Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00615
• Subject: NM_001289726.1
• Aligned Length: 1083
• Identities: 895
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGCCCTTACCCCGGGGTCCCAGCTTAGGTTCATCAGGTAAACTCAGGAGAGTGTTTCCTCGTCCCGTAGA  74

Query    1  ----ATGGGGAAGGTGAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCTTTTA  70
                ||      ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..||.
Sbjct   75  CAAAAT------GGTGAAGGTCGGTGTGAACGGATTTGGCCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCCATTT  142

Query   71  ACTCTGGTAAAGTGGATATTGTTGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTTTACATGTTCCAA  144
            .|..|||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  143  GCAGTGGCAAAGTGGAGATTGTTGCCATCAACGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTCTACATGTTCCAG  216

Query  145  TATGATTCCACCCATGGCAAATTCCATGGCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAGCTTGTCATCAATGGAAATCC  218
            |||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  217  TATGACTCCACTCACGGCAAATTCAACGGCACAGTCAAGGCCGAGAATGGGAAGCTTGTCATCAACGGGAAGCC  290

Query  219  CATCACCATCTTCCAGGAGCGAGATCCCTCCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGT  292
            ||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct  291  CATCACCATCTTCCAGGAGCGAGACCCCACTAACATCAAATGGGGTGAGGCCGGTGCTGAGTATGTCGTGGAGT  364

Query  293  CCACTGGCGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCT  366
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  365  CTACTGGTGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCCGGGGCCCACTTGAAGGGTGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCC  438

Query  367  GCCCCCTCTGCTGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTATGACAACAGCCTCAAGATCAT  440
            |||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||...||||||||..|
Sbjct  439  GCCCCTTCTGCCGATGCCCCCATGTTTGTGATGGGTGTGAACCACGAGAAATATGACAACTCACTCAAGATTGT  512

Query  441  CAGCAATGCCTCCTGCACCACCAACTGCTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGTATCGTGG  514
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  513  CAGCAATGCATCCTGCACCACCAACTGCTTAGCCCCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGCATTGTGG  586

Query  515  AAGGACTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCCGGGAAACTGTGG  588
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  587  AAGGGCTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCTGGAAAGCTGTGG  660

Query  589  CGTGATGGCCGCGGGGCTCTCCAGAACATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCAT  662
            |||||||||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CGTGATGGCCGTGGGGCTGCCCAGAACATCATCCCTGCATCCACTGGTGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCAT  734

Query  663  CCCTGAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAACGTGTCAGTGGTGGACCTGA  736
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  735  CCCAGAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTTCCTACCCCCAATGTGTCCGTCGTGGATCTGA  808

Query  737  CCTGCCGTCTAGAAAAACCTGCCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCGTCGGAGGGCCCCCTC  810
            |.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  809  CGTGCCGCCTGGAGAAACCTGCCAAGTATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCATCTGAGGGCCCACTG  882

Query  811  AAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGCACCAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTCCACCTT  884
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||||||||.||.|||||||.||||||||
Sbjct  883  AAGGGCATCTTGGGCTACACTGAGGACCAGGTTGTCTCCTGCGACTTCAACAGCAACTCCCACTCTTCCACCTT  956

Query  885  TGACGCTGGGGCTGGCATTGCCCTCAACGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAACGAATTTGGCT  958
            .||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||
Sbjct  957  CGATGCCGGGGCTGGCATTGCTCTCAATGACAACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAATGAATACGGCT  1030

Query  959  ACAGCAACAGGGTGGTGGACCTCATGGCCCACATGGCCTCCAAGGAG  1005
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1031  ACAGCAACAGGGTGGTGGACCTCATGGCCTACATGGCCTCCAAGGAG  1077