Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00632
• Subject: XR_001738703.2
• Aligned Length: 3223
• Identities: 2122
• Gaps: 1101

Alignment

Query    1  -----------------------------------------------------------------ATGGCGGTG  9
                                                                             |||||||||
Sbjct    1  AAATTCTCCTGGCGGCCTCCGTTCAGACGCGGCAGCTGTGACCCACCTGCCTCCTCCGCAGAGCAATGGCGGTG  74

Query   10  TCTGCCGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAACTGATCTCAGGGCC  83
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGCCGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAACTGATCTCAGGGCC  148

Query   84  CAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGGCGGAGGCTGGTGA  157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGGCGGAGGCTGGTGA  222

Query  158  CCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTTCTTGATGGTGCTA  231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTTCTTGATGGTGCTA  296

Query  232  GACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTGCCGCTTCCC  305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTGCCGCTTCCC  370

Query  306  CTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTCTGGGGGCAC  379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTCTGGGGGCAC  444

Query  380  TGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTATGTGTTTCTC  453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTATGTGTTTCTC  518

Query  454  CTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATTCATGGATGC  527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATTCATGGATGC  592

Query  528  AAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTTGGAACTATG  601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTTGGAACTATG  666

Query  602  CAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGACTGGGTTGAA  675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGACTGGGTTGAA  740

Query  676  GGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGAGGAGCTGAC  749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGAGGAGCTGAC  814

Query  750  TAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTTTTGATGTCT  823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTTTTGATGTCT  888

Query  824  CAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATTGGTATGTTC  897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATTGGTATGTTC  962

Query  898  TCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGTGTCCTACTGCCC  971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGTGTCCTACTGCCC  1036

Query  972  CCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTATAAGAGGAGCC  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTATAAGAGGAGCC  1110

Query 1046  GGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTACCTCCTGGAG  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTACCTCCTGGAG  1184

Query 1120  CAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGTATGGCTATTC  1193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGTATGGCTATTC  1258

Query 1194  CTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGCACTGGCGAAC  1267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGCACTGGCGAAC  1332

Query 1268  TGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCTGAAGCAATAT  1341
            |||||||||||||||||||                                                       
Sbjct 1333  TGGGCTACCTTAACCCTGG-------------------------------------------------------  1351

Query 1342  GCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATATTTGGGTCTC  1415
                                                                                      
Sbjct 1352  --------------------------------------------------------------------------  1351

Query 1416  CATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGGTCACCCTTTC  1489
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  -----------------------GGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGGTCACCCTTTC  1402

Query 1490  AGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGAAATCAAGAGC  1563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  AGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGAAATCAAGAGC  1476

Query 1564  AGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATTTTGTGAGTGA  1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  AGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATTTTGTGAGTGA  1550

Query 1638  AGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAACAGAAGAACC  1711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  AGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAACAGAAGAACC  1624

Query 1712  AGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGACATCACCTAGC  1785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  AGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGACATCACCTAGC  1698

Query 1786  CCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCATATCTGCAAGA  1859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  CCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCATATCTGCAAGA  1772

Query 1860  ATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTGTTGGAAGGGG  1933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  ATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTGTTGGAAGGGG  1846

Query 1934  AAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAGGCTCCAGGAGATT  2007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  AAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAGGCTCCAGGAGATT  1920

Query 2008  GAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCTATGTCTTTCGCCG  2081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  GAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCTATGTCTTTCGCCG  1994

Query 2082  CAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAGCAGCTGGCCCAGG  2155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  CAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAGCAGCTGGCCCAGG  2068

Query 2156  AGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTGGAGAACTGAATCCCTCAAACACGGATTCTTCACAT  2229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  AGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTGGAGAACTGAATCCCTCAAACACGGATTCTTCACAT  2142

Query 2230  TCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC-----------------------------  2274
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct 2143  TCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTCTGAAGGGGGCCAGATGTTGGGTGCAGATG  2216

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2217  TAGAAGCAGCCAGTCACAGACCCATTCTATGCAATGGACATTTATTTGAAAAAAATTCTCAAAAGTTTTTTTTT  2290

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2291  TTTTTTTGGGGGGGCGGGGTTCTAAAGCTGTTTTTAACTCCGAGATTACAACTTAGAGGAACCAAGGAAATAAA  2364

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2365  GCAAATAAGATTTAACAACCCAAGATTAAGAGGCCAGGAAGAGGTTAGACGCAATGTGAAACTGTCCTCCTAGG  2438

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2439  ATAAGGTTTAAAGTGGCTTTTTGGGGGCTGGGTGCCGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTG  2512

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2513  AGGTGGGCAGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCTTCTCTACTAAA  2586

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2587  AATACAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCAACTACCCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCG  2660

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2661  CTTGGGCCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGAGCCACTGCACTCCTGGGCAACAGAGCAAGACTT  2734

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2735  CGTCTCAAAATAAATAAATAAAGTGGCTCTTGGGGAAAAGCAATTTAATGTACCACGATGAATAGCTAACTGTT  2808

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2809  CCCAAGTGTTTGCTATGTGCAACACACCGCGTGAGCAGTGTTACCTGCATTATTACATTAGGCTGAGAGGTAAA  2882

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2883  ATAATTTGCCCGAAGACATACAGCTAGTGACGAATGGACTGATGGTTTGAACTTAACGTCTATTTGACTTAAGG  2956

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2957  TCCTGCACCCTGCCACTTGTAATTTTCAGAATCACTGATAATCTGAAATAATGCAGCTTAAAACATGTTTTCTT  3030

Query 2275  -----------------------------------------  2274
                                                     
Sbjct 3031  AATTAAAAGTATAATTGGATGGTGGTCAGGTTGTAAATGCA  3071