGGGCAGCGCTGGATCTGGT  403
            ||||||||||||.|||||| .|||  || .||||||.||..||.|.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGATATCATGTACAACCC-CAGTGCCA-ACCTCCCGCCCCCCACCAGGCCGCAGGGGCAGCGCTGGATCTGGT  442

Query  404  TCAACTTGGAGCCACCCCCTAACTGCCAGCACCTGGAAGCCCTGGACAGATACTTCAATCTCACCATGTCCTAC  477
            |||.|.|||||.|.|||...|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  TCAGCATGGAGTCCCCCAGCAACTGCCGGCACCTGGAAGCCCTGGACGGATACTTCAATCTCACCATGTCCTAC  516

Query  478  CGCAGCGACTCCGACATCTTCACGCCCTACGGCTGGCTGGAGCCGTGGTCCGGCCAGCCTGCCCACCCACCGCT  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  CGCAGCGACTCCGACATCTTCACGCCCTACGGCTGGCTGGAGCCGTGGTCCGGCCAGCCTGCCCACCCACCGCT  590

Query  552  CAACCTCTCGGCCAAGACCGAGCTGGTGGCCTGGGCGGTGTCCAACTGGAAGCCGGACTCAGCCAGGGTGCGCT  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  591  CAACCTCTCGGCCAAGACCGAGCTGGTGGCCTGGGCGGTGTCCAACTGGAAGCCGGACTCGGCCAGGGTGCGCT  664

Query  626  ACTACCAGAGCCTGCAGGCTCATCTCAAGGTGGACGTGTACGGACGCTCCCACAAGCCCCTGCCCAAGGGGACC  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  ACTACCAGAGCCTGCAGGCTCATCTCAAGGTGGACGTGTACGGACGCTCCCACAAGCCCCTGCCCAAGGGGACC  738

Query  700  ATGATGGAGACGCTGTCCCGGTACAAGTTCTACCTGGCCTTCGAGAACTCCTTGCACCCCGACTACATCACCGA  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  ATGATGGAGACGCTGTCCCGGTACAAGTTCTATCTGGCCTTCGAGAACTCCTTGCACCCCGACTACATCACCGA  812

Query  774  GAAGCTGTGGAGGAACGCCCTGGAGGCCTGGGCCGTGCCCGTGGTGCTGGGCCCCAGCAGAAGCAACTACGAGA  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GAAGCTGTGGAGGAACGCCCTGGAGGCCTGGGCCGTGCCCGTGGTGCTGGGCCCCAGCAGAAGCAACTACGAGA  886

Query  848  GGTTCCTGCCACCCGACGCCTTCATCCACGTGGACGACTTCCAGAGCCCCAAGGACCTGGCCCGGTACCTGCAG  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GGTTCCTGCCACCCGACGCCTTCATCCACGTGGACGACTTCCAGAGCCCCAAGGACCTGGCCCGGTACCTGCAG  960

Query  922  GAGCTGGACAAGGACCACGCCCGCTACCTGAGCTACTTTCGCTGGCGGGAGACGCTGCGGCCTCGCTCCTTCAG  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GAGCTGGACAAGGACCACGCCCGCTACCTGAGCTACTTTCACTGGCGGGAGACGCTGCGGCCTCGCTCCTTCAG  1034

Query  996  CTGGGCACTGGATTTCTGCAAGGCCTGCTGGAAACTGCAGCAGGAATCCAGGTACCAGACGGTGCGCAGCATAG  1069
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  CTGGGCACTGGCTTTCTGCAAGGCCTGCTGGAAGCTGCAGCAGGAATCTAGGTACCAGACGGTGCGCAGCATAG  1108

Query 1070  CGGCTTGGTTCACC  1083
            ||||||||||||||
Sbjct 1109  CGGCTTGGTTCACC  1122