Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00632
Subject:
NM_001142269.4
Aligned Length:
758
Identities:
701
Gaps:
57

Alignment

Query   1  MAVSAGSARTSPSSDKVQKDKAELISGPRQDSRIGKLLGFEWTDLSSWRRLVTLLNRPTDPASLAVFRFLFGFL  74
           ||||||||||||||                                                         |||
Sbjct   1  MAVSAGSARTSPSS---------------------------------------------------------GFL  17

Query  75  MVLDIPQERGLSSLDRKYLDGLDVCRFPLLDALRPLPLDWMYLVYTIMFLGALGMMLGLCYRISCVLFLLPYWY  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  18  MVLDIPQERGLSSLDRKYLDGLDVCRFPLLDALRPLPLDWMYLVYTIMFLGALGMMLGLCYRISCVLFLLPYWY  91

Query 149  VFLLDKTSWNNHSYLYGLLAFQLTFMDANHYWSVDGLLNAHRRNAHVPLWNYAVLRGQIFIVYFIAGVKKLDAD  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  92  VFLLDKTSWNNHSYLYGLLAFQLTFMDANHYWSVDGLLNAHRRNAHVPLWNYAVLRGQIFIVYFIAGVKKLDAD  165

Query 223  WVEGYSMEYLSRHWLFSPFKLLLSEELTSLLVVHWGGLLLDLSAGFLLFFDVSRSIGLFFVSYFHCMNSQLFSI  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166  WVEGYSMEYLSRHWLFSPFKLLLSEELTSLLVVHWGGLLLDLSAGFLLFFDVSRSIGLFFVSYFHCMNSQLFSI  239

Query 297  GMFSYVMLASSPLFCSPEWPRKLVSYCPRRLQQLLPLKAAPQPSVSCVYKRSRGKSGQKPGLRHQLGAAFTLLY  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240  GMFSYVMLASSPLFCSPEWPRKLVSYCPRRLQQLLPLKAAPQPSVSCVYKRSRGKSGQKPGLRHQLGAAFTLLY  313

Query 371  LLEQLFLPYSHFLTQGYNNWTNGLYGYSWDMMVHSRSHQHVKITYRDGRTGELGYLNPGVFTQSRRWKDHADML  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314  LLEQLFLPYSHFLTQGYNNWTNGLYGYSWDMMVHSRSHQHVKITYRDGRTGELGYLNPGVFTQSRRWKDHADML  387

Query 445  KQYATCLSRLLPKYNVTEPQIYFDIWVSINDRFQQRIFDPRVDIVQAAWSPFQRTSWVQPLLMDLSPWRAKLQE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388  KQYATCLSRLLPKYNVTEPQIYFDIWVSINDRFQQRIFDPRVDIVQAAWSPFQRTSWVQPLLMDLSPWRAKLQE  461

Query 519  IKSSLDNHTEVVFIADFPGLHLENFVSEDLGNTSIQLLQGEVTVELVAEQKNQTLREGEKMQLPAGEYHKVYTT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462  IKSSLDNHTEVVFIADFPGLHLENFVSEDLGNTSIQLLQGEVTVELVAEQKNQTLREGEKMQLPAGEYHKVYTT  535

Query 593  SPSPSCYMYVYVNTTELALEQDLAYLQELKEKVENGSETGPLPPELQPLLEGEVKGGPEPTPLVQTFLRRQQRL  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536  SPSPSCYMYVYVNTTELALEQDLAYLQELKEKVENGSETGPLPPELQPLLEGEVKGGPEPTPLVQTFLRRQQRL  609

Query 667  QEIERRRNTPFHERFFRFLLRKLYVFRRSFLMTCISLRNLILGRPSLEQLAQEVTYANLRPFEAVGELNPSNTD  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610  QEIERRRNTPFHERFFRFLLRKLYVFRRSFLMTCISLRNLILGRPSLEQLAQEVTYANLRPFEAVGELNPSNTD  683

Query 741  SSHSNPPESNPDPVHSEF  758
           ||||||||||||||||||
Sbjct 684  SSHSNPPESNPDPVHSEF  701