Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00632
- Subject:
- NM_019802.5
- Aligned Length:
- 2286
- Identities:
- 1987
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGGCGGTGTCTGC----CGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAAC 70
||||| |.||| |||.|||||.|.|....|.|||..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||
Sbjct 1 ATGGC----TGTGCACCGCGGCTCCGCACTGGTTGCTCCCGCCTCAGATAAAGTACAGAAAAACAAGTCTGCAC 70
Query 71 TGATCTCAGGGCCCAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGG 144
.||..|||||.|..|..||||.|||||||||.|.||||.|.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 71 AGACATCAGGACTGAAACAGGGCAGCCGAATGGAGAAAATTTTAGGGTTTGAATGGACAGATTTATCTAGCTGG 144
Query 145 CGGAGGCTGGTGACCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTT 218
|.|||..|.|||||||||||.||...|||||||||||||||||.|.|.|||||||||||||||||.||||..||
Sbjct 145 CAGAGTGTCGTGACCCTGCTTAACAAACCAACGGACCCTGCAAACCTGGCTGTCTTTCGTTTTCTCTTTGCTTT 218
Query 219 CTTGATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATG 292
|||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 219 CTTGATGCTGCTGGACATTCCCCAGGAACGCGGCCTTAGCTCCCTGGACCGAAAATACTTGGATGGGCTGGATG 292
Query 293 TGTGCCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATG 366
|||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 TGTGCCGTTTCCCCTTGCTGGATGCCTTGCGCCCACTGCCACTGGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATG 366
Query 367 TTTCTGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTG 440
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 367 TTTCTGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGGCTATGCTACCGGCTAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTACCGTACTG 440
Query 441 GTATGTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAA 514
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 441 GTACGTGTTTCTCCTGGACAAGACTTCGTGGAACAATCACTCCTATCTGTATGGTTTGTTGGCCTTTCAGTTGA 514
Query 515 CATTCATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCC 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||..|.||.||||||.|||||||||
Sbjct 515 CATTCATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGATGGCTTGCTGAATGCCCGAAAGAAGAATGCTCACGTGCCC 588
Query 589 CTTTGGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGC 662
|||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 589 CTTTGGAACTACACAGTTCTGCGTGGCCAGATCTTCATCGTGTACTTCATCGCGGGTGTGAAGAAGCTCGATGC 662
Query 663 AGACTGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGT 736
.||||||||||..|||||.||||||||..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 663 TGACTGGGTTGGGGGCTACTCCATGGAGCACCTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAGCTGGTGTTGT 736
Query 737 CTGAGGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTC 810
|.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 737 CGGAGGAGCTGACAAGCCTGCTGGTAGTACACTGGTGTGGGCTTCTCCTTGACCTCTCGGCTGGCTTCCTGCTC 810
Query 811 TTTTTTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAG 884
||.|||||||.|||.|||.||.|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 811 TTCTTTGATGCCTCCAGACCCGTCGGCCTGTTCTTCGTGTCCTACTTTCACTGCATGAACTCGCAGCTCTTCAG 884
Query 885 CATTGGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGG 958
|||.||.|||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||.|||
Sbjct 885 CATCGGGATGTTTCCCTATGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCAGCTGAATGGCCTCGGAAGTTGG 958
Query 959 T-GTCCTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGT 1031
| |.||.| |||||...||||.|||||.|.|||.|||||..|||.||.||.||||.|||.||||.|||||||||
Sbjct 959 TAGCCCGA-TGCCCGAAAAGGCTGCAAGAGCTGCTGCCCACCAAAGCCGCTCCTCGGCCTAGTGCTTCCTGTGT 1031
Query 1032 GTATAAGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGC 1105
||||||||||..||||||||||..|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||...|||||||||||
Sbjct 1032 GTATAAGAGGTCCCGGGGCAAAGCTGGCCCGAAGCCCGGGCTGCGCCACCAGCTGGGAGCCATCTTCACCCTGC 1105
Query 1106 TCTACCTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGG 1179
||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1106 TCTACCTCCTAGAGCAGCTCTTCCTGCCCTATTCCCACTTCCTGACCCAGGGTTACAATAACTGGACAAATGGG 1179
Query 1180 CTGTATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGG 1253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1180 CTGTATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTAAAGATCACCTACCGCGACGG 1253
Query 1254 CCGCACTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACA 1327
||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 CCTCACGGGCGAGCTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTCACACAGAGCCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACA 1327
Query 1328 TGCTGAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTT 1401
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 TGCTGAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCTCCTGCTTCCCAAGTACAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTT 1401
Query 1402 GATATTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGC 1475
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1402 GATATTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGCTTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCTGT 1475
Query 1476 TTGGTCACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTAC 1549
.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||..|.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1476 CTGGTCCCCCTTCCAGCGCACACCTTGGGTGCAGCCACTCTTGATGGATTTATCTCCCTGGAGGACCAAGTTAC 1549
Query 1550 AGGAAATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAG 1623
||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1550 AGGATATTAAGAGCAGTCTGGACAACCACACCGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGGCTTCACTTGGAG 1623
Query 1624 AATTTTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGC 1697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.|||||
Sbjct 1624 AATTTTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGAGAAGTCACCGTGGAATTGGTGGC 1697
Query 1698 AGAACAGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATA 1771
|||||||||.||.||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1698 AGAACAGAAAAATCAGACTCTTCAAGAAGGAGAGAAAATGCAGTTGCCTGCTGGAGAGTACCATAAAGTCTATA 1771
Query 1772 CGACATCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTG 1845
|...||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1772 CTGTATCATCTAGTCCTTCCTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGGTCGCACTGGAGCAAGACCTG 1845
Query 1846 GCATATCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCC 1919
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1846 GCATATCTGCAAGAATTAAAGGAGAAGGTGGAGAACGGAAGTGAAACAGGGCCCCTGCCTCCAGAACTTCAGCC 1919
Query 1920 TCTGTTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAA 1993
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||| |||.|
Sbjct 1920 TCTTTTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTCCAAACTTTTCTCAGACG---ACAGA 1990
Query 1994 G---GCTCCAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAG 2064
| ||||||.||.|||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||..||||||||.||.||||||||
Sbjct 1991 GGAAGCTCCAAGAAATTGAACGCAGGCGAAATAGCCCTTTCCATGAGCGATTTCTCCGCTTCGTGCTGCGAAAG 2064
Query 2065 CTCTATGTCTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCT 2138
|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||||
Sbjct 2065 CTCTACGTCTTTCGACGCAGCTTCCTGATGACTCGAATTTCACTCCGAAACCTGCTATTAGGCCGCCCTTCCCT 2138
Query 2139 GGAGCAGCTGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTG--GAG--AACTGAATCCC 2208
.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||..|||||| ||| ||.|| |.
Sbjct 2139 AGAGCAACTAGCCCAAGAGGTGACATATGCAAACTTGCGACCATTTGAACCAGTTGATGAGTCAAGTG----CT 2208
Query 2209 TCAAACACGGATTCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC 2274
||||||||.|||||||||.| |.|.||..|.|||.||.||.||||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct 2209 TCAAACACAGATTCTTCAAA---TCACCCGTCAGAGCCAGATTCTGAGCATGTTCACTCTGAGTTC 2271