Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00632
• Subject: XM_006506414.3
• Aligned Length: 2282
• Identities: 1668
• Gaps: 403

Alignment

Query    1  ATGGCGGTGTCTGCCGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAACTGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTCAGGGCCCAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGGCGGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCTGGTGACCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTTCTTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTAT  444
                          |||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct    1  --------------ATGATGCTGGGGCTATGCTACCGGCTAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTACCGTACTGGTAC  60

Query  445  GTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATT  518
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||
Sbjct   61  GTGTTTCTCCTGGACAAGACTTCGTGGAACAATCACTCCTATCTGTATGGTTTGTTGGCCTTTCAGTTGACATT  134

Query  519  CATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||..|.||.||||||.|||||||||||||
Sbjct  135  CATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGATGGCTTGCTGAATGCCCGAAAGAAGAATGCTCACGTGCCCCTTT  208

Query  593  GGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGAC  666
            |||||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  209  GGAACTACACAGTTCTGCGTGGCCAGATCTTCATCGTGTACTTCATCGCGGGTGTGAAGAAGCTCGATGCTGAC  282

Query  667  TGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGA  740
            |||||||..|||||.||||||||..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct  283  TGGGTTGGGGGCTACTCCATGGAGCACCTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAGCTGGTGTTGTCGGA  356

Query  741  GGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTT  814
            |||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  357  GGAGCTGACAAGCCTGCTGGTAGTACACTGGTGTGGGCTTCTCCTTGACCTCTCGGCTGGCTTCCTGCTCTTCT  430

Query  815  TTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATT  888
            ||||||.|||.|||.||.|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  431  TTGATGCCTCCAGACCCGTCGGCCTGTTCTTCGTGTCCTACTTTCACTGCATGAACTCGCAGCTCTTCAGCATC  504

Query  889  GGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGT-GT  961
            ||.|||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||.|||| |.
Sbjct  505  GGGATGTTTCCCTATGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCAGCTGAATGGCCTCGGAAGTTGGTAGC  578

Query  962  CCTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTAT  1035
            ||.| |||||...||||.|||||.|.|||.|||||..|||.||.||.||||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct  579  CCGA-TGCCCGAAAAGGCTGCAAGAGCTGCTGCCCACCAAAGCCGCTCCTCGGCCTAGTGCTTCCTGTGTGTAT  651

Query 1036  AAGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTA  1109
            ||||||..||||||||||..|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||...|||||||||||||||
Sbjct  652  AAGAGGTCCCGGGGCAAAGCTGGCCCGAAGCCCGGGCTGCGCCACCAGCTGGGAGCCATCTTCACCCTGCTCTA  725

Query 1110  CCTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGT  1183
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  726  CCTCCTAGAGCAGCTCTTCCTGCCCTATTCCCACTTCCTGACCCAGGGTTACAATAACTGGACAAATGGGCTGT  799

Query 1184  ATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGC  1257
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||.|
Sbjct  800  ATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTAAAGATCACCTACCGCGACGGCCTC  873

Query 1258  ACTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCT  1331
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  874  ACGGGCGAGCTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTCACACAGAGCCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCT  947

Query 1332  GAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATA  1405
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948  GAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCTCCTGCTTCCCAAGTACAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATA  1021

Query 1406  TTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGG  1479
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||
Sbjct 1022  TTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGCTTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCTGTCTGG  1095

Query 1480  TCACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGA  1553
            ||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||..|.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1096  TCCCCCTTCCAGCGCACACCTTGGGTGCAGCCACTCTTGATGGATTTATCTCCCTGGAGGACCAAGTTACAGGA  1169

Query 1554  AATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATT  1627
            .||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1170  TATTAAGAGCAGTCTGGACAACCACACCGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGGCTTCACTTGGAGAATT  1243

Query 1628  TTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAA  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.|||||||||
Sbjct 1244  TTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGAGAAGTCACCGTGGAATTGGTGGCAGAA  1317

Query 1702  CAGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGAC  1775
            |||||.||.||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||...
Sbjct 1318  CAGAAAAATCAGACTCTTCAAGAAGGAGAGAAAATGCAGTTGCCTGCTGGAGAGTACCATAAAGTCTATACTGT  1391

Query 1776  ATCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCAT  1849
            ||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392  ATCATCTAGTCCTTCCTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGGTCGCACTGGAGCAAGACCTGGCAT  1465

Query 1850  ATCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTG  1923
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1466  ATCTGCAAGAATTAAAGGAGAAGGTGGAGAACGGAAGTGAAACAGGGCCCCTGCCTCCAGAACTTCAGCCTCTT  1539

Query 1924  TTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAG---  1994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||   |||.||   
Sbjct 1540  TTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTCCAAACTTTTCTCAGACG---ACAGAGGAA  1610

Query 1995  GCTCCAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCT  2068
            ||||||.||.|||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||..||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1611  GCTCCAAGAAATTGAACGCAGGCGAAATAGCCCTTTCCATGAGCGATTTCTCCGCTTCGTGCTGCGAAAGCTCT  1684

Query 2069  ATGTCTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAG  2142
            |.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1685  ACGTCTTTCGACGCAGCTTCCTGATGACTCGAATTTCACTCCGAAACCTGCTATTAGGCCGCCCTTCCCTAGAG  1758

Query 2143  CAGCTGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTG--GAG--AACTGAATCCCTCAA  2212
            ||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||..||||||  |||  ||.||    |.||||
Sbjct 1759  CAACTAGCCCAAGAGGTGACATATGCAAACTTGCGACCATTTGAACCAGTTGATGAGTCAAGTG----CTTCAA  1828

Query 2213  ACACGGATTCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC  2274
            ||||.|||||||||.|   |.|.||..|.|||.||.||.||||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct 1829  ACACAGATTCTTCAAA---TCACCCGTCAGAGCCAGATTCTGAGCATGTTCACTCTGAGTTC  1887