Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00615
• Subject: NR_033215.1
• Aligned Length: 1280
• Identities: 865
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGGGG--------AAGGTGAAGGTCGGAGTCAACGGA  30
                                                ||..||        |.|||||||||..|.||.||||||
Sbjct    1  AGAGACAGCTGCATCTTCTTGGGCAGTGCCAGCCTCATCCGGTAGACAAAATGGTGAAGGTTTGTGTGAACGGA  74

Query   31  TTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCTTTTAACTC------TGGTAAAGTGGATATTGTTGCCAT  98
            |||.|...||||||||||||||||||||.||||||.||...|||      |||.|||||.||..||||||||||
Sbjct   75  TTTAGCTATATTGGGCGCCTGGTCACCACGGCTGCCTTCTGCTCTCCACATGGCAAAGTAGAGGTTGTTGCCAT  148

Query   99  CAATGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTTTACATGTTCCAATATGATTCCACCCATGGCAAATTCCATG  172
            |||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||...|||.||||||||.|||||||||.|.|
Sbjct  149  CAACAACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTCTACATGTTCCAGCCTGACTCCACCCACGGCAAATTCAACG  222

Query  173  GCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAGCTTGTCATCAA-TGGAAATCCCATCACCATCTTCCAGGAGCGAGATCC  245
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||| .||.||.|||||||.|||||||.|||||.||||.||
Sbjct  223  GCACAGTCAAGGCCGAGAATGGGAAGCTTGTCATCAACGGGGAAGCCCATCATCATCTTCTAGGAGTGAGACCC  296

Query  246  CTCCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCACCATGGAGA  319
            |.|.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCTAACATCAAATGGGGTGAGGCCGGTGCTGAGTATGTAGTGGAGTCTACTGGTGTCTTCACCACCATGGAGA  370

Query  320  AGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCCCCTCTGCTGATGCCCCCATGTTC  393
            ||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||||||||.
Sbjct  371  AGGCCGGGGCCCACTTGAAGGGTGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCCGCCCCTTCTGCCGATACCCCCATGTTT  444

Query  394  GTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTATGACAACAGCCTCAAGATCATCAGCAATGCCTCCTGCACCACCAACTG  467
            .|.||||||||||||||.|||||.|||||||||...||||||||..||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  ATGATGGGTGTGAACCACGAGAAATATGACAACTCACTCAAGATTGTCAGCAATGCATCCTGTACCACCAACTG  518

Query  468  CTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGTATCGTGGAAGGACTCATGACCACAGTCCATGCCA  541
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||..|||||
Sbjct  519  CTTAGCCCCCCTGGCCAAAGTCATCCATGACAACTTTGGCATCGTGGAAGGACTCATGACCACGGTCTGTGCCA  592

Query  542  TCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTGATGGCCGCGGGGCTCTCCAGAAC  615
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||.|||||||||.||||||..|||||||
Sbjct  593  TCACTGCCACTCAGAAGACCGTGGATGGCCCTTCTGGAAAGCTGTGGCATGATGGCCGTGGGGCTGCCCAGAAC  666

Query  616  ATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCTGAGCTGAACGGGAAGCTCACTGG  689
            |||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCATTCCTGCATCCACTGGTGCTGCCAAAGCTGTGGGCAAGGTCATCCCAGAGCTGAACGGGAAGCTCACTGG  740

Query  690  CATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAACGTGTCAGTGGTGGACCTGACCTGCCGTCTAGAAAAACCTGCCAAAT  763
            ||||||||||.||||.||.||..|||..|||||.||.|||||..|||..||||..||.||.|||||||||||.|
Sbjct  741  CATGGCCTTCTGTGTTCCTACCCCCAGTGTGTCCGTTGTGGATATGATGTGCCACCTGGAGAAACCTGCCAAGT  814

Query  764  ATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCGTCGGAGGGCCCCCTCAAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGCAC  837
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  815  ATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGACATCTGAGGGCCCACTGAAGGGCATCTTGGGCTACACTGAGGAC  888

Query  838  CAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTCCACCTTTGACGCTGGGGCTGGCATTGCCCTCAA  911
            |||||.|||||||..||||||||||||.||.|||||| |||||||||.||.||..|||||||||||||..||||
Sbjct  889  CAGGTTGTCTCCTGCGACTTCAACAGCAACTCCCACT-CTCCACCTTCGATGCCAGGGCTGGCATTGCTTTCAA  961

Query  912  CGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAACGAATTTGGCTACAGCAACAGGGTGGTGGACCTCATGG  985
            .|||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TGACAAATTTGTCAAGCTTATTTCCTGGTATGACAATGAATATGGCTACAGCAACAGGGTGGTGGACCTCATGG  1035

Query  986  CCCACATGGCCTCCAAGGAG------------------------------------------------------  1005
            ||.|||||.|||||||||||                                                      
Sbjct 1036  CCTACATGACCTCCAAGGAGTAAGAAACCCTGGACCACCCACCCCAGCAAGGACACTGAGAGCAAGAGAGAGGC  1109

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1110  CCTCGGTTGCTGAGGAGTCCCTATACCAACTCGGCCCCCAACACTGAGCATCTCCCTCATGATTTCCACCCCAG  1183

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1184  CCCCCCATAACAGGAGGGGCCTAGGGAGCCCTCCCTACTCTCTTGAATACCATCAATAAAGTTTGCTGCATCCA  1257

Query 1006  ----------------------  1005
                                  
Sbjct 1258  CAAAAAACCAAAAACAAACAAA  1279