Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00615
• Subject: NM_008084.3
• Aligned Length: 1005
• Identities: 894
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGGGAAGGTGAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCTTTTAACTC  74
                  |.||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..||..|..
Sbjct    1  ------ATGGTGAAGGTCGGTGTGAACGGATTTGGCCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCCATTTGCAG  68

Query   75  TGGTAAAGTGGATATTGTTGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTTTACATGTTCCAATATG  148
            |||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct   69  TGGCAAAGTGGAGATTGTTGCCATCAACGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTCTACATGTTCCAGTATG  142

Query  149  ATTCCACCCATGGCAAATTCCATGGCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAGCTTGTCATCAATGGAAATCCCATC  222
            |.|||||.||.|||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  143  ACTCCACTCACGGCAAATTCAACGGCACAGTCAAGGCCGAGAATGGGAAGCTTGTCATCAACGGGAAGCCCATC  216

Query  223  ACCATCTTCCAGGAGCGAGATCCCTCCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCAC  296
            ||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  217  ACCATCTTCCAGGAGCGAGACCCCACTAACATCAAATGGGGTGAGGCCGGTGCTGAGTATGTCGTGGAGTCTAC  290

Query  297  TGGCGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCC  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  291  TGGTGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCCGGGGCCCACTTGAAGGGTGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCCGCCC  364

Query  371  CCTCTGCTGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTATGACAACAGCCTCAAGATCATCAGC  444
            |.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||...||||||||..|||||
Sbjct  365  CTTCTGCCGATGCCCCCATGTTTGTGATGGGTGTGAACCACGAGAAATATGACAACTCACTCAAGATTGTCAGC  438

Query  445  AATGCCTCCTGCACCACCAACTGCTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGTATCGTGGAAGG  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  439  AATGCATCCTGCACCACCAACTGCTTAGCCCCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGCATTGTGGAAGG  512

Query  519  ACTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTG  592
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  513  GCTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCTGGAAAGCTGTGGCGTG  586

Query  593  ATGGCCGCGGGGCTCTCCAGAACATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCT  666
            |||||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  587  ATGGCCGTGGGGCTGCCCAGAACATCATCCCTGCATCCACTGGTGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCA  660

Query  667  GAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAACGTGTCAGTGGTGGACCTGACCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  661  GAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTTCCTACCCCCAATGTGTCCGTCGTGGATCTGACGTG  734

Query  741  CCGTCTAGAAAAACCTGCCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCGTCGGAGGGCCCCCTCAAGG  814
            |||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||
Sbjct  735  CCGCCTGGAGAAACCTGCCAAGTATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCATCTGAGGGCCCACTGAAGG  808

Query  815  GCATCCTGGGCTACACTGAGCACCAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTCCACCTTTGAC  888
            |||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||||||||.||.|||||||.||||||||.||.
Sbjct  809  GCATCTTGGGCTACACTGAGGACCAGGTTGTCTCCTGCGACTTCAACAGCAACTCCCACTCTTCCACCTTCGAT  882

Query  889  GCTGGGGCTGGCATTGCCCTCAACGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAACGAATTTGGCTACAG  962
            ||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||||||
Sbjct  883  GCCGGGGCTGGCATTGCTCTCAATGACAACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAATGAATACGGCTACAG  956

Query  963  CAACAGGGTGGTGGACCTCATGGCCCACATGGCCTCCAAGGAG  1005
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  957  CAACAGGGTGGTGGACCTCATGGCCTACATGGCCTCCAAGGAG  999