Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00625
• Subject: NM_001136484.3
• Aligned Length: 1285
• Identities: 1073
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGCTGAGGACGTTGCTGCGAAGGAGACTTTTTTCTTATCCCACCAAATACTACTTTATGGTTCTTGTTTTATC  74
            ||||||||.|..|||.|.||.|||||||||||.||||.|||.||.|||||||||||||||.|.|||||..|.||
Sbjct    1  ATGCTGAGAAACTTGTTTCGGAGGAGACTTTTCTCTTGTCCTACAAAATACTACTTTATGCTCCTTGTCCTCTC  74

Query   75  CCTAATCACCTTCTCCGTTTTAAGGATTCATCAAAAGCCTGAATTTGTAAGTGTCAGACACTTGGAGCTTGCTG  148
            ..||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TTTAATTACCTTCTCTGTTTTAAGAATTCATCAGAAGCCTGAATTTTTCAGTGTCAGACACTTGGAGCTGGCTG  148

Query  149  GGGAGAATCCTAGTAGTGATATTAATTGCACCAAAGTTTTACAGGGTGATGTAAATGAAATCCAAAAGGTAAAG  222
            |.||..|||||...||..||.|||||||||||||..|||||||||||||...|.|.||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  GAGATGATCCTTACAGCAATGTTAATTGCACCAAGATTTTACAGGGTGACCCAGAAGAAATCCAGAAGGTGAAG  222

Query  223  CTTGAGATCCTAACAGTGAAATTTAAAAAGCGCCCTCGGTGGACACCTGACGACTATATAAACATGACCAGTGA  296
            ||||||||.|||||||||.||||.||.||||||||..||.|||||||..|.||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  CTTGAGATACTAACAGTGCAATTCAAGAAGCGCCCGAGGCGGACACCCCATGACTATATAAACATGACCCGTGA  296

Query  297  CTGTTCTTCTTTCATCAAGAGACGCAAATATATTGTAGAACCCCTTAGTAAAGAAGAGGCGGAGTTTCCAATAG  370
            ||||.|.||||||||||.||.|||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||||..|..||||||||.|
Sbjct  297  CTGTGCCTCTTTCATCAGGACACGCAAATATATTGTGGAGCCCCTTACTAAAGAAGAGGTAGGCTTTCCAATTG  370

Query  371  CATATTCTATAGTGGTTCATCACAAGATTGAAATGCTTGACAGGCTGCTGAGGGCCATCTATATGCCTCAGAAT  444
            |||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CATATTCCATTGTGGTTCATCATAAGATTGAAATGCTTGACAGGCTCCTGAGGGCCATCTATATGCCTCAGAAT  444

Query  445  TTCTATTGCATTCATGTGGACACAAAATCCGAGGATTCCTATTTAGCTGCAGTGATGGGCATCGCTTCCTGTTT  518
            |||||.||||||||.|||||||.||||.|.|||||.||||.||||||.||.|||..|||||||||.|||||.||
Sbjct  445  TTCTACTGCATTCACGTGGACAGAAAAGCAGAGGAATCCTTTTTAGCCGCGGTGCAGGGCATCGCATCCTGCTT  518

Query  519  TAGTAATGTCTTTGTGGCCAGCCGATTGGAGAGTGTGGTTTATGCATCGTGGAGCCGGGTTCAGGCTGACCTCA  592
            |..||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||.||||.|||||||
Sbjct  519  TGATAATGTCTTTGTGGCCAGCCAGTTGGAGAGTGTTGTTTATGCGTCCTGGAGTCGGGTTAAGGCAGACCTCA  592

Query  593  ACTGCATGAAGGATCTCTATGCAATGAGTGCAAACTGGAAGTACTTGATAAATCTTTGTGGTATGGATTTTCCC  666
            |||||||||||||.||.||...|||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  593  ACTGCATGAAGGACCTGTACAGAATGAATGCAAACTGGAAGTACTTGATCAATCTCTGTGGTATGGATTTCCCT  666

Query  667  ATTAAAACCAACCTAGAAATTGTCAGGAAGCTCAAGTTGTTAATGGGAGAAAACAACCTGGAAACGGAGAGGAT  740
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|..|..||.|||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  667  ATTAAAACCAACCTGGAAATTGTCAGGAAGCTCAAGTGCTCCACAGGGGAAAACAACCTGGAAACTGAGAAGAT  740

Query  741  GCCATCCC-ATAAAGAAGAAAGGTGGAAGAAGCGGTATGAGGTCGTTAATGGAAAGCTGACAAACACAGGGACT  813
            ||| |||| |.||.|||||.||.|||||.||..|.||....||.||..||||.||||||||.|||||.||.|..
Sbjct  741  GCC-TCCCAACAAGGAAGAGAGATGGAAAAAAAGATACACCGTTGTCGATGGGAAGCTGACCAACACTGGAATA  813

Query  814  GTCAAAATGCTTCCTCCACTCGAAACACCTCTCTTTTCTGGCAGTGCCTACTTCGTGGTCAGTAGGGAGTATGT  887
            ||||||...|..||.|||||..||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  814  GTCAAAGCACCGCCCCCACTGAAAACTCCTCTCTTTTCAGGCAGTGCCTACTTCGTGGTCACTAGGGAATATGT  887

Query  888  GGGGTATGTACTACAGAATGAAAAAATCCAAAAGTTGATGGAGTGGGCACAAGACACATACAGCCCTGATGAGT  961
            .||.||.||.||..|.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  888  AGGCTACGTGCTGGAAAATGAAAATATTCAAAAGTTGATGGAATGGGCACAGGACACATACAGCCCAGATGAGT  961

Query  962  ATCTCTGGGCCACCATCCAAAGGATTCCTGAAGTCCCGGGCTCACTCCCTGCCAGCCATAAGTATGATCTGTCT  1035
            ..|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||..||||..|.|||.|.||||||||..||||.
Sbjct  962  TCCTCTGGGCCACCATCCAAAGGATCCCAGAAGTCCCTGGTTCTTTCCCCTCAAGCAACAAGTATGACTTGTCA  1035

Query 1036  GACATGCAAGCAGTTGCCAGGTTTGTCAAGTGGCAGTACTTTGAGGGTGATGTTTCCAAGGGTGCTCCCTACCC  1109
            ||||||.|.||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1036  GACATGAATGCCATTGCTAGGTTTGTCAAGTGGCAGTACTTCGAAGGCCATGTTTCCAACGGTGCCCCTTATCC  1109

Query 1110  GCCCTGCGATGGAGTCCATGTGCGCTCAGTGTGCATTTTCGGAGCTGGTGACTTGAACTGGATGCTGCGCAAAC  1183
            .||.|||..|||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 1110  ACCGTGCAGTGGAGTCCACGTGCGCTCTGTGTGCGTCTTCGGAGCTGGTGACTTGAGCTGGATGCTGCGCCAAC  1183

Query 1184  ACCACTTGTTTGCCAATAAGTTTGACGTGGATGTTGACCTCTTTGCCATCCAGTGTTTGGATGAGCATTTGAGA  1257
            |||||.|.||||||||||||||||||.|||||||.||||.||||||||||||||||||||||||.|||.||||.
Sbjct 1184  ACCACCTTTTTGCCAATAAGTTTGACATGGATGTCGACCCCTTTGCCATCCAGTGTTTGGATGAACATCTGAGG  1257

Query 1258  CACAAAGCTTTGGAGACATTAAAACAC  1284
            ||.|||||..||||||..|||.|||||
Sbjct 1258  CATAAAGCCCTGGAGAACTTAGAACAC  1284