Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00615
• Subject: NR_004447.1
• Aligned Length: 1263
• Identities: 861
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------ATGGGGAAGGTGAAGGTCGGAGTC  24
                                                              ||      |.||||||||||.||.
Sbjct    1  AGAGACAGCCACATCTTCTTGTGCAGTGCCAACCTCATCCCGTAGACAAAAT------GCTGAAGGTCGGTGTG  68

Query   25  AACGGATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCTTTTAACTC------TGGTAAAGTGGATATTGT  92
            ||.||||||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||.||...|||      |||.||||||||..||||
Sbjct   69  AATGGATTTGGCCATATTGGGTGCCTGGTCACCAGGGCTGCCTTCTGCTCTCCACATGGCAAAGTGGAGGTTGT  142

Query   93  TGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTTTACATGTTCCAATATGATTCCACCCATGGCAAAT  166
            |||||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  143  TGCCATCAACGACCCCTTCATTGGCCTCAACTATATGGTCTACATGTTCCAGTATGACTCCACCCACGGCAAGT  216

Query  167  TCCATGGCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAGCTTGTCATCAATGGAAATCCCATCACCATCTTCCAGGAGCGA  240
            ||.|.|||     ||      ||||.|||||||.|||||||||||..||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct  217  TCAACGGC-----CA------AGAATGGGAAGCATGTCATCAATGAGAAGCCCATCACCATCTTCCAGGAGTGA  279

Query  241  GATCCCT-CCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCACCA  313
            || |||| |.||.|||||.|||||.||.|..||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  280  GA-CCCTGCTAACATCAAATGGGGTGAGGTCGGTGCGGAGTATGTTGTGGAGTCTACTGGTGTCTTCACCACCA  352

Query  314  TGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCCCCTCTGCTGATGCCCCC  387
            ||.||||||||||.||.||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||...|||.|||||.|||||||.|
Sbjct  353  TGAAGAAGGCTGGTGCCCACTTGAAGGGTGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCCATCCCTTCTGCCGATGCCCAC  426

Query  388  ATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTATGACAACAGCCTCAAGATCATCAGCAATGCCTCCTGCACCAC  461
            |||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||...||||||||..||||||||||.|||||||||||
Sbjct  427  ATGTTTGTGATGGGTGTGAACCACGAGAAATATGACAACTCACTCAAGATTGTCAGCAATGCATCCTGCACCAC  500

Query  462  CAACTGCTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGTATCGTGGAAGGACTCATGACCACAGTCC  535
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  501  CAACTGCTTAGCCCCTCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGCATTGTGGAAGGGCTCATGACCACGGTCC  574

Query  536  ATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTGATGGCCGCGGGGCTCTC  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||||||..|.||||..|
Sbjct  575  ATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCTGGAAAGCTGTGGCATGATGGCCATGAGGCTGCC  648

Query  610  CAGAACATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCTGAGCTGAACGGGAAGCT  683
            |.|||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  649  CGGAACATCATCCCTGCATCCACTGGTGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCAGAGCTGAACGGGAAGCT  722

Query  684  CACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAACGTGTCAGTGGTGGACCTGACCTGCCGTCTAGAAAAACCTG  757
            |||||||||||.|||||||||.||.||..||||.|||||.||.|||||.|||||.|||.|.||.||.|||||||
Sbjct  723  CACTGGCATGGGCTTCCGTGTTCCTACCCCCAATGTGTCTGTAGTGGATCTGACGTGCTGCCTGGAGAAACCTG  796

Query  758  CCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCGTCGGAGGGCCCCCTCAAGGGCATCCTGGGCTACACT  831
            ||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||.||||||||
Sbjct  797  CCAAGTATGATGACATCAAGAAGATGGTGAAGCAGGCATCTGAGGGCCCACTGAAGGGCATCTTGAGCTACACT  870

Query  832  GAGCACCAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTCCACCTTTGACGCTGGGGCTGGCATTGC  905
            |||.|||||||.|||||||..||||||||||||.||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  871  GAGGACCAGGTTGTCTCCTGCGACTTCAACAGCAACTCCCACTCTTCCACCTTCGATGCCGGGGCTGGCATTGC  944

Query  906  CCTCAACGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAACGAATTTGGCTACAGCAACAGGGTGGTGGACC  979
            .|||||.|||.||||||||||||||||||.||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TCTCAATGACAACTTTGTCAAGCTCATTTGCTGGTATGACAATGAATACGGCTACAGCAACAGGGTGGTGGACC  1018

Query  980  TCATGGCCCACATGGCCTCCAAGGAG------------------------------------------------  1005
            ||||||||.||||||||||||||||.                                                
Sbjct 1019  TCATGGCCTACATGGCCTCCAAGGACTAAGAAACCCTGGACCACCCACCCCAGCAAGGACATTGAGAGCAAGAG  1092

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1093  AGAGGCCCTCGGTTGCTGAGGAGTCCCTATCCCAACTCGGCCCCCAACACTGAGCAACTCCCTCACAATTTCCA  1166

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1167  CCCCAGATCCCCATAACAGGAGGGGCCTAGGAAGCCCTCCCTACTCTCTTGAATACCATCAATAAATTTCGTTG  1240

Query 1006  -----  1005
                 
Sbjct 1241  CACCC  1245