Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00632
- Subject:
- XM_006506416.3
- Aligned Length:
- 2282
- Identities:
- 1400
- Gaps:
- 703
Alignment
Query 1 ATGGCGGTGTCTGCCGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAACTGAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCAGGGCCCAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGGCGGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGCTGGTGACCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTTCTTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGAC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 TGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGA 740
|||||..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct 1 ------------------ATGGAGCACCTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAGCTGGTGTTGTCGGA 56
Query 741 GGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTT 814
|||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 57 GGAGCTGACAAGCCTGCTGGTAGTACACTGGTGTGGGCTTCTCCTTGACCTCTCGGCTGGCTTCCTGCTCTTCT 130
Query 815 TTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATT 888
||||||.|||.|||.||.|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 131 TTGATGCCTCCAGACCCGTCGGCCTGTTCTTCGTGTCCTACTTTCACTGCATGAACTCGCAGCTCTTCAGCATC 204
Query 889 GGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGT-GT 961
||.|||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||.|||| |.
Sbjct 205 GGGATGTTTCCCTATGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCAGCTGAATGGCCTCGGAAGTTGGTAGC 278
Query 962 CCTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTAT 1035
||.| |||||...||||.|||||.|.|||.|||||..|||.||.||.||||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct 279 CCGA-TGCCCGAAAAGGCTGCAAGAGCTGCTGCCCACCAAAGCCGCTCCTCGGCCTAGTGCTTCCTGTGTGTAT 351
Query 1036 AAGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTA 1109
||||||..||||||||||..|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||...|||||||||||||||
Sbjct 352 AAGAGGTCCCGGGGCAAAGCTGGCCCGAAGCCCGGGCTGCGCCACCAGCTGGGAGCCATCTTCACCCTGCTCTA 425
Query 1110 CCTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGT 1183
||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 426 CCTCCTAGAGCAGCTCTTCCTGCCCTATTCCCACTTCCTGACCCAGGGTTACAATAACTGGACAAATGGGCTGT 499
Query 1184 ATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGC 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||.|
Sbjct 500 ATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTAAAGATCACCTACCGCGACGGCCTC 573
Query 1258 ACTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCT 1331
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 ACGGGCGAGCTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTCACACAGAGCCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCT 647
Query 1332 GAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATA 1405
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 GAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCTCCTGCTTCCCAAGTACAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATA 721
Query 1406 TTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGG 1479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||
Sbjct 722 TTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGCTTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCTGTCTGG 795
Query 1480 TCACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGA 1553
||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||..|.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 796 TCCCCCTTCCAGCGCACACCTTGGGTGCAGCCACTCTTGATGGATTTATCTCCCTGGAGGACCAAGTTACAGGA 869
Query 1554 AATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATT 1627
.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 870 TATTAAGAGCAGTCTGGACAACCACACCGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGGCTTCACTTGGAGAATT 943
Query 1628 TTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAA 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.|||||||||
Sbjct 944 TTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGAGAAGTCACCGTGGAATTGGTGGCAGAA 1017
Query 1702 CAGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGAC 1775
|||||.||.||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||...
Sbjct 1018 CAGAAAAATCAGACTCTTCAAGAAGGAGAGAAAATGCAGTTGCCTGCTGGAGAGTACCATAAAGTCTATACTGT 1091
Query 1776 ATCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCAT 1849
||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 ATCATCTAGTCCTTCCTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGGTCGCACTGGAGCAAGACCTGGCAT 1165
Query 1850 ATCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTG 1923
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1166 ATCTGCAAGAATTAAAGGAGAAGGTGGAGAACGGAAGTGAAACAGGGCCCCTGCCTCCAGAACTTCAGCCTCTT 1239
Query 1924 TTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAG--- 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||| |||.||
Sbjct 1240 TTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTCCAAACTTTTCTCAGACG---ACAGAGGAA 1310
Query 1995 GCTCCAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCT 2068
||||||.||.|||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||..||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1311 GCTCCAAGAAATTGAACGCAGGCGAAATAGCCCTTTCCATGAGCGATTTCTCCGCTTCGTGCTGCGAAAGCTCT 1384
Query 2069 ATGTCTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAG 2142
|.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1385 ACGTCTTTCGACGCAGCTTCCTGATGACTCGAATTTCACTCCGAAACCTGCTATTAGGCCGCCCTTCCCTAGAG 1458
Query 2143 CAGCTGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTG--GAG--AACTGAATCCCTCAA 2212
||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||..|||||| ||| ||.|| |.||||
Sbjct 1459 CAACTAGCCCAAGAGGTGACATATGCAAACTTGCGACCATTTGAACCAGTTGATGAGTCAAGTG----CTTCAA 1528
Query 2213 ACACGGATTCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC 2274
||||.|||||||||.| |.|.||..|.|||.||.||.||||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct 1529 ACACAGATTCTTCAAA---TCACCCGTCAGAGCCAGATTCTGAGCATGTTCACTCTGAGTTC 1587
