Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00683
• Subject: NM_001321090.2
• Aligned Length: 1665
• Identities: 1581
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGCTGCCGGTTCAGGTGTTTAACTTGCAGCAGCCAGCCAGCTCTGTGTCAGGGTCGGGGGGTGCAGAAAG  74

Query    1  ----------ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTC  64
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGGACAGAATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTC  148

Query   65  ACAGCAGTAGGTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGT  138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGCAGTAGGTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGT  222

Query  139  ACGCTGCTCTACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACC  212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACGCTGCTCTACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACC  296

Query  213  TGACGTCAACTACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGC  286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACGTCAACTACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGC  370

Query  287  GCATCGAACGGCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATCGAACGGCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCC  444

Query  361  TTCGTGCAGAGAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCT  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCGTGCAGAGAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCT  518

Query  435  GCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCA  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCA  592

Query  509  CGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAA  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAA  666

Query  583  GAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAA  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAA  740

Query  657  GTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGG  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGG  814

Query  731  TCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCC  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCC  888

Query  805  GAGCAGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGA  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCAGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGA  962

Query  879  GCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTG  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTG  1036

Query  953  AGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTG  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTG  1110

Query 1027  CAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTT  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTT  1184

Query 1101  CAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGACA  1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGACA  1258

Query 1175  TGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCC  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCC  1332

Query 1249  TACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGAC  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGAC  1406

Query 1323  GCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGG  1396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGG  1480

Query 1397  ATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATG  1470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATG  1554

Query 1471  CTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGAC  1544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGAC  1628

Query 1545  TCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1665