Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00615
• Subject: NR_023357.1
• Aligned Length: 1467
• Identities: 883
• Gaps: 463

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGTCCACGGCGGCGGGAACCCGCACCGCCCGACGCACGGGGCGGCCAGGCCGACGGCGGACGGCGCGGCGGGAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACTCCGGGCCACTCACTCTGAGGGAAGCCAACCAACCATCTTGGTCACTCAGGAAGCCTGTGGAGAGGTATATG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TAAGAAGGAACTAGAGCTTCCAGCCAACAACCAACACCAACTGGCCAATCAGAGACAGCTGCATCTTCTGCAGT  222

Query    1  --------------ATGGGGAA---GGTGAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACC  57
                          ||.|..||   ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  223  GCCAGCCTCATCCCATAGACAAAATGGTGAAGGTCGGCGTGAACGGATTTGGCCGTATTGGGCGCCTGGTTACC  296

Query   58  AGGG-------CTGCTTTTAACTCTGGTAAAGTGGATATTGTTGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACT  124
            ||||       |||||.|..||| |||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  AGGGCTGCCGTCTGCTCTCCACT-TGGCAAAGTGGAGATTGTTGCCATCAACGACCCCTTCATTGACCTTAACT  369

Query  125  ACATGGTTTACATGTTCCAATATGATTCCACCCATGGCAAATTCCATGGCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAG  198
            |||||||.|||||||||||.|.|||.||||||||.|||||||||.|..||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  370  ACATGGTCTACATGTTCCAGTCTGACTCCACCCACGGCAAATTCAACAGCACAGTCAAGGCCGAGAATGGGAAG  443

Query  199  CTTGTCATCAATGGAAATCCCATCACCATCTTCCAGGAGCGAGATCCCTCCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGG  272
            |||||||||||.||.||.||||||||..||||||||||||.||||||..|.||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct  444  CTTGTCATCAACGGGAAGCCCATCACTGTCTTCCAGGAGCTAGATCCTGCTAACATTAAATGGGGTGATGCTGG  517

Query  273  CGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAG  346
            .||||||||.||.||||||||.||||||.||||.||||||||||.||||||||||||.||.|||.||||.||||
Sbjct  518  TGCTGAGTATGTTGTGGAGTCTACTGGCCTCTTTACCACCATGGGGAAGGCTGGGGCCCACTTGAAGGGTGGAG  591

Query  347  CCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCCCCTCTGCTGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTAT  420
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  592  CCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCCCTTCTGCTGATGCCCCCATGTTTGTGATGGGTGTGAACCACGAGAAATAT  665

Query  421  GACAACAGCCTCAAGATCATCAGCAATGCCTCCTGCACCACCAACTGCTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCA  494
            ||.|||...||.|||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GATAACTCACTAAAGATTGTCAGCAATGCATCCTGCACCACCAACTGCTTAGCCCCCCTGGCCAAGGTCATCCA  739

Query  495  TGACAACTTTGGTATCGTGGAAGGACTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATG  568
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||
Sbjct  740  TGACAACTTTGGCATCGTGGAAGGGCTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACTCAGATGACTGTTGATG  813

Query  569  GCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTGATGGCCGCGGGGCTCTCCAGAACATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCC  642
            |||||||..|.|||..|||||||||||||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  814  GCCCCTCTAGAAAAGCGTGGCGTGATGGCCGTGGGGCTGCCCAGAACATCATCCCTGCATCCACTGGTGCTGCC  887

Query  643  AAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCTGAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAA  716
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||...|||
Sbjct  888  AAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCAGAGCTGAATGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTTCCTACCCTCAA  961

Query  717  CGTGTCAGTGGTGGACCTGACCTGCCGTCTAGAAAAACCTGCCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGC  790
            .||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TGTATCCGTTGTGGATCTGACATGCCGCCTGGAGAAACCTGCCAAGTATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGC  1035

Query  791  AGGCGTCGGAGGGCCCCCTCAAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGCACCAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGC  864
            ||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||||||||
Sbjct 1036  AGGCATCTGAGGGCCCACTGAAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGGACCAGGTTGTCTCCTACGACTTCAACAGC  1109

Query  865  GACACCCACTCCTCCACCTTTGACGCTGGGGCTGGCATTGCCCTCAACGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTG  938
            .||.||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1110  AACTCCTACTCTTCCACCTTTGATGCTGGGGCTGGCATTGCTCTCAATGACAACTTTGTAAAGCTCATATCCTG  1183

Query  939  GTATGACAACGAATTTGGCTACAGCAACAGGGTGGTGGACCTCATGGCCCACATGGCCTCCAAGGAG-------  1005
            |||||||||.||||...|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||       
Sbjct 1184  GTATGACAATGAATACAGCTACAGCAGCAGGGTGGTGGACTTCATGGCCTACATGGCCTCCAAGGAGTAAGAAA  1257

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1258  CCCTGGACCACCCACCCCAGCAAGGACACTGAGAGCAAGAGAGAGGCCCTCAGTTGCTGAGGAGTCCCTATCCC  1331

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1332  AACTTGGCCTCAACACTGAGCATCTCCCTCACAATTTCCACCCCAGACCCCCATAATAATAGGAGGGGCCTAGG  1405

Query 1006  -------------------------------------------------------------  1005
                                                                         
Sbjct 1406  GGGCCCTCCCTACTCTCTTGAATACCATCAATAAAGTTGCTGCACACCCCCCAAAAATCTC  1466