Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00600
• Subject: XM_017010653.1
• Aligned Length: 1611
• Identities: 1446
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74

Query   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148

Query  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222

Query  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296

Query  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370

Query  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444

Query  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518

Query  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592

Query  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666

Query  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCA--------------------------------------------  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCAGAGAGAGCTGCAGGTCTCTGCTGCCGCCTAGTAGTTCCCTGTCA  740

Query  697  --------------------------------------------------------------------------  696
                                                                                      
Sbjct  741  CAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATCCCTCGAGAATCCCTGC  814

Query  697  -----------------------------------------------GGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTA  723
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTTGATCAAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTTGGGGAAGTATGGATGGGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTA  888

Query  724  GCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCT  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCT  962

Query  798  GAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGA  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGA  1036

Query  872  ACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATG  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATG  1110

Query  946  GCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAA  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAA  1184

Query 1020  CATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGT  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGT  1258

Query 1094  ACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACA  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACA  1332

Query 1168  ATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG  1406

Query 1242  CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCT  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCT  1480

Query 1316  CTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGC  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGC  1554

Query 1390  TTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAAAACCTG  1446
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAAAACCTG  1611